Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 4,481,249 | A→T | 8.4% | V365E (GTG→GAG) | idnT ← | L‑idonate and D‑gluconate transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,481,249 | 0 | A | T | 8.4% | 910.0 / 50.5 | 282 | V365E (GTG→GAG) | idnT | L‑idonate and D‑gluconate transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (111/147); new base T (11/13); total (122/160) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
ACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCGCGGTGGTAATGGCCGCGACGGTGGCAGAGCCCAGAGCGATACGCAACAGCGCCGCAACAGTCCAGCACATCAATAACGGCGAAAGTGTAGTTCCGGTCATTAAGTGTGAAATATAGTGCCCGACACCGCTATCTACTAAT > CP009273/4481101‑4481398 | cAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAacaccac < 1:3053524/150‑1 (MQ=255) cGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAacaccacacc < 1:4129961/150‑1 (MQ=255) gTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACAccc > 1:713110/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |