Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 90,252 | G→T | 52.9% | A200A (GCG→GCT) | murE → | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanyl‑D‑glutamate:meso‑ diaminopimelate ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 90,252 | 0 | G | T | 52.9% | 36.5 / inf | 276 | A200A (GCG→GCT) | murE | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanyl‑D‑glutamate:meso‑ diaminopimelate ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (59/71); new base T (75/71); total (134/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
AAAGTGATCCCGACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCT > CP009273/90103‑90401 | aaaGTGATCCCGACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTgcg > 1:957507/1‑150 (MQ=255) aaaGTGATCCCGACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTgcg < 1:3171969/150‑1 (MQ=255) aaaGTGATCCCGACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGAGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACCCGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTgcg > 1:3695621/1‑150 (MQ=255) gTGATCCCGACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTgcggcg > 2:556295/1‑150 (MQ=255) gATCCCGACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTc < 1:581717/150‑1 (MQ=255) gACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCAGTGAAATTTGCGGCGTCGGTCtt > 1:1284310/1‑150 (MQ=255) aCAGAAAATACCACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCttt < 2:245920/150‑1 (MQ=255) aCAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCttt > 2:702587/1‑150 (MQ=255) aGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTAc > 1:2061096/1‑150 (MQ=255) gAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTAcc < 2:3721462/150‑1 (MQ=255) gAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGATTGTACAGCACCGTGTTGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTATTTAcc < 2:1074046/150‑1 (MQ=255) tACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACtt < 1:4092163/150‑1 (MQ=255) tACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACtt < 1:2111371/150‑1 (MQ=255) aCAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTa > 1:2374366/1‑150 (MQ=255) cAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTaa > 1:3128697/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAg < 2:1973134/150‑1 (MQ=255) aCCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGc < 2:2566583/150‑1 (MQ=255) ggCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCa < 2:3577833/150‑1 (MQ=255) ggCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCa > 2:1175130/1‑150 (MQ=255) gCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCAc < 1:1027524/150‑1 (MQ=255) cAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCAcc > 1:3791075/1‑150 (MQ=255) aGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCt > 1:3291623/1‑150 (MQ=255) tCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTg > 2:1324929/1‑150 (MQ=255) tCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTg < 2:2252217/150‑1 (MQ=255) tGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTa < 2:2815053/150‑1 (MQ=255) tGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTa < 2:163380/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTAt > 2:2505956/1‑150 (MQ=255) ttCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATc > 1:3668416/1‑150 (MQ=255) cAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCAt < 1:898171/150‑1 (MQ=255) cAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCAt < 1:897966/150‑1 (MQ=255) aGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATg < 1:4405972/150‑1 (MQ=255) aGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATg > 2:3729635/1‑150 (MQ=255) gCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATgg < 1:2166900/150‑1 (MQ=255) cATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGt > 2:990876/1‑150 (MQ=255) aTGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGAGCACCTTGATTATCATGGTg > 2:2337256/1‑150 (MQ=255) tGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGa > 2:471538/1‑150 (MQ=255) tGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGa > 2:471434/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGata > 2:4265845/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGata > 2:2222988/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATgg > 1:1378211/1‑150 (MQ=255) cGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAac < 2:1265304/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACt < 1:523886/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAAGGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACt < 2:2773813/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTAc < 2:2445831/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTAc > 1:2022965/1‑150 (MQ=255) ggtggATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTGTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTGGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGa < 2:4047828/150‑1 (MQ=255) gtggATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGaa < 2:3309092/150‑1 (MQ=255) gATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGcc > 2:4416564/1‑150 (MQ=255) gATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTGTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGcc < 2:3634284/150‑1 (MQ=255) aTCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCcg < 1:1023493/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGCACACTACGAAGCcgcg < 1:1217612/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCcgcg > 1:1350859/1‑150 (MQ=255) gcgcGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAAt < 1:1593358/150‑1 (MQ=255) cgACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGACGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGgc > 2:3827622/1‑150 (MQ=255) gACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGgct < 2:17508/150‑1 (MQ=255) gACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGgct < 2:208735/150‑1 (MQ=255) aCGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGgctg > 1:4380717/1‑150 (MQ=255) cGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGgctgc < 1:2468163/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGgctgct > 2:3392906/1‑150 (MQ=255) gTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGgctgct > 1:641883/1‑150 (MQ=255) ttttGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGACGCCGCGAAATGGCTGCtt > 2:3476739/1‑150 (MQ=255) tttGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCttt < 1:3969089/150‑1 (MQ=255) tGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTAt > 2:817454/1‑150 (MQ=255) cgcAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTc > 1:4060648/1‑150 (MQ=255) cgcAATGGAAGTGTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTc < 2:443397/150‑1 (MQ=255) gcAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCt < 1:1365826/150‑1 (MQ=255) cAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTg > 2:1431457/1‑150 (MQ=255) cAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTGTCTTCTg > 2:4056877/1‑150 (MQ=255) aaTGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGa > 2:1170887/1‑150 (MQ=255) gAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGcat < 1:292109/150‑1 (MQ=255) gAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGcat > 1:1912708/1‑150 (MQ=255) aGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGcatca > 1:4515967/1‑150 (MQ=255) aGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGcatca > 1:2542997/1‑150 (MQ=255) aGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGcatca > 2:4498815/1‑150 (MQ=255) tttCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCAtt < 1:792639/150‑1 (MQ=255) tcctccCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGc < 2:887816/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGc < 1:1249079/150‑1 (MQ=255) gggCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCg > 2:1408523/1‑150 (MQ=255) gggCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCg > 1:3225760/1‑150 (MQ=255) gggCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCg < 1:2674775/150‑1 (MQ=255) cTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGatt < 2:2350977/150‑1 (MQ=255) ggTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGattat > 1:1614261/1‑150 (MQ=255) gTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCATTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGattatt < 2:503485/150‑1 (MQ=255) cAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAAc < 1:355674/150‑1 (MQ=255) cACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGcc < 2:3262950/150‑1 (MQ=255) cACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGcc > 2:4210809/1‑150 (MQ=255) cACCGTGTGGCGGCATTGAAATGTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGcc < 2:3080832/150‑1 (MQ=255) aCCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCcg < 1:3059943/150‑1 (MQ=255) tgtgGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCcgacga > 1:3153579/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATCATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCcgacga > 1:407705/1‑150 (MQ=255) tgGCGGCATTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATg < 1:1742555/150‑1 (MQ=255) ggcATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGt > 2:1448038/1‑150 (MQ=255) cATTGAATTTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGTAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTgg < 1:181367/150‑1 (MQ=255) aTTGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCTATTATTAACGCCGACGATGAAGTggg > 1:3906029/1‑150 (MQ=255) aTTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGTTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTggg > 1:1157027/1‑150 (MQ=255) aTTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTggg < 1:4148339/150‑1 (MQ=255) ttGAAATTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGgc < 1:3372740/150‑1 (MQ=255) ttGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGgc > 1:3253448/1‑150 (MQ=255) aaTTTGCTGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGgccgcc < 2:4199750/150‑1 (MQ=255) ttGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCgct < 1:923399/150‑1 (MQ=255) | AAAGTGATCCCGACAGAAAATACAACCGGTTCGGCAGTCGATGTTCAGCATGAGCTGGCGGGGCTGGTGGATCAGGGCGCGACGTTTTGCGCAATGGAAGTTTCCTCCCACGGGCTGGTACAGCACCGTGTGGCGGCATTGAAATTTGCGGCGTCGGTCTTTACCAACTTAAGCCGCGATCACCTTGATTATCATGGTGATATGGAACACTACGAAGCCGCGAAATGGCTGCTTTATTCTGAGCATCATTGCGGTCAGGCGATTATTAACGCCGACGATGAAGTGGGCCGCCGCTGGCT > CP009273/90103‑90401 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |