Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 651,654 | 0 | A | G | 9.0% | 972.0 / 64.3 | 310 | intergenic (‑230/‑359) | dcuC/pagP | anaerobic C4‑dicarboxylate transport/phospholipid:lipid A palmitoyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (119/163); new base G (20/8); total (139/171) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-03 | |||||||||||
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Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
ATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAA > CP009273/651507‑651803 | tGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAAtt < 1:964459/150‑1 (MQ=255) tGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAAtt < 1:3390539/150‑1 (MQ=255) tGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCaa > 2:2093577/1‑150 (MQ=255) 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tAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGtcatca < 1:1152128/150‑1 (MQ=255) aaTTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCaa > 1:4324748/1‑150 (MQ=255) | ATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAA > CP009273/651507‑651803 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |