| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 42,079 | G→A | 46.6% | intergenic (‑148/‑324) | caiT ← / → fixA | putative transporter/anaerobic carnitine reduction putative electron transfer flavoprotein subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 42,079 | 0 | G | A | 46.6% | 61.4 / inf | 269 | intergenic (‑148/‑324) | caiT/fixA | putative transporter/anaerobic carnitine reduction putative electron transfer flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (67/76); new base A (62/63); total (129/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.45e-01 | |||||||||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
GAGTTAATTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCT > CP009273/41932‑42228 | aGTTAATTCCACTGTGATAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTGTGTTTTATTTTTGTGAACATTTTATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGGATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTAt < 2:2387806/150‑1 (MQ=255) aGTTAATTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGatat < 1:2592784/150‑1 (MQ=255) aGTTAATTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTAt < 2:3511271/150‑1 (MQ=255) tAATTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATcac > 2:3061684/1‑150 (MQ=255) tAATTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATAAACATCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGAGATTGATATcac > 2:2143912/1‑150 (MQ=255) aaTTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATcaca > 1:520532/1‑150 (MQ=255) aTTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACAt < 2:3113130/150‑1 (MQ=255) tCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACAttt < 2:895057/150‑1 (MQ=255) cACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACAttttt > 1:247118/1‑150 (MQ=255) aCTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTg < 2:3458134/150‑1 (MQ=255) gAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCg > 2:1126488/1‑150 (MQ=255) aaCTAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGt < 2:2720485/150‑1 (MQ=255) aaCGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGt > 2:4497100/1‑150 (MQ=255) cGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGa > 2:4068860/1‑150 (MQ=255) gAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGaa > 2:3378960/1‑150 (MQ=255) aaTATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAAt > 1:3880752/1‑150 (MQ=255) atatTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATa > 2:4147699/1‑150 (MQ=255) atatTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATa < 2:3360942/150‑1 (MQ=255) atatTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATa > 2:2744526/1‑150 (MQ=255) atttatttTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATaga > 1:132419/1‑150 (MQ=255) atttTGCGTTCCCGTTTTTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGc < 1:3381691/150‑1 (MQ=255) atttTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGc < 1:4387378/150‑1 (MQ=255) ttttGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCg > 2:560074/1‑150 (MQ=255) ttttGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCg < 1:1849387/150‑1 (MQ=255) ttttGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCg < 2:1604482/150‑1 (MQ=255) tGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGttt < 2:1968807/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGtttt > 2:106190/1‑150 (MQ=255) gTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGtttttt < 2:1198928/150‑1 (MQ=255) ttCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTc < 1:1663250/150‑1 (MQ=255) ccGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGtt < 1:2247297/150‑1 (MQ=255) gtttgtttTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTaa > 1:116738/1‑150 (MQ=255) tttgtttTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAAt < 1:1235689/150‑1 (MQ=255) ttgtttTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAAtt > 2:100368/1‑150 (MQ=255) ttATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGAt > 2:472653/1‑150 (MQ=255) tttttGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATtaa > 1:567931/1‑150 (MQ=255) ttttGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATtaat > 2:2536811/1‑150 (MQ=255) ttttGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATtaat > 1:2094129/1‑150 (MQ=255) tttGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATtaata > 2:3181858/1‑150 (MQ=255) ttAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCa < 2:3017463/150‑1 (MQ=255) tAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAg < 1:3441500/150‑1 (MQ=255) aaCATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGt < 2:4524465/150‑1 (MQ=255) aaCATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGt > 2:2784927/1‑150 (MQ=255) tttAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGt > 2:4095899/1‑150 (MQ=255) ttAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGtt > 1:2575509/1‑150 (MQ=255) aaTATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTAt > 1:4268255/1‑150 (MQ=255) atatAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTAta < 2:2576161/150‑2 (MQ=255) atatAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATg < 1:1010516/150‑1 (MQ=255) atatAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTAta > 1:3136813/1‑149 (MQ=255) tataATTATTATTAACCTCTTGCACGCGTTAATGGCTAAATCAAAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATTGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGc > 2:4406709/1‑150 (MQ=255) ataATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATAct < 1:4492488/150‑1 (MQ=255) aaTTATTATTAACCTCGTGGAAGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATActct < 2:3115082/150‑1 (MQ=255) tattattaACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCtgtt < 1:29557/150‑1 (MQ=255) attattaACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCtgttg < 2:1212759/150‑1 (MQ=255) ttattaACCTCGTGGACGCGTTACTGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCtgttgt < 1:1303151/150‑1 (MQ=255) taACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGt < 1:853477/150‑1 (MQ=255) aCCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTaa < 2:3292444/150‑1 (MQ=255) ccTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTaaa > 1:3560559/1‑150 (MQ=255) gTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAAt > 1:4148155/1‑150 (MQ=255) tGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATa < 1:3327653/150‑1 (MQ=255) ggACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATaa < 2:1528956/150‑1 (MQ=255) gACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAAc > 1:2204218/1‑150 (MQ=255) aCGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACa > 1:3629004/1‑150 (MQ=255) cgcgTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACAt < 1:3261713/150‑1 (MQ=255) cgcgTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACAt > 2:4035817/1‑150 (MQ=255) gcgTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATc < 2:1806966/150‑1 (MQ=255) cgTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCt < 2:2921281/150‑1 (MQ=255) gTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTg < 1:1003005/150‑1 (MQ=255) tAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGAc < 2:520531/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACt < 1:368162/150‑1 (MQ=255) ggCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTc > 1:2855939/1‑150 (MQ=255) ggCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTc > 1:1190715/1‑150 (MQ=255) gCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTTTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCa > 2:4162356/1‑150 (MQ=255) gCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCa > 2:1063374/1‑150 (MQ=255) cTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCaa < 2:937624/150‑1 (MQ=255) aCTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAatat < 1:1428558/150‑1 (MQ=255) cATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTgg < 2:2232484/150‑1 (MQ=255) tAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTg < 2:3870577/150‑1 (MQ=255) aaTGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGa < 2:1836978/150‑1 (MQ=255) aaTGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGa > 1:1927225/1‑150 (MQ=255) aTGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGAt > 1:3840669/1‑150 (MQ=255) tGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATc < 1:2765864/150‑1 (MQ=255) gTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCAt < 2:1113258/150‑1 (MQ=255) gTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCAt < 2:267148/150‑1 (MQ=255) gTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCAt > 1:1042070/1‑150 (MQ=255) tCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATaaaa < 2:133612/150‑1 (MQ=255) tCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATaaaa < 2:716053/150‑1 (MQ=255) aTAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACaa < 1:4303269/150‑1 (MQ=255) aTAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACaa > 2:2258749/1‑150 (MQ=255) aTAAGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACaa > 1:45727/1‑150 (MQ=255) tAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAat > 2:1733629/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAata > 2:246085/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAata > 2:692022/1‑150 (MQ=255) tGTATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAATACAATATTGa > 2:4081051/1‑150 (MQ=255) tATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGaaa < 1:1072790/150‑1 (MQ=255) tATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGaaa < 1:1420666/150‑1 (MQ=255) tATTCTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGaaa > 1:4303587/1‑150 (MQ=255) cTGTGATTGATATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGAAAAttt < 2:262589/150‑1 (MQ=255) aTTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGAAAATTTCtttt > 1:1939040/1‑150 (MQ=255) ttGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGAAAATTTCttttt < 2:1289601/150‑1 (MQ=255) gTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATACTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCt > 1:4029152/1‑150 (MQ=255) | GAGTTAATTCCACTGTGAAAACGAATATTTATTTTGCGTTCCCGTTTGTTTTATTTTTGTTAACATTTAATATAATTATTATTAACCTCGTGGACGCGTTAATGGCTAACTCATAATGGGTATTCAATAAGCTGTATTCTGTGATTGGTATCACATTTTTGTTTCGGGTGAATAGAGGGCGTTTTTTCGTTAATTTTGATTAATAATCAGTTTGTTATGCTCTGTTGTGAGTAAAAAATAACATCTGACTTTCAATATTGGTGATCCATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCT > CP009273/41932‑42228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |