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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,732,978 | 0 | C | T | 6.1% | 1042.2 / 35.0 | 296 | intergenic (+91/‑87) | malS/avtA | alpha‑amylase/valine‑pyruvate aminotransferase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (142/136); new base T (13/5); total (155/141) | |||||||||||
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Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
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aCCGTTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGAt > 2:3493200/1‑150 (MQ=255) gCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGa > 1:1057081/1‑150 (MQ=255) | GCTTTGTTCGTGAGCATGGCGACGATAAAGTGCTGGTCGTCTGGGCAGGGCAACAGTAACTTTTCCGGCTTCCCGTTCGTCAGTACCTCGGGAAGCCGCCAACCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGA > CP009273/3732829‑3733126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |