| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,001,030 | G→T | 32.1% | V603F (GTT→TTT) | recQ → | ATP‑dependent DNA helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,001,030 | 0 | G | T | 32.1% | 367.0 / 168.1 | 206 | V603F (GTT→TTT) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/71); new base T (20/46); total (88/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.54e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTCCC > CP009273/4000881‑4001179 | cgccgTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATg > 1:3993103/1‑150 (MQ=255) gTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGa > 2:4419095/1‑150 (MQ=255) gtggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGc > 2:1313655/1‑150 (MQ=255) gtggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGc < 2:2556369/150‑1 (MQ=255) gtgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGAt > 1:1944059/1‑150 (MQ=255) gtgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGAGGGCGAt < 1:612801/150‑1 (MQ=255) tgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg < 2:2228195/150‑1 (MQ=255) tgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg < 2:2228243/150‑1 (MQ=255) tgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTAGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg > 2:4525972/1‑150 (MQ=255) gtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGa > 2:562525/1‑150 (MQ=255) tttAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAc > 2:1919488/1‑150 (MQ=255) tAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGa > 2:2041526/1‑150 (MQ=255) tAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGa > 1:3893237/1‑150 (MQ=255) cgacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAaga < 1:1021424/150‑1 (MQ=255) acgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagt > 2:3295771/1‑150 (MQ=255) gCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagtag > 1:1307922/1‑150 (MQ=255) aCCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTca < 2:2690403/150‑1 (MQ=255) cTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagc > 1:4273208/1‑150 (MQ=255) attgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAgcagca < 1:2464414/150‑1 (MQ=255) agaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATaaa < 1:332682/150‑1 (MQ=255) tGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATaaaaaa > 2:4344951/1‑150 (MQ=255) ggCTGAACAGAAGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAg < 1:2272127/150‑1 (MQ=255) tGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGc < 2:2754908/150‑1 (MQ=255) aGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTa > 1:2394698/1‑150 (MQ=255) gATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTAt > 2:322900/1‑150 (MQ=255) gATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTAt < 1:2116013/150‑1 (MQ=255) gATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTAt > 2:318796/1‑150 (MQ=255) aTGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATg < 2:2363499/150‑1 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGaa < 2:1948396/150‑1 (MQ=255) cGATCACCTCCATCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 2:293002/150‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 2:2353954/150‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa > 2:4394098/1‑150 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa > 2:4394187/1‑150 (MQ=255) cACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTcc > 1:3895729/1‑150 (MQ=255) ccAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTaaa > 2:2383432/1‑150 (MQ=255) ccAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTaaa < 2:1453845/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAAc < 2:4342654/150‑1 (MQ=255) cGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGtt > 1:98795/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTAt > 1:2335749/1‑131 (MQ=255) gAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGttt > 1:4430426/1‑150 (MQ=255) gCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTccccc < 1:1660863/150‑1 (MQ=255) gCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTccccc < 2:251638/150‑1 (MQ=255) cTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 2:3255866/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcgc > 2:760856/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcgcg < 1:1382288/150‑1 (MQ=255) aGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGa > 2:3718177/1‑150 (MQ=255) aGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGa < 2:2551154/150‑1 (MQ=255) gTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTc > 2:1862523/1‑150 (MQ=255) tAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCaa > 2:4021233/1‑150 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAat < 1:3500945/150‑1 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAat < 2:2400684/150‑1 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGTCGCTGATTCGTGCGCATGTTTATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtatg > 1:4009348/1‑150 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtatg < 2:2618397/150‑1 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtatg > 1:2957551/1‑150 (MQ=255) ttGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtatgt < 1:4257782/150‑1 (MQ=255) gggATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTg > 1:2403419/1‑150 (MQ=255) gATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGAt > 1:4241270/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGtt < 1:753899/150‑1 (MQ=255) cgcAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTa < 2:1795899/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTAtt > 1:2613793/1‑150 (MQ=255) aaGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTAttt < 2:3174395/150‑1 (MQ=255) aaGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTAttt > 1:3354113/1‑150 (MQ=255) aGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTtc < 1:4492917/150‑1 (MQ=255) tGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAATTGTATGTTGATGTTATTTCTCa > 2:3177639/1‑150 (MQ=255) tGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCa < 2:3063215/150‑1 (MQ=255) ggAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCAc > 2:2866363/1‑150 (MQ=255) gAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCAcc < 2:1465363/150‑1 (MQ=255) cGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCATCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCTTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTc < 1:3692885/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGAGGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:1239168/150‑1 (MQ=255) ttGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCa < 1:2671427/150‑1 (MQ=255) cAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt < 2:3818922/150‑1 (MQ=255) cAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt > 1:3668581/1‑150 (MQ=255) aaaCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTg < 2:2210094/150‑1 (MQ=255) aaCCGTTTATGGCGCTGTTTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGc < 2:1916804/150‑1 (MQ=255) aaCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGc > 2:2838606/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGc < 2:4504854/150‑1 (MQ=255) aaCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGc > 2:3700988/1‑150 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGca < 2:234898/150‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGca > 2:3507221/1‑150 (MQ=255) cGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGcaca < 2:374656/150‑1 (MQ=255) gTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACAt > 2:2254238/1‑150 (MQ=255) tttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACAtt > 1:2994548/1‑150 (MQ=255) ttATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtg < 2:1634753/150‑1 (MQ=255) ttATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtg < 2:3216632/150‑1 (MQ=255) ttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtg < 1:1086378/150‑1 (MQ=255) tATGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtgt > 2:3353605/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGATTCGTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTgg < 2:1755399/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAGTCGTTCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcg < 2:3678069/150‑1 (MQ=255) tGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTa < 1:2866363/150‑1 (MQ=255) ttCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGa < 1:3549824/150‑1 (MQ=255) ttCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGa < 2:2064398/150‑1 (MQ=255) gTGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGcc > 2:1626518/1‑150 (MQ=255) tGCGCATTTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGccc > 1:1511735/1‑150 (MQ=255) gcgcATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGcccc < 1:1380037/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGcccc < 2:532265/150‑1 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTc < 2:1254948/150‑1 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTc < 2:1254975/150‑1 (MQ=255) gTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc < 1:3195983/150‑1 (MQ=255) gTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc < 2:4178769/150‑1 (MQ=255) gTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc < 2:4178784/150‑1 (MQ=255) | CGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTCCC > CP009273/4000881‑4001179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |