| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3744959 = | 241 (0.930) | 221 (0.850) | 108/278 | NT | 46.4% | coding (270/741 nt) | yiaT | putative outer membrane protein |
| ? | CP009273 | = 3752673 | 270 (1.040) | coding (549/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor | |||||
Only 100 of 537 total aligned reads displayed.
CATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCG > CP009273/3752525‑3752822 | cATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAg > 2:1647435‑M2/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTaaa > 1:2083867/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATg < 1:3835668/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATg > 2:1711120/1‑150 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagg > 2:2591016‑M2/1‑144 (MQ=255) gTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtc < 2:506195‑M2/150‑10 (MQ=255) tCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCa < 1:3218178/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCaa > 2:97467/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCGTTTACGGTAAATGCGCGGTcga > 2:4068100/1‑148 (MQ=255) gTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattc < 2:3039790‑M2/150‑16 (MQ=255) gTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATc < 2:3580519/150‑1 (MQ=255) tGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattcca > 1:3216171‑M2/1‑133 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcg < 2:2764845‑M2/150‑21 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAg < 2:240111/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCg < 1:2007835/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCg < 1:294765/150‑1 (MQ=255) tGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatcca > 2:3333208‑M2/1‑123 (MQ=255) gcgcATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAAc > 1:229897/1‑150 (MQ=255) gcgcATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAAc < 1:1495333/150‑1 (MQ=255) cATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTAt > 1:3679405/1‑150 (MQ=255) aTGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATg > 1:1847421/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGtt < 2:1530698/150‑1 (MQ=255) cAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTTAGCCATAGTGAATCGCCTACATTCACTTCCCCGCATAACGCCATACCGGTGACGACCAGCCCGGCACATATTACGGTAggtagggtcaaaaaccagcggcatccaggatgcgg < 2:2280205‑M2/150‑36 (MQ=255) cAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTtg < 1:3171581/150‑1 (MQ=255) aGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggt < 2:3269206‑M2/150‑37 (MQ=255) cGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggct > 2:2227758‑M2/1‑108 (MQ=255) cGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggct > 2:348959‑M2/1‑108 (MQ=255) gTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggcta > 2:868759‑M2/1‑107 (MQ=255) cacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagt > 1:530737‑M2/1‑104 (MQ=255) acGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTTTTTGCGCGGTCAATCGCGAGGCTGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTc < 1:333285/150‑1 (MQ=255) gCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttca < 1:3053380‑M2/150‑50 (MQ=255) gCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTcgc > 1:1651793/1‑150 (MQ=255) aTCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatt > 1:980100‑M2/1‑99 (MQ=255) aTCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGt > 1:374503/1‑150 (MQ=255) tCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattt > 2:3733787‑M2/1‑98 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGACACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTc > 2:4341866/1‑150 (MQ=255) ggTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttt > 1:1001069‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttt < 1:1250441‑M2/150‑55 (MQ=255) gTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttt < 1:2277368‑M2/150‑56 (MQ=255) tttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttttt < 1:2629734‑M2/150‑57 (MQ=255) ttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttc < 1:3645284‑M2/150‑58 (MQ=255) ttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGc > 2:77235/1‑150 (MQ=255) ttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGc > 2:2381308/1‑150 (MQ=255) tatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCa < 2:2509433/150‑1 (MQ=255) tatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCa < 2:706909/150‑1 (MQ=255) ttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactt < 2:1128662‑M2/150‑62 (MQ=255) ttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACt > 2:1008229/1‑150 (MQ=255) taCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTCCCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcacttt < 2:1829475‑M2/150‑63 (MQ=255) taCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTg < 2:409973/150‑1 (MQ=255) taCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTg < 1:3284/150‑1 (MQ=255) cacCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTTACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgc < 1:4473033‑M2/150‑65 (MQ=255) cAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCa < 2:4413574/150‑1 (MQ=255) gTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacag < 2:2989544‑M2/150‑70 (MQ=255) gTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGa < 2:551173/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGAt < 2:1389129/150‑1 (MQ=255) aGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGc > 2:4241193/1‑150 (MQ=255) gCCAGAGTGAATCGCCTACCGTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaata > 2:36394‑M2/1‑77 (MQ=255) ccAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataa > 1:3473440‑M2/1‑76 (MQ=255) ccAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTc > 2:2756624/1‑150 (MQ=255) agagTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTcgc > 2:3172624/1‑150 (MQ=255) agTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCgcgc > 1:309528/1‑150 (MQ=255) gTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCa < 2:1178951/150‑1 (MQ=255) gCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATc > 1:3609228/1‑150 (MQ=255) 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cGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAg < 1:1198317/150‑1 (MQ=255) cGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAg < 2:3665306/150‑1 (MQ=255) gCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCa < 1:77235/150‑1 (MQ=255) gCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCa < 1:2381326/150‑1 (MQ=255) ccTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgcctt > 2:2164212‑M2/1‑12 (MQ=255) 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tAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTccc > 1:47862/1‑150 (MQ=255) aaaTGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCg < 2:46153/150‑1 (MQ=255) | CATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCCCG > CP009273/3752525‑3752822 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |