Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 4,564,939 | G→T | 7.4% | pseudogene (1204/2937 nt) | yjiV → | pseudogene; conserved hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,564,939 | 0 | G | T | 7.4% | 935.7 / 32.5 | 252 | pseudogene (1204/2937 nt) | yjiV | pseudogene; conserved hypothetical protein |
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Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
AAGCCGCGACTATCCTGGTATCCCGAACCTGGACGGAGATGGTTAACGAGCTTAAAGAGAGAGCCGATATCCGCGGGCCGGTTCTGCAATATAACCATTATCTTAAGCCTGAAGTGTTTAATGAAAACGGCGGCCCCCTTAAGCTTTCTGAAATGTTGTTGTTCCGGGAATTCATGCGTCGCCCTAAACGGACTAACAGCCTGGAAACACAGGGGCTGGTTCAGGTTGGTTACCAGGGGCTGGAGAAAATACATAAGAGCCCCTTGCACTGGCAGGAAAAAGGATTAACGCTGGATGAC > CP009273/4564790‑4565088 | cgACTATCCTGGTATCCCGAACCTCGACGGAGATGGTTAACGAGCTTAAAGAGAGAGCCGATATCCGCGGGCCGGTTCTGCAATATAACCATTATCTTAAGCCTGAAGTGTTTAATGAAAACGGCGGCCCCCTTAAGCTTTCTGAAAtgt > 1:4448563/1‑150 (MQ=255) gACTATCCTGGTATCCCGAACCTGGACGGAGATGGTTAACGAGCTTAAAGAGAGAGCCGATATCCGCGGGCCGGTTCTGCAATATAACCATTATCTTAAGCCTGAAGTGTTTAATGAAAACGGCGGCCCCCTTAAGCTTTCTGAAAtgtt > 2:4195205/1‑150 (MQ=255) tATCCTGGTATCCCGAACCTGGACGGAGATGGTTAACGAGCTTAAAGAGAGAGCCGATATCCGCGGGCCGGTTCTGCAATATAACCATTATCTTAAGCCTGAAGTGTTTAATGAAAACGGCGGCCCCCTTAAGCTTTCTGAAAtgttgtt > 2:3921283/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |