Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,167,908 | T→A | 7.5% | W80R (TGG→AGG) | nusG → | transcription termination factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,167,908 | 0 | T | A | 7.5% | 964.0 / 52.1 | 292 | W80R (TGG→AGG) | nusG | transcription termination factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (143/127); new base A (7/15); total (150/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.51e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 |
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
TCAAATTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACGCTGTTT > CP009273/4167759‑4168054 | cAAATTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTg < 1:4183210/150‑1 (MQ=255) cAAATTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTg > 1:3325760/1‑150 (MQ=255) cAAATTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTg < 1:3289149/150‑1 (MQ=255) cAAATTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTg > 1:1613527/1‑150 (MQ=255) aaaTTACACAACCTGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTgg < 2:4091817/150‑1 (MQ=255) aaaTTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTgg < 2:3954226/150‑1 (MQ=255) aaaTTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTgg < 2:3954189/150‑1 (MQ=255) aaTTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGc > 2:2691063/1‑150 (MQ=255) aTTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCa < 2:710996/150‑1 (MQ=255) aTTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCa < 2:362568/150‑1 (MQ=255) acacAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCt < 1:2095206/150‑1 (MQ=255) acacAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCt < 1:31252/150‑1 (MQ=255) acacAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCt > 2:1437029/1‑150 (MQ=255) cacaACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTg < 1:1027458/150‑1 (MQ=255) acaacaTGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTgg < 2:3015076/150‑1 (MQ=255) acaacaTGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTgg > 2:3752836/1‑150 (MQ=255) aacaTGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTg < 1:1491129/150‑1 (MQ=255) acaTGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGCCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTgc > 2:2346613/1‑150 (MQ=255) aTGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTgcgc > 2:1825368/1‑150 (MQ=255) tGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCa < 1:951493/150‑1 (MQ=255) gAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGc > 1:881815/1‑150 (MQ=255) gAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGc > 1:1046522/1‑150 (MQ=255) aaGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCg > 1:1939863/1‑150 (MQ=255) aaGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCg > 1:1940012/1‑150 (MQ=255) aGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGt > 1:523375/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTAc > 1:3928146/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTGGTGCGCAGCGTAc < 1:2366332/150‑1 (MQ=255) ttgtttgGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACcg < 1:2623722/150‑1 (MQ=255) tttgGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCgt > 2:3367294/1‑150 (MQ=255) tttgGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCgt > 2:3367526/1‑150 (MQ=255) tttgGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCgt < 2:823832/150‑1 (MQ=255) ttgGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCgtg < 2:2582094/150‑1 (MQ=255) tgGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCgtgt > 2:113736/1‑150 (MQ=255) ggTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGtgtg < 1:1212325/150‑1 (MQ=255) gTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGa > 2:435551/1‑150 (MQ=255) gTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGa > 1:1037618/1‑150 (MQ=255) gTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGa > 2:3481924/1‑150 (MQ=255) gAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATg < 2:4525046/150‑1 (MQ=255) gAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATg > 2:2421329/1‑150 (MQ=255) cATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCtt < 2:2332258/150‑1 (MQ=255) tGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCa < 1:1215843/150‑1 (MQ=255) ggTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCAt < 1:2245023/150‑1 (MQ=255) aCCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATcgg > 1:1216679/1‑150 (MQ=255) aaCCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATcggcgg < 2:2515323/150‑1 (MQ=255) aaCCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATcggcgg < 1:1755000/150‑1 (MQ=255) aCCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGt > 1:1090466/1‑150 (MQ=255) gaagaaGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACt > 1:2473649/1‑150 (MQ=255) agTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGa > 2:1268984/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGAt > 2:1249932/1‑150 (MQ=255) tGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATc < 1:4423430/150‑1 (MQ=255) tGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATc < 1:3989667/150‑1 (MQ=255) ttGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTc < 2:884546/150‑1 (MQ=255) gAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCt > 2:3529465/1‑150 (MQ=255) aTCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTgcg > 1:2187134/1‑150 (MQ=255) gTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCaa < 1:1359117/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTCAGCGTCGCAATAGCGATCGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGGTCAGATGGTGATGAAAGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAAt < 2:1677110/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAAt < 1:1501140/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCGTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAAt < 2:2181250/150‑1 (MQ=255) gCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCa < 2:4322308/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGAt < 1:708819/150‑1 (MQ=255) aGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATa < 1:3232367/150‑1 (MQ=255) aGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATa > 2:1184826/1‑150 (MQ=255) gCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATaa < 1:4107723/150‑1 (MQ=255) cGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATaaa < 2:1412860/150‑1 (MQ=255) cGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATaaa < 2:2063861/150‑1 (MQ=255) gTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAaag > 1:4259527/1‑150 (MQ=255) gTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAaag > 1:2012388/1‑150 (MQ=255) gCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAaagaag > 1:3575066/1‑150 (MQ=255) cAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGt < 1:771615/150‑1 (MQ=255) cAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGt > 1:443383/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTc < 2:3599034/150‑1 (MQ=255) aGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGAt < 2:4175431/150‑1 (MQ=255) gCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCAGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATg < 2:1637836/150‑1 (MQ=255) cGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGc > 1:754239/1‑150 (MQ=255) gAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCg > 1:124292/1‑150 (MQ=255) gAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCg > 1:2912717/1‑150 (MQ=255) cGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGAtt > 2:2344473/1‑150 (MQ=255) cGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGAtt > 2:2293/1‑150 (MQ=255) aaTTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGa > 1:1885402/1‑150 (MQ=255) aTTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCGCCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGaa > 1:2849004/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTg > 2:521897/1‑150 (MQ=255) tGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTgca < 1:2489803/150‑1 (MQ=255) cTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGGGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGAGTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGt > 2:3258018/1‑150 (MQ=255) tCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTg < 2:1095147/150‑1 (MQ=255) gTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGAt > 2:4229411/1‑150 (MQ=255) ttCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATa < 2:3324416/150‑1 (MQ=255) cAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAg < 1:51080/150‑1 (MQ=255) gATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCTCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGcc < 2:3453469/150‑1 (MQ=255) gatgaACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTcc < 1:2237171/150‑1 (MQ=255) gatgaACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGCGATAAGCCGCGTcc < 1:417993/150‑1 (MQ=255) tgaACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGa > 2:1496432/1‑150 (MQ=255) gaACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGaa > 1:61411/1‑150 (MQ=255) aaCGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGaaa > 1:1880500/1‑150 (MQ=255) cgacgCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGAGGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCAGCGCCAATCAGCGTTAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAAc > 1:3689599/1‑150 (MQ=255) gacgCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCCGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACg > 2:3806412/1‑150 (MQ=255) gacgCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACg > 2:3806188/1‑150 (MQ=255) gacgCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACg > 2:4456834/1‑150 (MQ=255) gacgCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACg > 2:1160686/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACGCTg < 2:1994982/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAATAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACGCTGtt < 1:947275/150‑1 (MQ=255) | TCAAATTACACAACATGGAAGATTTGTTTGGTGAAGTCATGGTACCAACCGAAGAAGTGGTTGAAATCCGTGGCGGTCAGCGTCGCAAAAGCGAACGTAAATTCTTCCCTGGCTACGTCCTCGTTCAGATGGTGATGAACGACGCGAGCTGGCACCTGGTGCGCAGCGTACCGCGTGTGATGGGCTTCATCGGCGGTACTTCCGATCGTCCTGCGCCAATCAGCGATAAAGAAGTCGATGCGATTATGAACCGCCTGCAGCAGGTTGGTGATAAGCCGCGTCCGAAAACGCTGTTT > CP009273/4167759‑4168054 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |