| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,360,489 | G→T | 12.0% | C228F (TGC→TTC) | puuE → | 4‑aminobutyrate aminotransferase, PLP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,360,489 | 0 | G | T | 12.0% | 755.3 / 54.2 | 222 | C228F (TGC→TTC) | puuE | 4‑aminobutyrate aminotransferase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (119/76); new base T (15/12); total (134/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
AACACAGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCTTTCGGGC > CP009273/1360340‑1360637 | aaCACAGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCtgtg < 2:244428/150‑1 (MQ=255) acacATGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGACGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGGTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGc > 2:1655768/1‑150 (MQ=255) cacaGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTATATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGcg < 1:2537567/150‑1 (MQ=255) acaGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGcga > 1:1670804/1‑150 (MQ=255) caGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGcgac < 2:291342/150‑1 (MQ=255) aGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTTcgacg > 2:1467028/1‑150 (MQ=255) aGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGAGTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCACAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTTcgacg > 2:3648150/1‑150 (MQ=255) aGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCATGTTTAAATCAGACAACGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATATTCGAACCGGAGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCAGCCTGTTcgacg > 2:1467541/1‑150 (MQ=255) gACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTTCGACGAg < 1:2689226/150‑1 (MQ=255) cccTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACg > 2:2027530/1‑150 (MQ=255) ccTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGAGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCAGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACgg > 1:3281998/1‑150 (MQ=255) cTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGt > 1:2395361/1‑150 (MQ=255) cTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGt > 1:2395770/1‑150 (MQ=255) cGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACTGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTAt > 1:2409958/1‑150 (MQ=255) gACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCACCGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTAtt < 1:806196/150‑1 (MQ=255) gACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTAtt < 1:806275/150‑1 (MQ=255) ccATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGtga > 1:284896/1‑150 (MQ=255) cATCGAACGCTTGTTTACATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGtgat < 2:2952530/150‑1 (MQ=255) aTCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGtgatg > 1:3183303/1‑150 (MQ=255) gAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGAtt < 1:3471860/150‑1 (MQ=255) gAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGAtt > 2:437020/1‑150 (MQ=255) gAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGAtt < 1:442017/150‑1 (MQ=255) gAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGAtt < 1:442006/150‑1 (MQ=255) cGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCt > 1:3874056/1‑150 (MQ=255) cGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCt < 2:3959045/150‑1 (MQ=255) cGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCt > 2:4426276/1‑150 (MQ=255) ttGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCtgat > 2:2352352/1‑150 (MQ=255) tGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCtgatg > 2:3903033/1‑150 (MQ=255) tttAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGaa > 1:1090831/1‑150 (MQ=255) tAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGt > 2:389672/1‑150 (MQ=255) aaaTCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTg > 1:2418549/1‑150 (MQ=255) aTCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCa < 2:2635278/150‑1 (MQ=255) cAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCaaa > 1:4204804/1‑150 (MQ=255) aCATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTTCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGTAGTGCAAAGCg > 2:343878/1‑150 (MQ=255) aCATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCg > 1:2695963/1‑150 (MQ=255) aTCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTTCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGc < 1:2821947/150‑1 (MQ=255) gaagcgaagcAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCttt > 2:4486876/1‑150 (MQ=255) gaagcgaagcAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGAGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCttt > 2:3082618/1‑150 (MQ=255) gaagcgaagcAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGAGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCttt > 2:3083195/1‑150 (MQ=255) aGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCg < 1:3900668/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAATAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTTCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTa > 2:105315/1‑150 (MQ=255) ggcggcGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTaa > 2:3828766/1‑150 (MQ=255) gcggcgATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAg < 2:61231/150‑1 (MQ=255) 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attTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGcc > 1:180005/1‑150 (MQ=255) ttttCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCa < 1:1044748/150‑1 (MQ=255) ttCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATg < 2:3940163/150‑1 (MQ=255) ttCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATg < 2:3940150/150‑1 (MQ=255) tCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATgg > 2:811953/1‑150 (MQ=255) 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cGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGAc > 1:2910291/1‑150 (MQ=255) cGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGAc > 2:1817962/1‑150 (MQ=255) cGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGAATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCCTGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGAc > 2:1817943/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCAAGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGAt < 2:230383/150‑1 (MQ=255) cAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGa > 2:192926/1‑150 (MQ=255) gagCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGc > 1:3328676/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCt < 1:452317/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTcgcg > 1:4353306/1‑150 (MQ=255) cTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGa > 1:1109852/1‑150 (MQ=255) tATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGAt < 2:1597393/150‑1 (MQ=255) tATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGAt < 2:3859942/150‑1 (MQ=255) aTTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATg < 1:4212570/150‑1 (MQ=255) aTTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATg > 2:3316161/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGcc < 1:3707085/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGcc < 2:3520605/150‑1 (MQ=255) cgccgcCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCg > 1:897601/1‑150 (MQ=255) gccTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAATAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCttt > 1:2220003/1‑150 (MQ=255) gccTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCttt < 2:254809/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCTTTCg < 1:3511634/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCTTTCg < 2:235487/150‑1 (MQ=255) tgCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCTTTCGGGc > 1:2320242/1‑150 (MQ=255) tgCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCTTTCGGGc > 1:2320361/1‑150 (MQ=255) | AACACAGGACTCCCTCGACGCCATCGAACGCTTGTTTAAATCAGACATCGAAGCGAAGCAGGTGGCGGCGATTATTTTCGAACCGGTGCAGGGCGAGGGCGGTTTCAACGTTGCGCCAAAAGAGCTGGTTGCCGCTATTCGCCGCCTGTGCGACGAGCACGGTATTGTGATGATTGCTGATGAAGTGCAAAGCGGCTTTGCGCGTACCGGTAAGCTGTTTGCCATGGATCATTACGCCGATAAGCCGGATTTAATGACGATGGCGAAAAGCCTCGCGGGCGGGATGCCGCTTTCGGGC > CP009273/1360340‑1360637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |