Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,916,830 | 0 | C | A | 89.9% | 784.5 / 78.3 | 286 | D71Y (GAT→TAT) | rsmG | 16S rRNA m(7)G527 methyltransferase, SAM‑dependent; glucose‑inhibited cell‑division protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (12/17); new base A (117/139); total (129/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CTGGTTCAATATTCTCCAGTTTAAGCTCATGTTGCACCTGACGAAGGAAACGCACGCGTTTACCAAGGCTATCCAACAGAGTGAAATGGGCTTCAGGACGCACGATAGAGAGTGGAATGCCTGGCAGTCCTGGTCCGGTGCCGACATCGATAAACCGTTCACCTTGCAGATACGGTGCCACCACAATGCTATCGAGAATATGGCGTACCAGCATCTCATTAGGATCGCGGACCGAAGTCAGGTTGTACGCTTTGTTCCATTTATGCAGCATATTCACGTAGGCAATAAGCTGGT > CP009273/3916683‑3916976 | cTGGTTCAATATTCTCCAGTTTAAGCTCATGTTGCACCTGACGAAGGAAACGCACGCGTTTACCAAGGCTATCCAACAGAGTGAAATGGGCTTCAGGACGCACGATAGAGAGTGGAATGCCTGGCAGTCCTGGTCCGGTGCCGACATAGa < 2:1975583/150‑1 (MQ=255) ttCAATATTCTCCAGTTTAAGCTCATGTTGCACCTGACGAAGGAAACGCACGCGTTTACCAAGGCTATCCAACAGAGTGAAATGGGCTTCAGGACGCACGATAGAGAGTGGAATGCCTGGCAGTCCTGGTCCGGTGCCGACATAGATaaa > 2:458381/1‑150 (MQ=255) cAATATTCTCCAGTTTAAGCTCATGTTGCACCTGACGAAGGAAACGCACGCGTTTACCAAGGCTATCCAACAGAGTGAAATGGGCTTCAGGACGCACGATAGAGAGTGGAATGCCTGGCAGTCCTGGTCCGGTGCCGACATAGATAAAcc < 2:2502479/150‑1 (MQ=255) 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gACATAGATAAACCGTTCACCTTGCAGATACGGTGCCACCACAATGCTATCGAGAATATGGCGTACCAGCATCTCATTAGGATCGCGGACCGAAGTCAGGTTGTACGCTTTGTTCCATTTATGCAGCATATTCACGTAGGCAATAAGCTg > 1:1565892/1‑150 (MQ=255) aCATAGATAAACCGTTCACCTTGCAGATACGGTGCCACCACAATGCTATCGAGAATATGGCGTACCAGCATCTCATTAGGATCGCGGACCGAAGTCAGGTTGTACGCTTTGTTCCATTTATGCAGCATATTCACGTAGGCAATAAGCTgg > 2:3524612/1‑150 (MQ=255) | CTGGTTCAATATTCTCCAGTTTAAGCTCATGTTGCACCTGACGAAGGAAACGCACGCGTTTACCAAGGCTATCCAACAGAGTGAAATGGGCTTCAGGACGCACGATAGAGAGTGGAATGCCTGGCAGTCCTGGTCCGGTGCCGACATCGATAAACCGTTCACCTTGCAGATACGGTGCCACCACAATGCTATCGAGAATATGGCGTACCAGCATCTCATTAGGATCGCGGACCGAAGTCAGGTTGTACGCTTTGTTCCATTTATGCAGCATATTCACGTAGGCAATAAGCTGGT > CP009273/3916683‑3916976 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |