| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,271,906 | C→T | 14.0% | E366E (GAG→GAA) | yjcF ← | pentapeptide repeats protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,271,906 | 0 | C | T | 14.0% | 836.4 / 100.3 | 292 | E366E (GAG→GAA) | yjcF | pentapeptide repeats protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (120/130); new base T (20/21); total (140/152) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
CATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACG > CP009273/4271758‑4272054 | cATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCt > 2:4283106/1‑150 (MQ=255)cATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCt > 1:2232111/1‑150 (MQ=255) aaGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATc < 2:1525797/150‑1 (MQ=255) aaGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATc < 2:4094549/150‑1 (MQ=255) aaGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATc < 1:2297055/150‑1 (MQ=255) ttATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGaaa > 2:1434333/1‑150 (MQ=255) ttATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATAACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGaaa < 1:3571144/150‑1 (MQ=255) ttATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATAACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGaaa < 1:3277321/150‑1 (MQ=255) aTCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAAtt < 2:953776/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGa > 1:1007936/1‑150 (MQ=255) gTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAAGTAACACGa > 2:2408176/1‑150 (MQ=255) ttGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATa < 1:908527/150‑1 (MQ=255) tgACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATagag > 1:3177225/1‑150 (MQ=255) tgACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATagag > 1:3176418/1‑150 (MQ=255) tgACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATagag > 1:2977422/1‑150 (MQ=255) cATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 1:2644191/150‑1 (MQ=255) tGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGa < 1:333010/150‑1 (MQ=255) cAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGatat > 2:3490574/1‑150 (MQ=255) aGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATAtt > 1:1427203/1‑150 (MQ=255) aGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATAtt > 1:4502455/1‑150 (MQ=255) aGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATAtt > 1:2134936/1‑150 (MQ=255) gTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTa < 1:1342007/150‑1 (MQ=255) gTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTa > 1:3308254/1‑150 (MQ=255) tATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTaa > 2:3009684/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAAc < 2:1330173/150‑1 (MQ=255) aGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACAt > 1:616406/1‑150 (MQ=255) gTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATc < 1:1739976/150‑1 (MQ=255) ggCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATcaa > 2:1302380/1‑148 (MQ=255) ggCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCa > 1:186500/1‑150 (MQ=255) ggCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCa > 2:1712268/1‑150 (MQ=255) caATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCt > 1:1399055/1‑150 (MQ=255) aaTCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCtt > 1:2354790/1‑150 (MQ=255) ttcttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGTTATTAAACATCCAGGCTTTTGt < 2:2906189/150‑1 (MQ=255) cttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTa > 2:1983721/1‑150 (MQ=255) cttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTa > 2:1982179/1‑150 (MQ=255) cttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTa > 1:259526/1‑150 (MQ=255) ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTaa < 1:4098470/150‑1 (MQ=255) ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTaa > 2:2574879/1‑150 (MQ=255) tcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTaaa < 1:2199826/150‑1 (MQ=255) gAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacaga > 2:379802/1‑150 (MQ=255) aaTTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa > 2:472477/1‑150 (MQ=255) aTTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaac > 2:3555567/1‑150 (MQ=255) tttCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaaca < 2:612951/150‑1 (MQ=255) ttCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaacag < 2:1079970/150‑1 (MQ=255) tCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGt > 2:516320/1‑150 (MQ=255) tGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg < 2:3266817/150‑1 (MQ=255) tAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaa < 1:4169508/150‑1 (MQ=255) aCCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCaa > 1:2836567/1‑150 (MQ=255) cAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAAtt < 2:3056752/150‑1 (MQ=255) cAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAAtt < 2:3057928/150‑1 (MQ=255) atatCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCtt > 1:3620491/1‑150 (MQ=255) atatCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCtt > 2:453285/1‑150 (MQ=255) atCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaa < 2:2813672/150‑1 (MQ=255) cACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAAt < 2:1246199/150‑1 (MQ=255) cTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTg < 1:4086510/150‑1 (MQ=255) cTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTg < 2:250212/150‑1 (MQ=255) tATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCCTTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTgg > 1:2931881/1‑150 (MQ=255) tATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTgg > 1:133320/1‑150 (MQ=255) tATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTgg < 1:1511290/150‑1 (MQ=255) aTTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGc > 2:4244368/1‑150 (MQ=255) tAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCat > 1:1800583/1‑150 (MQ=255) agaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaa < 1:3205085/150‑1 (MQ=255) agaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaa < 2:4370862/150‑1 (MQ=255) agaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaa < 1:2104122/150‑1 (MQ=255) gaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaaa > 1:940742/1‑150 (MQ=255) atatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaaaa < 2:2348044/150‑1 (MQ=255) tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAAt < 2:2986585/150‑1 (MQ=255) atTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAAtt < 2:2257223/150‑1 (MQ=255) ttttCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTa > 1:731436/1‑150 (MQ=255) ttttCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTa > 2:3536008/1‑150 (MQ=255) tttCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTaa > 2:939757/1‑150 (MQ=255) ttCCTCAACACTGATAATGGTAATAAACATTCCCTGGACGCTAGCATCATCTAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCATTATTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGATTAAATTGGCATTATTAAAAttttt < 2:4125761/150‑4 (MQ=255) ccTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACAt > 1:3604857/1‑150 (MQ=255) cTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACAtt < 2:262941/150‑1 (MQ=255) cTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACAtt < 2:3921312/150‑1 (MQ=255) ccacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGcc > 2:2738465/1‑150 (MQ=255) cacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCa > 1:1633644/1‑150 (MQ=255) acGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCat < 1:1139918/150‑1 (MQ=255) ggAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCatat > 1:529951/1‑150 (MQ=255) gaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTag < 1:951481/150‑1 (MQ=255) aaTGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTaga < 1:4343431/150‑1 (MQ=255) aaTGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTaga < 2:1432190/150‑1 (MQ=255) aTGGTAATACCCAGTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTagag < 2:3898164/150‑1 (MQ=255) ggTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTc > 1:1288316/1‑150 (MQ=255) gTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCg < 1:4371657/150‑1 (MQ=255) aaTACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGt < 1:797811/150‑1 (MQ=255) aTACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGTCGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTa < 1:4521023/150‑1 (MQ=255) aTACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTa > 1:3413290/1‑150 (MQ=255) tACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTAc > 1:2383525/1‑150 (MQ=255) aCCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACa > 1:191542/1‑150 (MQ=255) ttCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATaa < 1:2523358/150‑1 (MQ=255) cTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCAt < 2:3884365/150‑1 (MQ=255) cTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCAt > 1:3042650/1‑150 (MQ=255) cTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCAt > 1:3042147/1‑150 (MQ=255) ggACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCAttt < 2:3524777/150‑1 (MQ=255) gACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTc < 1:3824469/150‑1 (MQ=255) cGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGa < 2:3380316/150‑1 (MQ=255) gCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAg > 1:3730135/1‑150 (MQ=255) gCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAg > 1:4315526/1‑150 (MQ=255) aGCCTCATCGAATTTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGac > 2:1822040/1‑149 (MQ=255) | CATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACG > CP009273/4271758‑4272054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |