| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,204,620 | C→A | 18.2% | pseudogene (456/501 nt) | stfE ← | pseudogene, e14 prophage; side tail fiber protein fragment family;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,204,620 | 0 | C | A | 18.2% | 244.6 / 32.1 | 87 | pseudogene (456/501 nt) | stfE | pseudogene, e14 prophage; side tail fiber protein fragment family;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/45); new base A (6/10); total (32/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAA > CP009273/1204475‑1204764 | gAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGttt < 2:2704992/150‑1 (MQ=255)gAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGttt < 2:2704967/150‑1 (MQ=255)gAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGttt < 2:2704867/150‑1 (MQ=255)gAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGttt < 2:2704863/150‑1 (MQ=255) aaGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTc < 1:4208710/150‑1 (MQ=255) aGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCt > 2:4130459/1‑150 (MQ=255) aGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCt < 1:2144177/150‑1 (MQ=255) aGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCt < 1:2144226/150‑1 (MQ=255) aaTATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCt > 1:2887834/1‑150 (MQ=255) aaTATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCt < 1:2066738/150‑1 (MQ=255) atatatTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTg > 1:2616002/1‑150 (MQ=255) tatatTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGc > 1:1242309/1‑150 (MQ=255) ccGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCt < 1:4250657/150‑1 (MQ=255) ccGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCt < 1:1999289/150‑1 (MQ=255) gtTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAAc < 1:737397/150‑1 (MQ=255) aTCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACt > 1:3117939/1‑150 (MQ=255) cGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGa > 1:1036116/1‑150 (MQ=255) cGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGa > 1:4118010/1‑150 (MQ=255) ataAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTta > 1:3667538/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTtata > 2:2776989/1‑150 (MQ=255) aaCGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTatat > 2:2161185/1‑150 (MQ=255) aaCGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTatat < 1:1236578/150‑1 (MQ=255) aaCATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTa > 1:3592801/1‑150 (MQ=255) ccccTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGt < 1:3921912/150‑1 (MQ=255) ccccTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGt < 1:3919318/150‑1 (MQ=255) ccccTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGt < 1:3919317/150‑1 (MQ=255) cccTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGtt > 1:1091873/1‑150 (MQ=255) cTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAGATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTcc < 1:1678118/150‑1 (MQ=255) cTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTcc < 1:1678737/150‑1 (MQ=255) cTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTcc < 1:1678617/150‑1 (MQ=255) tttGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAAt < 1:294062/150‑1 (MQ=255) ttgttgCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATc < 1:3939838/150‑1 (MQ=255) ttgttgCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATc < 1:3939836/150‑1 (MQ=255) tgCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCggg < 1:3745709/150‑1 (MQ=255) tgCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCggg < 1:2351838/150‑1 (MQ=255) aTAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTg < 2:855153/150‑1 (MQ=255) tAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTgg > 1:3861059/1‑150 (MQ=255) aGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTa < 1:2736344/150‑1 (MQ=255) aGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTa < 1:2736356/150‑1 (MQ=255) tATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTCAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGc > 2:923312/1‑150 (MQ=255) aTTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCa < 2:2115000/150‑1 (MQ=255) tAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCg < 1:4268313/150‑1 (MQ=255) tAATATTGCTGTATGCATCAGGCTGCCCTCACGCTATAGTTAACTGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCg < 1:4266324/150‑1 (MQ=255) tatTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGttt < 1:2349817/150‑1 (MQ=255) tatTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCAATAATCCGGGGCTGGTAATCAGGCATCGttt > 2:2089673/1‑150 (MQ=255) ttATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTc > 1:3494854/1‑150 (MQ=255) ttATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTc > 1:1441551/1‑150 (MQ=255) gCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCctct < 2:2810453/150‑1 (MQ=255) gCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCctct < 2:2810238/150‑1 (MQ=255) gCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCctct < 2:2810444/150‑1 (MQ=255) gCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCctct < 2:2810462/150‑1 (MQ=255) cccTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGt < 2:2616002/150‑1 (MQ=255) ccTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTc < 1:603939/150‑1 (MQ=255) ccTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTc < 1:604364/150‑1 (MQ=255) ccTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTc < 1:604401/150‑1 (MQ=255) tCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAg > 2:4474785/1‑150 (MQ=255) tCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAg > 2:2236742/1‑150 (MQ=255) tCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAg < 1:1537139/150‑1 (MQ=255) cGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGc < 1:3581505/150‑1 (MQ=255) cGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGc > 1:3754572/1‑150 (MQ=255) gATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGcc > 2:976947/1‑150 (MQ=255) gATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGcc < 1:2254373/150‑1 (MQ=255) gATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGcc < 1:2254334/150‑1 (MQ=255) ataGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACt > 2:4295284/1‑150 (MQ=255) ataGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACt > 2:4184347/1‑150 (MQ=255) ataGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACt > 2:4184312/1‑150 (MQ=255) taGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTa > 2:3347515/1‑150 (MQ=255) gTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTAtt > 2:843892/1‑150 (MQ=255) gTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTAtt > 2:842271/1‑150 (MQ=255) aTGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTAccc < 2:2694179/150‑1 (MQ=255) aTGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTAccc < 2:2694211/150‑1 (MQ=255) aTGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTAccc > 2:2784871/1‑150 (MQ=255) aTGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTAccc > 2:2784644/1‑150 (MQ=255) gCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCat < 1:1188514/150‑1 (MQ=255) atatTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATAtt > 1:345529/1‑150 (MQ=255) atTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtc > 1:2699372/1‑150 (MQ=255) atTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtc > 1:2699291/1‑150 (MQ=255) atTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtc < 2:3667538/150‑1 (MQ=255) aCGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtcatc < 2:3359618/150‑1 (MQ=255) cgcgGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtcatca < 1:55557/150‑1 (MQ=255) cgcgGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtcatca < 1:1686700/150‑1 (MQ=255) cgcgGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtcatca < 1:2161185/150‑1 (MQ=255) cgcgGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtcatca < 1:55523/150‑1 (MQ=255) cgGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCaaa < 1:474148/150‑1 (MQ=255) ggACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCaaaa < 2:2817933/150‑1 (MQ=255) ggACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCaaaa < 2:2817912/150‑1 (MQ=255) ggACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCaaaa < 2:2817871/150‑1 (MQ=255) | GAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAA > CP009273/1204475‑1204764 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |