| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,681,080 | C→A | 6.7% | R485L (CGG→CTG) | bcsC ← | cellulose synthase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,681,080 | 0 | C | A | 6.7% | 1007.5 / 29.1 | 268 | R485L (CGG→CTG) | bcsC | cellulose synthase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (132/118); new base A (8/10); total (140/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
AAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAGCTTTT > CP009273/3680931‑3681229 | aaGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGcc > 1:2414748/1‑150 (MQ=255) gTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTg < 1:1177268/150‑1 (MQ=255) gTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTg < 1:1177543/150‑1 (MQ=255) gTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTg < 2:2004555/150‑1 (MQ=255) gTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCAGCTg > 2:470096/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGt > 1:3741246/1‑150 (MQ=255) cTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGtgc > 1:1227850/1‑150 (MQ=255) tGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGtgct < 2:2722943/150‑1 (MQ=255) tGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGtgct < 2:2723039/150‑1 (MQ=255) tGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGtgct < 1:3402106/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTgccg < 1:1858347/150‑1 (MQ=255) ggTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCt > 2:3469349/1‑150 (MQ=255) ggTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCt > 2:1196318/1‑150 (MQ=255) ggTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCt < 2:291036/150‑1 (MQ=255) gTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCAGCTGAAGTGCTGCCGCCTg < 1:3479506/150‑1 (MQ=255) gTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTgcgc > 2:4304613/1‑150 (MQ=255) ttCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGcc < 1:2002955/150‑1 (MQ=255) tCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGccc > 2:3343393/1‑150 (MQ=255) gACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCAt < 1:829513/150‑1 (MQ=255) cTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCAttt < 1:1118157/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTg < 1:2277892/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGccc < 2:2361628/150‑1 (MQ=255) tgcGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTgg > 1:875923/1‑150 (MQ=255) tgcGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTgg > 1:1261416/1‑150 (MQ=255) tgcGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCAGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTgg > 2:325245/1‑150 (MQ=255) tgcGCCAGAGTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTgg < 2:1830976/150‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTc < 1:2325457/150‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTc > 1:2029571/1‑150 (MQ=255) cAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTc < 1:3807650/150‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGATGCGTTGTCCGGCCTGCCAGATATCCTGCTAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGACGGGGTCCAGCGCCAGTCGTAGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCACATTTGCCCTGGTTTTc > 1:2065354/1‑150 (MQ=255) aGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTcc > 2:2136139/1‑150 (MQ=255) aGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTcc < 1:1491901/150‑1 (MQ=255) gcATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCct > 1:1659618/1‑150 (MQ=255) cATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCctc < 2:459009/150‑1 (MQ=255) tAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTctgc > 2:573197/1‑150 (MQ=255) gTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTctgcctgc > 2:3323128/1‑150 (MQ=255) gTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCAGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTctgcctgc < 1:1323572/150‑1 (MQ=255) tATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCctgct < 2:1449860/150‑1 (MQ=255) tATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCctgct > 1:1565006/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCctgctg < 2:385704/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCa > 1:3291664/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAg < 1:1551229/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGa > 2:3340792/1‑150 (MQ=255) cTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACgg > 1:1445876/1‑150 (MQ=255) tGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGt > 1:3636403/1‑150 (MQ=255) cGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCg > 1:2332621/1‑150 (MQ=255) gTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGt > 1:2837203/1‑150 (MQ=255) gTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTCTGGCAGACGGTCGt > 2:3676505/1‑150 (MQ=255) gTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCAGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGt > 2:517206/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTg > 1:3849937/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAgg < 2:4455823/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAgg > 2:2010600/1‑150 (MQ=255) ccTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGGAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGc < 2:1352369/150‑1 (MQ=255) tGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTg > 2:279252/1‑150 (MQ=255) tGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTg < 1:2294157/150‑1 (MQ=255) cAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGt > 1:1062711/1‑150 (MQ=255) cAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTGTGCAGGCTGCGt > 2:2051720/1‑150 (MQ=255) gagaTCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTc < 1:1854278/150‑1 (MQ=255) gagaTCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTc < 1:4207409/150‑1 (MQ=255) agaTCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCg > 1:2667109/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGata > 2:678609/1‑150 (MQ=255) cGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATatcatc < 1:468601/150‑1 (MQ=255) cGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATatcatc < 2:2430540/150‑1 (MQ=255) aaaGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCaa > 2:2435994/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATg > 1:2210411/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATg < 1:3070472/150‑1 (MQ=255) cGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTa > 2:1883150/1‑150 (MQ=255) cGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTa > 1:3967734/1‑150 (MQ=255) ggTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTAc > 2:1637729/1‑150 (MQ=255) ggTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTAc < 2:1962732/150‑1 (MQ=255) agtaaTCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTAcgccg > 2:2635419/1‑150 (MQ=255) taaTCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCAGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCt < 1:470101/150‑1 (MQ=255) ccATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACt < 2:1227845/150‑1 (MQ=255) aTACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTgg < 1:3675229/150‑1 (MQ=255) tACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGc > 1:2097837/1‑150 (MQ=255) aCGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCa > 2:3182869/1‑150 (MQ=255) aCGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCa < 1:163307/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTCCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCag > 1:1024766/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCaga > 1:2484726/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCagaga < 2:818633/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCagaga < 2:3098817/150‑1 (MQ=255) ggggTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGa > 2:4150953/1‑150 (MQ=255) ggggTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGa < 1:4070986/150‑1 (MQ=255) ggggTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGa > 1:3861763/1‑150 (MQ=255) ggggTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGa > 1:3861716/1‑150 (MQ=255) gggTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAg < 1:2043855/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGc < 2:4258176/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCg > 2:164260/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCAGTCGTTGCAGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGa < 2:3948011/150‑1 (MQ=255) ccAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACg > 2:897023/1‑150 (MQ=255) cAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGc < 2:595338/150‑1 (MQ=255) cGTTGCAGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTATTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCa > 2:3027126/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAg > 1:742547/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAg > 1:742491/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAg > 1:21710/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAGc > 1:879889/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAGCt > 1:3316567/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAGCt < 1:1355477/150‑1 (MQ=255) ccGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAGCttt < 1:4172876/150‑1 (MQ=255) cGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAGCtttt < 2:3741272/150‑1 (MQ=255) | AAGCGTAAACCTGCTCCGGGTCGTTCGACTTCTGCTGCGCCAGATTGCGCATTAACGTATCGGCCTGGCTGCGTTGTCCGGCCTGCCAGAGATCCTGCGAAAGTCGGTAAGTAATCCATACGCTGCCGGGGTCCAGCGCCAGTCGTTGCCGCTGAAGTGCTGCCGCCTGCGCCCATTTGCCCTGGTTTTCCAGTGCCTCTGCCTGCTGTGCCAGACGGTCGTTTTGCAGGCTGCGTTCGATATCATCAATGCTACGCCGCTGACTGGCAGAGAGCGAGGCGATAAACGCTTCAGCTTTT > CP009273/3680931‑3681229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |