| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,251,539 | C→A | 6.0% | intergenic (‑131/+638) | ycgV ← / ← ychF | putative adhesin/catalase inhibitor protein; ATPase, K+‑dependent, ribosome‑associated |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,251,539 | 0 | C | A | 6.0% | 1148.4 / 29.6 | 306 | intergenic (‑131/+638) | ycgV/ychF | putative adhesin/catalase inhibitor protein; ATPase, K+‑dependent, ribosome‑associated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (128/159); new base A (11/8); total (139/167) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
TGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTACAACAAACA > CP009273/1251390‑1251688 | gtgtTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATtct < 2:817859/150‑1 (MQ=255) gttTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTAtt < 2:40918/150‑1 (MQ=255) tGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTAcc > 2:1861854/1‑150 (MQ=255) ccATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCaa > 2:3164897/1‑150 (MQ=255) ccATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTATTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGATAATAATTCTCTATTACCGGGCaa > 2:2831769/1‑150 (MQ=255) aTACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCaaaa < 2:4021769/150‑1 (MQ=255) tACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAAt > 1:794175/1‑150 (MQ=255) tACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAAt > 2:1728649/1‑150 (MQ=255) tACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAAt > 2:3984817/1‑150 (MQ=255) ccACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCa < 1:4028575/150‑1 (MQ=255) aCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAgg < 1:3715773/150‑1 (MQ=255) cTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAaca < 1:394848/150‑1 (MQ=255) tatataGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAacac < 1:1632891/150‑1 (MQ=255) tataGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAg > 1:3854425/1‑150 (MQ=255) tataGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTATCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAg < 2:2105372/150‑1 (MQ=255) ataGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAgg > 2:2735137/1‑150 (MQ=255) gTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAAt < 1:756596/150‑1 (MQ=255) gTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAAt < 2:4381998/150‑1 (MQ=255) gACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAatata < 2:3823157/150‑1 (MQ=255) gACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAatata < 1:1472816/150‑1 (MQ=255) gACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAatata < 2:1920669/150‑1 (MQ=255) cTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAatatata > 2:3500891/1‑150 (MQ=255) tGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATAttt < 2:42352/150‑1 (MQ=255) tGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATAttt < 2:2348956/150‑1 (MQ=255) tGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATAttt > 2:4142550/1‑150 (MQ=255) ggTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTaa < 1:930580/150‑1 (MQ=255) gTCTGTGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTaaa > 2:3834016/1‑149 (MQ=255) cTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACAt < 1:3183555/150‑1 (MQ=255) cTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACAt > 1:1382913/1‑150 (MQ=255) cTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACAt < 1:2993813/150‑1 (MQ=255) tGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATccc < 2:1491423/150‑1 (MQ=255) tGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGAAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATccc > 1:4430572/1‑150 (MQ=255) ggATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATcccc > 1:3473804/1‑150 (MQ=255) gATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATccccc < 1:3530981/150‑1 (MQ=255) gATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATccccc > 1:691148/1‑150 (MQ=255) gATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATccccc < 2:1426975/150‑1 (MQ=255) gATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTATCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATccccc > 2:1077693/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCt > 1:2403557/1‑150 (MQ=255) tGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACa > 1:4515812/1‑150 (MQ=255) tCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACaaa > 2:4537057/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAgg > 1:4330285/1‑150 (MQ=255) gTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGt > 1:3598219/1‑150 (MQ=255) tAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTta > 2:2547209/1‑150 (MQ=255) aaTCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTtata < 1:3002287/150‑1 (MQ=255) aTCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTatat > 2:2719/1‑150 (MQ=255) tCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATc < 2:673792/150‑1 (MQ=255) tCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATc < 1:4414472/150‑1 (MQ=255) tCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATc > 2:369966/1‑150 (MQ=255) aaTGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGa > 2:851065/1‑150 (MQ=255) aaTGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGa < 1:1963946/150‑1 (MQ=255) aTGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAg < 1:1986817/150‑1 (MQ=255) aataTCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTc < 1:3067641/150‑1 (MQ=255) tCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTa > 1:1143414/1‑150 (MQ=255) tCCTATTATCATCATGATATTTGGATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTa < 1:328549/150‑1 (MQ=255) ccTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTaa < 1:788712/150‑1 (MQ=255) ctctTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAg < 1:1243399/150‑1 (MQ=255) ctctTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAg < 1:2717628/150‑1 (MQ=255) atcatGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGtt > 1:263159/1‑150 (MQ=255) tcatGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTa < 2:4327389/150‑1 (MQ=255) catGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGATCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTAc < 2:2546402/150‑1 (MQ=255) catGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTAc < 1:4266436/150‑1 (MQ=255) atGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACt > 2:3048000/1‑150 (MQ=255) tGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACtt < 1:134804/150‑1 (MQ=255) tGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACtt < 1:3506766/150‑1 (MQ=255) gATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTa > 2:3814407/1‑150 (MQ=255) atatTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTAt < 2:2077634/150‑1 (MQ=255) atatTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTAt > 1:3119745/1‑150 (MQ=255) atTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTc > 1:1923182/1‑150 (MQ=255) atTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTATCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTc > 2:2751217/1‑150 (MQ=255) ttGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCa < 2:1552238/150‑1 (MQ=255) ttGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCa < 2:3299453/150‑1 (MQ=255) tGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGTACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTAGTCCaa < 2:4404130/150‑1 (MQ=255) tGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTATCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCaa < 1:2184758/150‑1 (MQ=255) gTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAAt > 1:33060/1‑150 (MQ=255) tGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCg > 1:2212222/1‑150 (MQ=255) ggTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGt > 2:1123676/1‑150 (MQ=255) tGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTa < 2:3534552/150‑1 (MQ=255) cAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACt < 1:4089498/150‑1 (MQ=255) aaTCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACta > 2:3780632/1‑150 (MQ=255) aTCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACtat > 2:2450419/1‑150 (MQ=255) aTCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACtat < 2:2319156/150‑1 (MQ=255) aTCATGATGAGCTTATCAGACAATAATTCTCTATTATCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACtat < 2:2913200/150‑1 (MQ=255) tCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGAGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACtata > 2:554591/1‑150 (MQ=255) tCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTATCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACtata < 1:2858771/150‑1 (MQ=255) cATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATaa > 1:1052095/1‑150 (MQ=255) tgatgaGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAat < 2:1319879/150‑1 (MQ=255) atgaGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAatat < 1:1617584/150‑1 (MQ=255) gaGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCACTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATgg > 1:4025595/1‑150 (MQ=255) gCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCa < 1:43480/150‑1 (MQ=255) ttCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCaaa > 2:3828951/1‑150 (MQ=255) tctcAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCaaaa < 1:1637060/150‑1 (MQ=255) tctcAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCaaaa < 1:2334612/150‑1 (MQ=255) ctcAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCaaaaa < 2:2406195/150‑1 (MQ=255) agagAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTGCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAatat > 1:3685083/1‑150 (MQ=255) agaATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTa > 1:2148157/1‑150 (MQ=255) aataatTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTaca < 2:3598219/150‑1 (MQ=255) aatTATCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTacaaca > 2:4327995/1‑150 (MQ=255) ttCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTACaacaaa < 1:1872780/150‑1 (MQ=255) tctcTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATCTTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTACaacaaac < 2:4227188/150‑1 (MQ=255) tctcTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTACaacaaac < 2:371175/150‑1 (MQ=255) | TGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTCTTATCATCATGATATTTGTATGGTGCAATCATGATGAGCTTCTCAGAGAATAATTCTCTATTACCGGGCAAAATCAGGAACACAGGAATTAATATATATTTAACATCCCCCTTACAAAGGTGAGTTTATATCGAGTTATTCCCTAAGTTGTCGTTACTTATTCCAATTCGTTACTATAAATATGGCAAAAATATTACAACAAACA > CP009273/1251390‑1251688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |