Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,048,928 | C→A | 91.1% | E903* (GAA→TAA) | torS ← | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,048,928 | 0 | C | A | 91.1% | 657.8 / 57.7 | 235 | E903* (GAA→TAA) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/13); new base A (130/84); total (138/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.17e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GGCCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTT > CP009273/1048781‑1049074 | ggCCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACa < 1:2226029/150‑1 (MQ=255) ccgccgCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACaga > 1:1976493/1‑150 (MQ=255) ccgcTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCg < 1:2672460/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCaa < 1:1808793/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAac < 1:1879855/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTg < 2:2372735/150‑1 (MQ=255) ggTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCgt > 1:1303092/1‑150 (MQ=255) ggTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGATTACAGAGCGGCAACACAGCgt > 2:4409779/1‑150 (MQ=255) gTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCTACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCgtg > 1:4503961/1‑150 (MQ=255) tCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTa < 1:970325/150‑1 (MQ=255) cTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTaa < 1:3974569/150‑1 (MQ=255) ttATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAAttt < 2:2478455/150‑1 (MQ=255) tATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATttc < 1:1817980/150‑1 (MQ=255) tATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATttc > 1:219831/1‑150 (MQ=255) ctctGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCg > 2:257828/1‑150 (MQ=255) ctGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCgtg < 1:1841130/150‑1 (MQ=255) ctGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCgtg > 2:3147927/1‑150 (MQ=255) gCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGtgtg > 1:1325632/1‑150 (MQ=255) tGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAg > 2:2823771/1‑150 (MQ=255) gATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAgg < 2:3572603/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAggg < 2:2015367/150‑1 (MQ=255) ttttGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAgggg < 2:181090/150‑1 (MQ=255) tGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGc > 1:1263121/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCa < 1:2587866/150‑1 (MQ=255) ccAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAg < 2:2585254/150‑1 (MQ=255) cAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGa > 2:358831/1‑150 (MQ=255) cAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGa > 1:3047922/1‑150 (MQ=255) tCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATaa > 2:3658551/1‑150 (MQ=255) ccGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAAt < 1:1143703/150‑1 (MQ=255) cGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTAGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATg > 1:3677724/1‑150 (MQ=255) gTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATgg > 2:3886728/1‑150 (MQ=255) tAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgct > 2:2695436/1‑150 (MQ=255) tAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgct > 2:913449/1‑150 (MQ=255) tAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgct > 2:2032002/1‑150 (MQ=255) aaGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgctg < 2:3041398/150‑1 (MQ=255) aaGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgctg > 2:1245124/1‑150 (MQ=255) gTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgctgct > 2:1833376/1‑150 (MQ=255) ttGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGgctgctg > 1:212107/1‑150 (MQ=255) tataCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTc < 1:3286795/150‑1 (MQ=255) tataCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATGTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTc > 2:4291825/1‑150 (MQ=255) ataCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTCATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTcc > 2:1684876/1‑150 (MQ=255) ataCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGCCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTcc > 1:2033585/1‑150 (MQ=255) taCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCa < 1:320664/150‑1 (MQ=255) aCCAACTGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCCTGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAg < 1:306105/150‑1 (MQ=255) aCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAg > 2:1625278/1‑150 (MQ=255) aCCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAg > 2:1625270/1‑150 (MQ=255) cAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGtt > 2:2521989/1‑150 (MQ=255) aaaTGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTtg < 1:2284894/150‑1 (MQ=255) aaTGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTtgt > 2:459127/1‑150 (MQ=255) aaTGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTtgt > 2:807194/1‑150 (MQ=255) aTGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTtgtg < 2:2273431/150‑1 (MQ=255) gCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTgcg > 1:2845246/1‑150 (MQ=255) gCCACTATTCTAGTTGTACTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGAGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTgcg > 1:2066100/1‑150 (MQ=255) cTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATa < 1:3888538/150‑1 (MQ=255) tATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAg > 1:3657746/1‑150 (MQ=255) tATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAg < 1:659839/150‑1 (MQ=255) ttCTAGTAGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgct < 2:4116645/150‑1 (MQ=255) tCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctg < 2:2367115/150‑1 (MQ=255) cTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctgg > 2:3490820/1‑150 (MQ=255) gttgttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAgctggctg < 2:2956647/150‑1 (MQ=255) tgttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCtggctggc > 2:1601205/1‑150 (MQ=255) gttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCg > 2:2549533/1‑150 (MQ=255) gttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCg > 1:3548514/1‑150 (MQ=255) gttCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCg > 1:1105827/1‑150 (MQ=255) tCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGat > 1:1339585/1‑150 (MQ=255) tCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGat > 1:3608674/1‑150 (MQ=255) aCTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCa > 1:1815257/1‑150 (MQ=255) tGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCAtt > 2:2315873/1‑150 (MQ=255) ggCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTc > 2:1840473/1‑150 (MQ=255) cTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTccc < 1:875443/150‑1 (MQ=255) tGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCa > 1:3963529/1‑150 (MQ=255) tGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCa < 2:480951/150‑1 (MQ=255) gATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAg > 2:2942263/1‑150 (MQ=255) atatTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCAATATGCATTCCCAGa < 2:958196/150‑1 (MQ=255) tatTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCGGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATAGGCATTCCCAGAc > 2:2749549/1‑150 (MQ=255) tatTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGAc > 1:3946005/1‑150 (MQ=255) tatTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGAc > 1:4105561/1‑150 (MQ=255) ttGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCAATATGCATTCCCAGACTc < 2:3448966/150‑1 (MQ=255) tGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCg > 2:7197/1‑150 (MQ=255) tGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCg > 2:1744246/1‑150 (MQ=255) aTTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAg < 1:3677536/150‑1 (MQ=255) aaTCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACt < 2:1020809/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCAATATGCATTCCCAGACTCGAGCACCTGCtttg > 2:3155281/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCAATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCtttt > 2:3824191/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCttttt > 1:2536981/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCttttt < 2:2238208/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAg < 1:4291415/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAg < 2:1303092/150‑1 (MQ=255) aGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGc > 1:2526006/1‑150 (MQ=255) tcttATGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCAATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATgcg < 2:69716/150‑1 (MQ=255) cttATGCAACCCTGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATgcgc < 1:4315407/150‑1 (MQ=255) tGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCa < 2:1133174/150‑1 (MQ=255) tGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCa > 2:1790318/1‑150 (MQ=255) tGCAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCa > 2:2407201/1‑150 (MQ=255) cAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACg < 2:2708921/150‑1 (MQ=255) cAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACg > 1:2238906/1‑150 (MQ=255) cAACCATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACg > 2:318475/1‑150 (MQ=255) ccATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGAAAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCACTATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCtt > 2:259680/1‑150 (MQ=255) cATGCTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCAATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCttt > 2:3957349/1‑150 (MQ=255) cTTACAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTAttt > 1:1506670/1‑150 (MQ=255) | GGCCGCCGCTGCCAGCGGGTTCTTTTATTCTCTGCCATGATTTTGCCAGTCCGTTAAGTTGTATACCAAATGCCACTATTCTAGTTGTTCTTAACTGGCTGATATTGATTCAAATCGCGTTCAGGTCTTTCTTATGCAACCATGCTTCCAGAGCGGCAACACTGCGTGTAATTTCTTCGTGTGGAAGGGGGGCAGATAATGGCTGCTGCTCCAGTTGTGCGCATAGCTGGCTGGCGATATGCATTCCCAGACTCGAGCAACTGCTTTTTAGCTGATGCGCGGCACGCTTTATTT > CP009273/1048781‑1049074 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |