| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 104,054 | 0 | G | T | 7.2% | 573.7 / 2.4 | 174 | intergenic (+93/‑138) | lpxC/secM | UDP‑3‑O‑acyl N‑acetylglucosamine deacetylase/regulator of secA translation |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/117); new base T (16/2); total (55/119) | |||||||||||
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Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CAGGACGACGCAGAACTGCCGTTGGCCTTCAAAGCGCCTTCAGCTGTACTGGCATAACGACATTTATACTGTCGTATAAAATTCGACTGGCAAATCTGGCACTCTCTCCGGCCAGGTGAACCAGTCG‑TTTTTTTTTGAATTTTATAAGAGCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTGAGTGGAATA > CP009273/103905‑104203 | cAGGACGACGCAGAACTGCCGTTGGCCTTCAAAGCGCCTTCAGCTGTACTGGCATAACGACATTTATACTGTCGTATAAAATTCGACTGGCAAATCTGGCACTCTCTCCGGCCAGGTGAACCAGTCG‑TTTTTTTTTGAATTTTATAagag < 1:2706724/150‑1 (MQ=255) cgacgCAGAACTGCCGTTGGCCTTCAAAGCGCCTTCAGCTGTACTGGCATAACGACATTTATACTGTCGTATAAAATTCGACTGGCAAATCTGGCACTCTCTCCGGCCAGGTGAACCAGTCG‑TTTTTTTTTGTTTTTTTTAAGATCtata > 1:855665/1‑150 (MQ=255) cgacgCAGAACTGCCGTTGGCCTTCAAAGCGCCTTCAGCTGTACTGGCATAACGACATTTATACTGTCGTATAAAATTCGACTGGCAAATCTGGCACTCTCTCCGGCCAGGTGAACCAGTCG‑TTTTTTTTTGAATTTTATAAGAGCtata < 1:1403307/150‑1 (MQ=255) 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tttATAAGAGCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTg < 2:126615/150‑1 (MQ=255) ttATAAGAGCTATAAAAAACGGTGCTAACTCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATACGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCTGGATGGCAATAACGTGa > 1:2421370/1‑150 (MQ=255) taAGAGCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTGAGTg > 2:4540439/1‑150 (MQ=255) aaGAGCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTGAGTgg < 2:3176042/150‑1 (MQ=255) aaGAGCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTGAGTgg < 2:4087174/150‑1 (MQ=255) 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agCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTGAGTGGAAt > 2:2653252/1‑150 (MQ=255) gCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTGAGTGGAATa > 1:1030357/1‑150 (MQ=255) | CAGGACGACGCAGAACTGCCGTTGGCCTTCAAAGCGCCTTCAGCTGTACTGGCATAACGACATTTATACTGTCGTATAAAATTCGACTGGCAAATCTGGCACTCTCTCCGGCCAGGTGAACCAGTCG‑TTTTTTTTTGAATTTTATAAGAGCTATAAAAAACGGTGCGAACGCTGTTTTCTTAA‑GCACTTTTCCGCACAACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTTGAATATGATCGGGATGGCAATAACGTGAGTGGAATA > CP009273/103905‑104203 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |