Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,096,555 | G→T | 6.1% | S53S (TCG→TCT) | fieF → | ferrous iron and zinc transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,096,555 | 0 | G | T | 6.1% | 1078.5 / 26.8 | 286 | S53S (TCG→TCT) | fieF | ferrous iron and zinc transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (129/139); new base T (6/12); total (135/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
CTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTC > CP009273/4096407‑4096703 | ttATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGtt < 2:3369785/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGTCCGTCGGGAGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCATCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCTGCGAGTCGTTGACTAAt > 2:3577788/1‑150 (MQ=255) ggCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAAtt < 2:2408518/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGAGCTGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAAtt > 2:936157/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAAttt > 1:3157953/1‑150 (MQ=255) gTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATtg < 2:726440/150‑1 (MQ=255) tCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATtgg < 1:229172/150‑1 (MQ=255) aGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATtggtg > 2:782506/1‑150 (MQ=255) aGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATtggtg > 2:2894533/1‑150 (MQ=255) aGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATtggtg > 2:847811/1‑150 (MQ=255) gggCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGc < 1:267395/150‑1 (MQ=255) gcgATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGatat < 2:655319/150‑1 (MQ=255) cgATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATAtt < 1:1513434/150‑1 (MQ=255) gATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTc > 2:3363181/1‑150 (MQ=255) gATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTc > 1:3362937/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTcc < 1:1581490/150‑1 (MQ=255) tgctgcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATCTTCCCt > 2:4090144/1‑150 (MQ=255) tgctgcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCt > 2:2957824/1‑150 (MQ=255) tgctgcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCt < 1:2938541/150‑1 (MQ=255) ctgcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGc < 1:512101/150‑1 (MQ=255) gcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCaa < 2:1518671/150‑1 (MQ=255) aCGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCt > 2:3603217/1‑150 (MQ=255) cGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTg < 2:1817041/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGc > 1:1229760/1‑150 (MQ=255) ggCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGc > 2:1185379/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcgac < 1:2247916/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcgac > 1:4400392/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcgacga < 2:2107551/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGAt < 2:594791/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGAt > 1:2065227/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATa < 1:2034663/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAAt < 2:3046326/150‑1 (MQ=255) gctgctATTGCCGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCa < 1:3241082/150‑1 (MQ=255) gctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTCTTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTc > 2:2576252/1‑150 (MQ=255) ctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCTGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCTATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCg > 1:4197686/1‑150 (MQ=255) tATTGCTGCTTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGTGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGt < 1:194414/150‑1 (MQ=255) tATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGt > 1:3770222/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGtt > 1:1851999/1‑150 (MQ=255) ttGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGttt < 1:578125/150‑1 (MQ=255) gCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTgg > 2:1367410/1‑150 (MQ=255) cTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGt > 1:328732/1‑150 (MQ=255) tGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTc > 2:1236062/1‑150 (MQ=255) tGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTc > 2:2323799/1‑150 (MQ=255) gATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCa < 2:4464956/150‑1 (MQ=255) aTTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCAc > 2:476092/1‑150 (MQ=255) aTTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCAc > 1:1987165/1‑150 (MQ=255) aaaTTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTa < 1:3546124/150‑1 (MQ=255) ttttGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGc > 1:3027013/1‑150 (MQ=255) ttttGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGc > 1:2617047/1‑150 (MQ=255) tttGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCt < 2:3639836/150‑1 (MQ=255) tttGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATAGTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCt < 2:365818/150‑1 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa > 1:3975270/1‑150 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa > 1:3974081/1‑150 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa > 1:2209708/1‑150 (MQ=255) gCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAg < 1:1347015/150‑1 (MQ=255) cATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGt > 1:1570341/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTc > 1:2098175/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTc > 1:4123851/1‑150 (MQ=255) 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ggtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTcg < 2:3138754/150‑1 (MQ=255) ggtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTcg < 2:3138702/150‑1 (MQ=255) gtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTcgc < 2:1269342/150‑1 (MQ=255) gtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTcgc < 2:1269281/150‑1 (MQ=255) gtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTcgc < 2:3734935/150‑1 (MQ=255) 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cgcTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTTCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCg > 2:2802189/1‑150 (MQ=255) gcTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCgg < 2:2555744/150‑1 (MQ=255) ggtggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTc < 1:4322244/150‑1 (MQ=255) gtggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCg > 2:2981032/1‑150 (MQ=255) tggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCgg > 1:1100410/1‑150 (MQ=255) ggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGc < 2:224791/150‑1 (MQ=255) gATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCa > 1:1051338/1‑150 (MQ=255) gATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCAGCa < 2:4222756/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTAtt < 2:1854626/150‑1 (MQ=255) tggtggATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTcc > 1:340927/1‑150 (MQ=255) tggATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGt < 1:3949422/150‑1 (MQ=255) tggATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGt < 1:932161/150‑1 (MQ=255) gATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGttt > 1:635921/1‑150 (MQ=255) atatCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGtttt < 1:1100184/150‑1 (MQ=255) atCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCATGTTTTTg > 2:3016179/1‑150 (MQ=255) ggCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACg > 1:580427/1‑150 (MQ=255) ggCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACg < 1:1236062/150‑1 (MQ=255) ggCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTAGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACg < 1:3459175/150‑1 (MQ=255) cgcgTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACggg < 1:3042440/150‑1 (MQ=255) tcgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTAtt < 2:707499/150‑1 (MQ=255) cgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTc < 2:3891355/150‑1 (MQ=255) cgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTc > 2:1944554/1‑150 (MQ=255) | CTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTC > CP009273/4096407‑4096703 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |