| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 715,310 | T→A | 5.7% | N203Y (AAC→TAC) | speF ← | ornithine decarboxylase isozyme, inducible |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 715,310 | 0 | T | A | 5.7% | 828.0 / 26.7 | 250 | N203Y (AAC→TAC) | speF | ornithine decarboxylase isozyme, inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (104/131); new base A (5/10); total (109/141) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GATAAAGCCATACGGGTTACGTGCCGTTTCCAGATAAACCGGTGTTGCACCAGCCTGTAGCAACGCTCCGTGGTGGTTAGATTTGTGGTTATTGCGATCAAACAGCACCAGATCACCCGGTGTTAGCAGGGCGTTTAAAACCACTTTGTTAGAAGATGAAGTGCCATTTAAAACGAAGTAGGTTTTATCGGCATTAAACACTTTTGCCGCATGTTGCTGTGCAATGCATGGCGCGCCTTCGTGAATCAGCAGATCGCCCATCGCTACGTCGGCGTTGCACAAGTCGGCACGGAACAG > CP009273/715161‑715457 | atatAGCGATACGGTTTACGTGCCGTTTCCAGATAAACCGGTGTTGCACCAGCCTGTAGAAACGCTGCGTGGTGGTTAGATTTGTGGTTATTGCGATCAAACAGCACCAGATCACCCTGTGTTATCAGGGCGTTTAAAACCACTTTGTTa < 2:3001710/150‑1 (MQ=255) aTAAAGCCATTCGGGTTACGTGCCGTTTCCAGATAAACCGGTGTTGCACCAGCCTGTAGCAACGCTCCGTGGTGGTTAGATTTGTGGTTATTGCGATCAAACAGCACCAGATCACCCGGTGTTAGCAGGGCGTTTAAAACCACTTTGTTa < 2:2480551/150‑1 (MQ=255) aTAAAGCCATACGGGTTACGTGCCGTTTCCAGATAAACCGGTGTTGCACCAGCCTGTAGCAACGCTCCGTGGTGGTTAGATTTGTGGTTATTGCGATCAAACAGCACCAGATCACCCGGTGTTAGCAGGGCGTTTAAAACCACTTTGTTa > 2:341001/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |