Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,846,427 | G→T | 6.1% | intergenic (‑79/+51) | ivbL ← / ← istR | ilvB operon leader peptide/sRNA antisense regulators IstR‑1 and IstR‑2, affectr tisB, Hfq‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,846,427 | 0 | G | T | 6.1% | 1001.5 / 24.8 | 268 | intergenic (‑79/+51) | ivbL/istR | ilvB operon leader peptide/sRNA antisense regulators IstR‑1 and IstR‑2, affectr tisB, Hfq‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (137/113); new base T (13/5); total (150/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
ACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTCCGCG > CP009273/3846280‑3846575 | gcacgACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAg > 1:4116057/1‑150 (MQ=255) cacgACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAgg < 1:1934732/150‑1 (MQ=255) acgacgACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAggg < 2:2681003/150‑1 (MQ=255) gacgacCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGaa > 1:2997148/1‑150 (MQ=255) acCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAAtt < 2:1577605/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAggg < 1:3120271/150‑1 (MQ=255) cggATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGa < 1:1431759/150‑1 (MQ=255) ggATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGAt > 2:1566291/1‑150 (MQ=255) ggATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGAt > 2:2765956/1‑150 (MQ=255) gATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCATCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATc > 1:2634996/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCa < 1:4000889/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCAc < 2:1747251/150‑1 (MQ=255) cAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGtttt < 1:2581434/150‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCATCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTg < 2:1012033/150‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTg < 2:297471/150‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTg < 2:298214/150‑1 (MQ=255) gTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGt > 1:2173346/1‑150 (MQ=255) tGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTAc > 1:4333481/1‑150 (MQ=255) agtagtTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGaa > 1:2904104/1‑150 (MQ=255) gtagtTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAAt < 1:587357/150‑1 (MQ=255) tagtTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCATCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAAtt < 1:921137/150‑1 (MQ=255) gtTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGc < 1:515533/150‑1 (MQ=255) gtTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGc < 1:623419/150‑1 (MQ=255) cGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATaa < 2:3947814/150‑1 (MQ=255) gTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTAGAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAAc > 1:1802488/1‑150 (MQ=255) aGCATGGAAGTAGTCATTGGGAACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTGTACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACaaaa > 1:4450669/1‑150 (MQ=255) gCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACaaaaa > 1:809162/1‑150 (MQ=255) gCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACaaaaa < 1:1138260/150‑1 (MQ=255) aTGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCATCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAAc > 2:521623/1‑150 (MQ=255) aTGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAAc < 2:3457649/150‑1 (MQ=255) tGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAAcc > 2:1861141/1‑150 (MQ=255) ggAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAAccc < 2:720266/150‑1 (MQ=255) ggAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAAccc < 2:1664911/150‑1 (MQ=255) aaGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCccg < 2:640400/150‑1 (MQ=255) aaGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCccg < 2:4435768/150‑1 (MQ=255) agtagtCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCccgc > 2:3440591/1‑150 (MQ=255) agtagtCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCccgc > 2:3440556/1‑150 (MQ=255) gtagtCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCccgcc > 1:4222236/1‑150 (MQ=255) gtagtCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCccgcc > 2:3471851/1‑150 (MQ=255) agtCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCgg > 2:1204913/1‑150 (MQ=255) gtCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTTAATTGAAGATAACAAAAAACCCCGCCGGa > 1:2753948/1‑150 (MQ=255) gtCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGa > 2:1385740/1‑150 (MQ=255) tCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAg > 2:1579787/1‑150 (MQ=255) tCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAg > 2:2484/1‑150 (MQ=255) tCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAg > 1:2510930/1‑150 (MQ=255) cATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGc < 1:3739041/150‑1 (MQ=255) aTTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCg > 2:3095241/1‑150 (MQ=255) ttGGGGCCCTTGTTGGTTTTGTGTTTACCAATATGTCTACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAACTTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGa < 2:3338733/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCg < 2:352570/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCg < 2:1974242/150‑1 (MQ=255) tgttgGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCa > 2:4354102/1‑150 (MQ=255) tgttgGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCa > 2:182798/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCg > 1:4498809/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCg > 2:2435777/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCg < 2:3180901/150‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCg < 2:2788775/150‑1 (MQ=255) tttAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCt < 1:1697595/150‑1 (MQ=255) tttAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCt > 1:2209501/1‑150 (MQ=255) ttAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTg > 1:1525040/1‑150 (MQ=255) aaCAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGt > 1:3504787/1‑150 (MQ=255) aCAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTa > 2:1922324/1‑150 (MQ=255) cAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTaa > 1:437649/1‑150 (MQ=255) atatTTACACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACATTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAAcc < 2:2475821/150‑1 (MQ=255) aGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCacac < 1:3798873/150‑1 (MQ=255) aGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCacac > 1:3756958/1‑150 (MQ=255) cTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGtatta > 2:4469216/1‑150 (MQ=255) cTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGtatta > 2:1441554/1‑150 (MQ=255) tttACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGtattat < 1:2294879/150‑1 (MQ=255) tttACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGtattat < 1:4529819/150‑1 (MQ=255) tttACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGtattat > 1:2128694/1‑150 (MQ=255) tttACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGtattat < 2:1313224/150‑1 (MQ=255) ttACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATg > 1:1807482/1‑150 (MQ=255) tACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGt < 2:3780063/150‑1 (MQ=255) aCAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTc > 2:935100/1‑150 (MQ=255) cAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCa < 1:399229/150‑1 (MQ=255) cAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCa < 1:289418/150‑1 (MQ=255) aGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCATCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGGAGTATGTCaa > 2:2574637/1‑150 (MQ=255) ggAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATAGCATTTCACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAacac < 1:2936489/150‑1 (MQ=255) gagaCAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACt < 1:2880723/150‑1 (MQ=255) agaCAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTg > 2:603974/1‑150 (MQ=255) agaCAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTg > 2:1652254/1‑150 (MQ=255) tGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGta < 2:1138797/150‑1 (MQ=255) ggAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGtat > 2:2176213/1‑150 (MQ=255) ggAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGtat > 1:2380249/1‑150 (MQ=255) ggAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGtat > 1:1066291/1‑150 (MQ=255) gAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGtata < 2:1248509/150‑1 (MQ=255) gAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGtata < 1:241443/150‑1 (MQ=255) tataTTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCTCGTTTTGTACTGATTTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCTTCAGTCTCCTGCGTCTTGTAACCGCTAAGCACAATGTATTATGTCAACACTGAAAGTATAc < 2:2632563/147‑1 (MQ=255) aaaaTTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATAc > 2:3994217/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATAc < 1:1385740/150‑1 (MQ=255) aTTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACgtg > 1:4492667/1‑150 (MQ=255) aTTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACgtg > 1:3349145/1‑150 (MQ=255) aTTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACgtg > 1:3581109/1‑150 (MQ=255) tttCATCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTc > 1:654448/1‑150 (MQ=255) tttCATCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTc > 1:246772/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTcc > 2:321301/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTcc < 1:4168254/150‑1 (MQ=255) ttCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTcc > 2:2263191/1‑150 (MQ=255) tCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTCcg < 1:3815949/150‑1 (MQ=255) tCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTCcg > 1:3616365/1‑150 (MQ=255) | ACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTTGCGTTGAGCATGGAAGTAGTCATTGGGGACCTTGTTGGTTTTGTGTTTAACAATATTTATACAAGCACAGCTTTACAGGGGAGACAATGGAAAATTTTTCAGCAAGGGAAAATTGAGGGGTTGATCACGTTTTGTACTGAATTGCAGATAACAAAAAACCCCGCCGGAGCGAGGTTTCGTCAGTCGCCTGCGGCTGGTAACCGCAAAGCACACTGTATTATGTCAACACTGAAAGTATACGTGTTCCGCG > CP009273/3846280‑3846575 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |