New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009273 | = 1635223 | 20 (0.080) | 284 (1.100) | 134/278 | NT | 93.4% | intergenic (‑381/+373) | essQ/cspB | Qin prophage; putative S lysis protein/Qin prophage; cold shock protein |
? | CP009273 | = 1645805 | NA (NA) | intergenic (+11/‑3) | insD1/intQ | IS2 transposase TnpB;IS, phage, Tn; Transposon‑related functions; extrachromosomal; transposon related/pseudogene, Qin prophage; phage integrase family;Phage or Prophage Related |
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AAAAACTCAAAATCACGCCGTAATTATCTCGTTAAATGTTCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTTATATTTTAATAATATATTTAAAGCAGATAATAAAAAACCCGCCTGAGCGGGTTTGAGATTGTGGTGCTTTTTGTGGGAGTCATCCACTTACGCACTTTGTTTTGCCATGCC > CP009273/1635074‑1635371 | cttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCt < 2:3146240‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaaaCTCAAAATCACGCCGTAATTATCTCGTTAAATGTTCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCt > 2:2627774/1‑150 (MQ=255) tgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCt < 1:2888685‑M1/12‑1 (MQ=255) cAAAATCACGCCGTAATTATCTCGTTAAATGTTCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTACAGACAAATCTTAAAGCTtggattt < 1:3191547‑M1/150‑8 (MQ=255) tgtggttcgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcattcatctgttctcctatgactagtcttaattctagttttaagtctatcacttatttaagtgatattgtttgtctggagtttctgggggccagtctaAAGCTGTAGCCtga > 1:201706‑M1/137‑150 (MQ=255) gtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCtgat > 2:2748060‑M1/136‑150 (MQ=255) aTCACGCCGTAATTATCTCGTTAAATGTTCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgccc > 1:2956490‑M1/1‑139 (MQ=255) cACGCCGTAATTATCTCGTTAAATGTTCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccct > 1:3665337‑M1/1‑137 (MQ=255) 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aaTTATCTCGTTAAATGTTCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttcc > 1:3472304‑M1/1‑129 (MQ=255) tgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGt < 1:3999065‑M1/28‑1 (MQ=255) tgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagcctaaaaactagtattaaggctatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGt > 1:2850460‑M1/123‑150 (MQ=255) tATCTCGTTAAATGTTCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccaga > 1:2176337‑M1/1‑126 (MQ=255) tttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACa < 1:1884373‑M1/32‑1 (MQ=255) 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cggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTAtt > 2:2143458‑M1/113‑150 (MQ=255) ttCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 2:897857‑M1/150‑39 (MQ=255) ttCCTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 1:4236195‑M1/150‑39 (MQ=255) taagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTtat > 2:4258383‑M1/107‑150 (MQ=255) aagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTtata < 1:1732113‑M1/45‑1 (MQ=255) aagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTtata > 1:337136‑M1/106‑150 (MQ=255) cTGCCCAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa < 1:2534024‑M1/150‑42 (MQ=255) acatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTTATAttt > 1:2482377‑M1/103‑150 (MQ=255) cAAACTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 1:1454649‑M1/1‑104 (MQ=255) aaaCTGCACCCAAGAGTCAGAACACAGTTTTTCAAGAGTACAAAAAGGTGCCCTTTTGATCTGCCCTCATTGCAACAAAGTATTCCAGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatt > 1:1290089‑M1/1‑103 (MQ=255) 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ttcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTTATATTTTAATAATATATTTAAAGCAGATAATAAAAAACCCGCCTGAGCGGGTTTGAGATTGTGGTGCTTTTTGTGGGAGTCATCCACTTAc > 1:3511252‑M1/18‑150 (MQ=255) tcagggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTTATATTTTAATAATATATTTAAAGCAGATAATAAAAAACCCGCCTGAGCGGGTTTGAGATTGTGGTGCTTTTTGTGGGAGTCATCCACTTACg < 2:1619469‑M1/134‑1 (MQ=255) gggggccagtctaAAGCTGTAGCCTGATTGATTTTATTAGTAACAAGTATTTTTTATATTTTAATAATATATTTAAAGCAGATAATAAAAAACCCGCCTGAGCGGGTTTGAGATTGTGGTGCTTTTTGTGGGAGTCATCCACTTACGCAc > 2:1186959‑M1/14‑150 (MQ=255) aGACAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct > 2:2697982‑M1/1‑17 (MQ=255) aCAAATCTTAAAGCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctct < 2:3473774‑M1/150‑136 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |