| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 315,372 | C→A | 9.1% | G114V (GGA→GTA) | rclA ← | reactive chlorine stress species (RCS) resistance protein; pyridine nucleotide‑dependent disulfide oxidoreductase family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 315,372 | 0 | C | A | 9.1% | 746.9 / 36.4 | 208 | G114V (GGA→GTA) | rclA | reactive chlorine stress species (RCS) resistance protein; pyridine nucleotide‑dependent disulfide oxidoreductase family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (84/104); new base A (3/16); total (87/121) | |||||||||||
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Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
AAATACCTAAATGCCCAGGCAATTCTTTTAGATTAAGTAATCCGGTGCTGTCATATACTCCTGGCGTGGTGGTAATTCCAGGAATTGGCGGAACCACGGTTTGTGCACCGGTATTAATAAAAATTTTCTCGCCATGAATTTCCAGATTTCCCTCAGGCCGATGAACACGCAGGCTATGATTATTGATAAACTCCGCCTGGCCGTCGATCACGTCGATATTGGGCATATCCGCAAGATTATGAAAATTCTTATTACGTAAAAAATTAACCACTTCATTTTTACGCTGTATGGCACGGACA > CP009273/315223‑315521 | aaaTACCTAAATGCCCAGGCAATTCTTTTAGATTAAGTAATCCGGTGCTGTCATATACTCCTGGCGTGGTGGTAATTCCAGGAATTGGCGGAACCACGGTTTGTGCACCGGTATTAATAAAAATTTTCTCGCCATGAATTTCCAGATTTc > 2:3786298/1‑150 (MQ=255) aaTACCTAAATGCCCAGGCAATTCTTTTAGATTAAGTAATCCGGTGCTGTCATATACTCCTGGCGTGGTGGTAATTCCAGGAATTGGCGGAACCACGGTTTGTGCACCGGTATTAATAAAAATTTTCTCGCCATGAATTTCCAGATTTcc < 2:4318690/150‑1 (MQ=255) aTACCTAAATGCCCAGGCAATTCTTTTAGATTAAGTAATCCGGTGCTGTCATATACTCCTGGCGTGGTGGTAATTCCAGGAATTGGCGGAACCACGGTTTGTGCACCGGTATTAATAAAAATTTTCTCGCCATGAATTTCCAGATTTccc < 1:319862/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |