| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,373,522 | C→T | 45.3% | intergenic (+85/‑134) | epmA → / → yjeM | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase/putative transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,373,522 | 0 | C | T | 45.3% | 88.7 / inf | 247 | intergenic (+85/‑134) | epmA/yjeM | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase/putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (79/56); new base T (66/46); total (145/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
ATGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACGATA > CP009273/4373375‑4373670 | aTGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTca > 1:2252683/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTcaca > 2:3627289/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACaa > 1:4232086/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAAt < 1:1854417/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAAtt > 2:2952940/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCTTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCAAAAATTTAAGa > 2:4258829/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGa > 2:1792443/1‑150 (MQ=255) gggCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGAc < 1:1149095/150‑1 (MQ=255) gcgGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGa < 1:3199821/150‑1 (MQ=255) gcgGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGa > 1:243977/1‑150 (MQ=255) ggAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGAGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGata > 2:1036476/1‑150 (MQ=255) gagaCACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGatat < 1:2830502/150‑1 (MQ=255) agaCACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATAtt > 2:3205381/1‑150 (MQ=255) gaCACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATAttt > 1:2865218/1‑150 (MQ=255) gaCACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATAttt > 1:2865242/1‑150 (MQ=255) gaCACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATAttt < 1:4133820/150‑1 (MQ=255) acTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGat < 1:2218526/150‑1 (MQ=255) acTGGCTGAAGTCATCGCCTTGAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGat < 2:3339846/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGata < 1:1077704/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGata > 1:131986/1‑150 (MQ=255) tGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGatat > 1:4136769/1‑150 (MQ=255) ggCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGTGCCTAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAATAGCCATTCGGTAGCATATGTTTTCATTTTACCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATatc > 2:4308653/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATatca < 1:4418148/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAAATAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATatca < 2:3083687/150‑1 (MQ=255) aaGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAAGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCa < 2:1851344/150‑1 (MQ=255) aTCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTAt > 1:1153585/1‑150 (MQ=255) aTCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTAt > 1:2184578/1‑150 (MQ=255) cGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCa > 2:2096541/1‑150 (MQ=255) cGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCa > 1:3154779/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCaa < 1:2808993/150‑1 (MQ=255) gTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTAtt > 1:239051/1‑150 (MQ=255) gTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCAGTCTGTCGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTAtt > 1:238384/1‑150 (MQ=255) ccGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGttt < 1:4350702/150‑1 (MQ=255) ccGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGttt < 1:1084026/150‑1 (MQ=255) gCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTAc < 2:2329960/150‑1 (MQ=255) cATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACg > 2:3468633/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctg < 2:2064635/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctg < 2:2043217/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctg < 1:58418/150‑1 (MQ=255) aTTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctgc > 1:2476436/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctgcctg < 1:3767302/150‑1 (MQ=255) cTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGCGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctgcctg < 1:663387/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTc > 2:770200/1‑150 (MQ=255) aaaaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCa < 1:3876564/150‑1 (MQ=255) aaaaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCa < 1:3399232/150‑1 (MQ=255) aaaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCaa > 2:2906286/1‑150 (MQ=255) aaaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCaa > 2:1690833/1‑150 (MQ=255) aaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAAt > 2:1530412/1‑150 (MQ=255) tACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGtt < 1:269734/150‑1 (MQ=255) aCTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTg < 2:1893275/150‑1 (MQ=255) cTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTgc < 1:3568480/150‑1 (MQ=255) aaTTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgca < 1:494713/150‑1 (MQ=255) aTTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcag > 1:4334905/1‑150 (MQ=255) tAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCACTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtg > 1:2068541/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtgcag > 1:3972428/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtgcagt < 1:3524190/150‑1 (MQ=255) gATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACgtgt < 2:122753/150‑1 (MQ=255) tAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTta > 1:3906871/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTtat > 2:1334240/1‑150 (MQ=255) gcCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATacac > 1:3592579/1‑150 (MQ=255) cATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACAcgc > 2:2758527/1‑150 (MQ=255) tCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCt > 1:773153/1‑150 (MQ=255) tCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCt > 1:773135/1‑150 (MQ=255) tCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCt > 1:2307773/1‑150 (MQ=255) cTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTg > 1:603337/1‑150 (MQ=255) cTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTg < 2:662472/150‑1 (MQ=255) cTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTg > 1:3479171/1‑150 (MQ=255) gTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGaa < 2:131986/150‑1 (MQ=255) aGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGTATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTTCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAAt < 2:4367158/150‑1 (MQ=255) aGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGCCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAAt < 2:3779318/150‑1 (MQ=255) gCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATg < 2:2247989/150‑1 (MQ=255) gCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATg > 2:901270/1‑150 (MQ=255) atatGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGaa > 2:644648/1‑150 (MQ=255) atatGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGaa > 1:1894869/1‑150 (MQ=255) tatGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAg > 1:2704447/1‑150 (MQ=255) tatGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAg > 2:3764494/1‑150 (MQ=255) tatGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAg > 1:2704487/1‑150 (MQ=255) tatGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAg > 2:1151815/1‑150 (MQ=255) atGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAgg < 2:1070317/150‑1 (MQ=255) tGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTTCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGa > 1:3741844/1‑150 (MQ=255) tGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGa > 1:4474373/1‑150 (MQ=255) ttttCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATg > 1:1158925/1‑150 (MQ=255) ttCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATgga > 2:2471015/1‑149 (MQ=255) ttCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGt > 1:1082474/1‑150 (MQ=255) tCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGtt < 1:3834750/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGttt > 1:3224367/1‑150 (MQ=255) cATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGttt < 2:1603167/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGtgt > 2:3334740/1‑148 (MQ=255) ttttCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATTTTTGATATCTTCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCTATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCAt < 2:453330/150‑1 (MQ=255) ttttCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCAt < 1:2982868/150‑1 (MQ=255) cGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTc > 2:841751/1‑150 (MQ=255) gTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTca > 1:2114766/1‑150 (MQ=255) tAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTcaca > 2:253711/1‑150 (MQ=255) tAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTcaca < 2:3102632/150‑1 (MQ=255) tAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTcaca < 2:828089/150‑1 (MQ=255) aaaGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCacac > 1:2088442/1‑150 (MQ=255) aaaGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCacac > 2:1871352/1‑150 (MQ=255) aaGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACg > 1:2638452/1‑150 (MQ=255) aaGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACg > 2:2076418/1‑150 (MQ=255) aaGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACg > 2:337267/1‑150 (MQ=255) | ATGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACGATA > CP009273/4373375‑4373670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |