Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 69,367 | C→A | 46.5% | M16I (ATG→ATT) | thiQ ← | thiamine, thiamine pyrophosphate ABC transporter ATPase; ThiBPQ thiamine, thiamine pyrophosphate importer |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 69,367 | 0 | C | A | 46.5% | 197.2 / inf | 305 | M16I (ATG→ATT) | thiQ | thiamine, thiamine pyrophosphate ABC transporter ATPase; ThiBPQ thiamine, thiamine pyrophosphate importer |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (85/78); new base A (63/78); total (148/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
AGTTGTGTGATCTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCAATTT > CP009273/69220‑69516 | gTTGTGTGATCTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATc > 1:2294792/1‑150 (MQ=255) gTTGTGTGATCTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATc < 1:3156433/150‑1 (MQ=255) tgATCTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCaaa > 1:1559992/1‑150 (MQ=255) cTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAAtggt > 1:2231840/1‑150 (MQ=255) cTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAAtggt > 1:4072179/1‑150 (MQ=255) cTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAAtggt > 1:653389/1‑150 (MQ=255) cTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAAtggt < 1:4171202/150‑1 (MQ=255) tACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAAtggtg < 1:195915/150‑1 (MQ=255) cGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATggtggt > 2:1631315/1‑150 (MQ=255) gCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTa < 2:4031987/150‑1 (MQ=255) ccATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTaa > 2:2850528/1‑150 (MQ=255) ccATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTaa < 2:440313/150‑1 (MQ=255) aTCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAg > 2:1443404/1‑150 (MQ=255) gATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCa > 1:3114713/1‑150 (MQ=255) aTAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGGAAAGCCAg > 2:1805736/1‑150 (MQ=255) aGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCTCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGt > 1:2369753/1‑150 (MQ=255) tCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCTCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGa < 2:3702193/150‑1 (MQ=255) cAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGat < 2:1159518/150‑1 (MQ=255) aGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGata > 2:4459009/1‑150 (MQ=255) aGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGata < 2:3340342/150‑1 (MQ=255) cGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATAtc < 1:1239816/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATAtcag > 2:1657508/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATAtcagtca > 2:3740544/1‑150 (MQ=255) ctggctggCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATcagtcagt > 1:464167/1‑150 (MQ=255) ctggctggCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATcagtcagt > 1:1453466/1‑150 (MQ=255) tggctggcGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGtt < 2:4228040/150‑1 (MQ=255) tggctggcGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGtt < 2:1036057/150‑1 (MQ=255) gctggcGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGAGATCAGTCAGtttt > 2:4081616/1‑150 (MQ=255) ctggcGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTa < 2:177127/150‑1 (MQ=255) tggcGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTaa < 1:1067510/150‑1 (MQ=255) tggcGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTaa < 2:493712/150‑1 (MQ=255) ggcGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAAc < 1:2086184/150‑1 (MQ=255) cAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTc < 1:1634147/150‑1 (MQ=255) aGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCg > 1:1722979/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGcc > 2:3073671/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGcc < 2:1513150/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGGCGATCAAAGTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGcc < 1:3676885/150‑1 (MQ=255) aaCCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGcccc < 2:2487575/150‑1 (MQ=255) aaCCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGcccc > 1:3919/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGcccc > 1:3815/1‑150 (MQ=255) aaCCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGcccc < 2:3436492/150‑1 (MQ=255) aCCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCg < 1:3202569/150‑1 (MQ=255) aCCGGCGATAAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTTGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCTCCGCGTTCCACCGTTAATCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGAGATATAAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCg > 1:788652/1‑150 (MQ=255) ggCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTa < 2:764117/150‑1 (MQ=255) gATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGtt < 1:1188204/150‑1 (MQ=255) gATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGtt < 2:653735/150‑1 (MQ=255) aTCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGttt > 2:3408229/1‑150 (MQ=255) aaaTTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTc < 1:1177844/150‑1 (MQ=255) aaaTTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTc < 1:3395020/150‑1 (MQ=255) aaTTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCa > 1:3544083/1‑150 (MQ=255) aTTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCTCCCCGGTAGTTTTTCaa > 1:3231494/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAAt > 1:3343914/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATc < 2:3594575/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATc > 1:1669085/1‑150 (MQ=255) gcagGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACg < 1:2429690/150‑1 (MQ=255) gcagGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGGTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACg < 1:2429792/150‑1 (MQ=255) cagGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACgg < 2:2600303/150‑1 (MQ=255) cagGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACgg < 2:2600442/150‑1 (MQ=255) agGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCATATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGt < 2:2945929/150‑1 (MQ=255) gggTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTa > 2:2689791/1‑150 (MQ=255) gggTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTa > 2:1117550/1‑150 (MQ=255) gggTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTa < 1:4121254/150‑1 (MQ=255) gTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTaaa > 2:3579668/1‑150 (MQ=255) gTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTaaa > 2:1311783/1‑150 (MQ=255) aCTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAAca < 1:2623056/150‑1 (MQ=255) cTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAAcag < 1:1676194/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGaaaa > 1:495661/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGaaaa > 1:495256/1‑150 (MQ=255) cgcgACGATTGGCCCGAGTATCGCCACCTGCTCGACGCGTTCCAACGTTAATCTTAAACGAATCGGAAATTGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCATAAAAc < 2:2524642/150‑1 (MQ=255) cgcTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGagc < 2:3079245/150‑1 (MQ=255) ggCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGagcagcag < 1:2847998/150‑1 (MQ=255) cccGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAgcagcagca < 2:2384721/150‑1 (MQ=255) cGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGa > 2:792626/1‑150 (MQ=255) gAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGaa > 2:2501322/1‑150 (MQ=255) tCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAAc > 2:109504/1‑150 (MQ=255) tCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAAc < 2:2342340/150‑1 (MQ=255) cGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAAcg < 2:4082026/150‑1 (MQ=255) cACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCgg < 1:1451480/150‑1 (MQ=255) cACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCgg < 1:2969573/150‑1 (MQ=255) cACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAAGGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCGGCAGCAGAATTAACGCgg < 1:4383987/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGt > 1:325281/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTg < 2:2113742/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGAc < 1:682647/150‑1 (MQ=255) cgTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTc > 2:4366861/1‑150 (MQ=255) cgTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTc > 1:355107/1‑150 (MQ=255) cgTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTc < 1:2648522/150‑1 (MQ=255) cACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGc < 1:581782/150‑1 (MQ=255) aCCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCt > 2:17291/1‑150 (MQ=255) cGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGc > 1:2901220/1‑150 (MQ=255) gTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCg < 1:2765663/150‑1 (MQ=255) gTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCg < 1:2905629/150‑1 (MQ=255) tAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGAt > 2:142445/1‑150 (MQ=255) aaGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATa > 2:924555/1‑150 (MQ=255) aGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAg < 2:2264942/150‑1 (MQ=255) cTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGa < 2:2008709/150‑1 (MQ=255) cTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGa > 1:1328166/1‑150 (MQ=255) aaaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTATCGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGcc > 2:2641596/1‑150 (MQ=255) aaaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGCTAGGAGcc > 2:3077836/1‑150 (MQ=255) aaaCGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGcc > 2:3492785/1‑150 (MQ=255) aaaCGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGcc > 1:2134668/1‑150 (MQ=255) | AGTTGTGTGATCTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCAATTT > CP009273/69220‑69516 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |