| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 732,494 | 0 | G | T | 76.5% | 493.2 / 221.0 | 286 | pseudogene (214/1137 nt) | ybfL | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/35); new base T (110/109); total (142/144) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCG > CP009273/732347‑732642 | aaTTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTg > 1:2405910/1‑150 (MQ=255) aTTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGc > 1:3101024/1‑150 (MQ=255) ttGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGGAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGcc < 1:2208621/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |