| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,222,149 | G→T | 10.9% | S338* (TCG→TAG) | lysC ← | lysine‑sensitive aspartokinase 3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,222,149 | 0 | G | T | 10.9% | 921.7 / 59.5 | 265 | S338* (TCG→TAG) | lysC | lysine‑sensitive aspartokinase 3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (115/121); new base T (11/18); total (126/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
CGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTATTGCACACC > CP009273/4222001‑4222298 | cgcCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGa > 2:1109548/1‑150 (MQ=255) gcCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGaa > 2:190907/1‑150 (MQ=255) gACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAatat < 1:3647147/150‑1 (MQ=255) gACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAatat > 1:3436502/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAAtatta < 1:4227754/150‑1 (MQ=255) ccTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAAtatta > 1:321854/1‑150 (MQ=255) cttcttCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAAtattat < 1:3879174/150‑1 (MQ=255) ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATg < 1:104985/150‑1 (MQ=255) ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATg < 1:104992/150‑1 (MQ=255) tcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGc < 2:2557565/150‑1 (MQ=255) tcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGc > 2:198582/1‑150 (MQ=255) cctccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGa < 1:3738803/150‑1 (MQ=255) ctccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAg > 2:37060/1‑150 (MQ=255) ctccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAg < 1:2725309/150‑1 (MQ=255) ctccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAg > 1:3153520/1‑150 (MQ=255) tccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGACCCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAgg > 2:4329425/1‑150 (MQ=255) tccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAgg > 2:4347/1‑150 (MQ=255) caccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGAt < 2:623472/150‑1 (MQ=255) caccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGAt > 1:3046032/1‑150 (MQ=255) accCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATg > 2:2785730/1‑150 (MQ=255) ccGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGcc < 2:1310922/150‑1 (MQ=255) acacAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGaa > 1:3372021/1‑150 (MQ=255) cacaGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGaaa > 1:2286105/1‑150 (MQ=255) caGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAAc < 2:2874425/150‑1 (MQ=255) aGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACt > 1:4321837/1‑150 (MQ=255) aGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACt < 2:786661/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCTGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAATTATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCcg < 1:4137240/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCATGGGTTAATGCCACGCTCACTACTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCTAAAACTTCcg < 1:1499333/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCTAAAACTTCcg < 1:1945676/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCTAAAACTTCcg > 1:807818/1‑150 (MQ=255) cGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCcg < 1:2631290/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCcg < 2:2675311/150‑1 (MQ=255) aaaGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGa > 1:492461/1‑150 (MQ=255) aaGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAg > 2:4041335/1‑150 (MQ=255) aaGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAg < 1:3090074/150‑1 (MQ=255) aGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAgg > 2:877642/1‑150 (MQ=255) cTCCATCAGCAGAGATTTCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGTGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGaa < 2:3558521/150‑1 (MQ=255) ccATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAAc < 2:1886012/150‑1 (MQ=255) ccATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAAc > 1:629580/1‑150 (MQ=255) cATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAAcc < 1:1114664/150‑1 (MQ=255) cATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAAcc > 2:3363628/1‑150 (MQ=255) aTCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACcg < 2:763853/150‑1 (MQ=255) agagATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGaa > 1:2382458/1‑150 (MQ=255) gaTTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCATGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATgc < 2:2161735/150‑1 (MQ=255) tGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATgcagc < 1:2785567/150‑1 (MQ=255) tGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATgcagc > 2:2300377/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCat < 2:2931355/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCat < 2:1743879/150‑1 (MQ=255) cAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATAtt > 2:3197893/1‑150 (MQ=255) cAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATAtt > 2:2644564/1‑150 (MQ=255) aGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAACCCGCGAGAATGCAGCATAGTc > 1:3514352/1‑150 (MQ=255) cAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAg < 1:4504621/150‑1 (MQ=255) aaCGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAgg > 1:198166/1‑150 (MQ=255) gTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCtg > 2:1009736/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGACACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCaa > 2:599857/1‑150 (MQ=255) ttGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCagag > 1:3188710/1‑150 (MQ=255) tGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGt > 2:3025074/1‑150 (MQ=255) tGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGt < 1:1040269/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTg < 1:2102389/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTg < 1:4031319/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTg < 1:4031214/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGAt < 1:420058/150‑1 (MQ=255) tggtATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGc > 2:362276/1‑150 (MQ=255) ggtATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGcg > 2:1129547/1‑150 (MQ=255) gtATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGcga > 2:1218404/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGcgacg < 2:700636/150‑1 (MQ=255) tCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGcgacga > 1:1883972/1‑150 (MQ=255) aaGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAg < 1:3327709/150‑1 (MQ=255) aGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCACAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAgc > 1:1028020/1‑150 (MQ=255) ggTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAgcgc > 1:4529694/1‑150 (MQ=255) tAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAGACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCag < 2:48317/150‑1 (MQ=255) tAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCag > 2:2623696/1‑150 (MQ=255) tAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCag > 1:3563037/1‑150 (MQ=255) tGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAgc > 2:3931153/1‑150 (MQ=255) tGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAgc > 2:4095956/1‑150 (MQ=255) gCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAgcg < 1:1781767/150‑1 (MQ=255) ccACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAgcgc < 1:4194963/150‑1 (MQ=255) cACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGcgcg < 1:2926802/150‑1 (MQ=255) cACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGcgcg > 1:3513996/1‑150 (MQ=255) cACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGcgcg < 2:3413741/150‑1 (MQ=255) aCGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCgg < 1:2096476/150‑1 (MQ=255) aCGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCgg < 1:3837926/150‑1 (MQ=255) tCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAACCCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACa > 2:544118/1‑150 (MQ=255) cTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAgcg > 1:3103603/1‑150 (MQ=255) cTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAgcg > 2:4434187/1‑150 (MQ=255) cTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAgcg > 1:2498154/1‑150 (MQ=255) gACGTGGTGATTAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGa > 2:4453559/1‑150 (MQ=255) gtggtgATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGAttt > 2:2146874/1‑150 (MQ=255) tggtgATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGAtttt > 2:2253221/1‑150 (MQ=255) ggtgATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTc < 2:3937928/150‑1 (MQ=255) ggtgATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTc > 2:3523307/1‑150 (MQ=255) tgATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAg < 2:209269/150‑1 (MQ=255) ttAAGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGttt < 2:1456146/150‑1 (MQ=255) aGTCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTAt < 2:3961369/150‑1 (MQ=255) gTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTAtt < 1:697322/150‑1 (MQ=255) gTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTAtt < 2:2802312/150‑1 (MQ=255) tCTACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTATTg < 2:1499728/150‑1 (MQ=255) tACCTAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTATTGca < 2:4529694/150‑1 (MQ=255) aCCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTATTGcac > 2:1386275/1‑150 (MQ=255) gAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTATTGCACAcc < 1:2064774/150‑1 (MQ=255) | CGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCAGAGTCTGATTGCGACGAAGCGCCAGAGCGCGGAACAGCGGCGGATTTTCAGTTTTATTGCACACC > CP009273/4222001‑4222298 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |