| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,521,126 | G→A | 8.4% | intergenic (+5/‑71) | yncG → / → yncH | glutathione S‑transferase homolog/IPR020099 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,521,126 | 0 | G | A | 8.4% | 1020.0 / 60.4 | 310 | intergenic (+5/‑71) | yncG/yncH | glutathione S‑transferase homolog/IPR020099 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (129/155); new base A (14/12); total (143/167) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
GACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAACTAAC > CP009273/1520978‑1521273 | gACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGa > 1:557292/1‑150 (MQ=255) tATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCag < 2:241632/150‑1 (MQ=255) ttGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGAt > 1:2001470/1‑150 (MQ=255) ttcACTATGAGCACATGGGGGCCTGGGCTTGAATGTTTTCTGGATAATGCCACGAATATCAGTTCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACTAGAAGTTTTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGAtt < 2:2510299/148‑1 (MQ=255) tGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGAtt > 1:10015/1‑150 (MQ=255) tGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGAtt < 2:1326195/150‑1 (MQ=255) gCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTa > 1:1248300/1‑150 (MQ=255) aCTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATg < 2:615266/150‑1 (MQ=255) tATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTTCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGtt < 2:3231312/150‑1 (MQ=255) tATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGtt < 2:1668675/150‑1 (MQ=255) cgcACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttattt > 1:3468874/1‑150 (MQ=255) gcACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttattta < 2:874207/150‑1 (MQ=255) gcACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttattta < 2:3043691/150‑1 (MQ=255) acaTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTtatttatt < 1:1675973/150‑1 (MQ=255) acaTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTtatttatt < 1:1674677/150‑1 (MQ=255) acaTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTtatttatt < 2:1633062/150‑1 (MQ=255) caTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATttatta < 1:3936359/150‑1 (MQ=255) caTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATttatta < 1:2053804/150‑1 (MQ=255) aTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTtattat > 1:2853100/1‑150 (MQ=255) aTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTtattat < 2:2566010/150‑1 (MQ=255) aTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGACACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTtattat < 2:761584/150‑1 (MQ=255) tGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTattatt > 1:3131713/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTaa > 1:4354355/1‑150 (MQ=255) tGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACt > 1:2538517/1‑150 (MQ=255) gggCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACtt < 2:3310843/150‑1 (MQ=255) gggCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACtt < 1:4404811/150‑1 (MQ=255) tGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACaa > 2:3401220/1‑150 (MQ=255) gTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatg < 1:3670800/150‑1 (MQ=255) tttCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatga > 1:1886104/1‑150 (MQ=255) ggATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGc < 2:243486/150‑1 (MQ=255) tAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGta < 2:2854479/150‑1 (MQ=255) tAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGta > 2:1961397/1‑150 (MQ=255) tAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGta > 1:1707320/1‑150 (MQ=255) tAATGCAACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGta > 1:3965422/1‑150 (MQ=255) aaTGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaa > 2:1110691/1‑150 (MQ=255) gAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAAttaattaa < 2:1148025/150‑1 (MQ=255) gAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAAttaattaa > 1:2527837/1‑150 (MQ=255) aaTATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTGGAGAGGGATACCAGAATATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTaaa > 1:3696443/1‑150 (MQ=255) aGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATg < 2:2144772/150‑1 (MQ=255) tGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGt < 2:1060524/150‑1 (MQ=255) tGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGt < 2:3492674/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTAt < 1:2312168/150‑1 (MQ=255) gATTGCTGATGCTGTATGTCATTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACACTGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATg < 2:2777475/150‑1 (MQ=255) ttGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGtt < 2:3468827/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGtttttt < 2:2903963/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGtttttt > 2:1874998/1‑150 (MQ=255) gATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTa > 1:1602635/1‑150 (MQ=255) gATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTa > 2:3645298/1‑150 (MQ=255) gCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAtt < 2:3947918/150‑1 (MQ=255) cTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAttt < 2:3718699/150‑1 (MQ=255) tATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTtata > 1:222033/1‑150 (MQ=255) aTGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTatat < 2:4058319/150‑1 (MQ=255) aTGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTatat < 2:1807972/150‑1 (MQ=255) tGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATc < 1:2955089/150‑1 (MQ=255) tGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATc < 1:1485962/150‑1 (MQ=255) tCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCAc < 2:3072524/150‑1 (MQ=255) aGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCActc > 1:1400714/1‑150 (MQ=255) aGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCActc > 1:4383925/1‑150 (MQ=255) ccGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtt > 2:660357/1‑150 (MQ=255) ccGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtt < 1:3401220/150‑1 (MQ=255) ccGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtt > 1:726547/1‑150 (MQ=255) cGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGc > 2:439253/1‑100 (MQ=255) cGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGc > 2:440495/1‑100 (MQ=255) cGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCttt < 2:3131713/150‑1 (MQ=255) gAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCAATCTCCtttt > 2:2671952/1‑150 (MQ=255) aaaTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGTTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCATTttc > 2:3066349/1‑150 (MQ=255) aaaTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttc > 2:847607/1‑150 (MQ=255) aaaTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGGAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttc > 2:4382394/1‑150 (MQ=255) aaTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttca > 1:1517195/1‑150 (MQ=255) ttACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcatt > 2:1503704/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAg > 2:1468610/1‑150 (MQ=255) aagaagTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGc < 1:1956618/150‑1 (MQ=255) aagaagTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGc < 1:2186546/150‑1 (MQ=255) agaagTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCg > 2:2769732/1‑150 (MQ=255) agaagTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGAGGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCAGTCAGCg > 2:4524378/1‑150 (MQ=255) agTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCgtgt < 1:1701700/150‑1 (MQ=255) tATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCt < 2:2552610/150‑1 (MQ=255) tATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCt > 2:1657886/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATAACACTCATTTTCATTCAGCGTGTCTat > 2:1214063/1‑150 (MQ=255) tAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatt > 1:851799/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTattt < 1:4533564/150‑1 (MQ=255) aaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttc < 2:3028281/150‑1 (MQ=255) aaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttcat < 1:488315/150‑1 (MQ=255) ggAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttcattt < 2:1586810/150‑1 (MQ=255) aaTGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTcc > 1:3297578/1‑150 (MQ=255) aaTGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTcc < 1:2431681/150‑1 (MQ=255) aTGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCct < 1:2446073/150‑1 (MQ=255) tGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCctc < 1:509170/150‑1 (MQ=255) tGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCctc < 1:2550731/150‑1 (MQ=255) cattattTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGa < 2:4159812/149‑1 (MQ=255) tattTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGaaaa > 2:2367822/1‑150 (MQ=255) tattTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTGATTATTCAGTAACTTTATCCACACTGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGaaaa < 2:90983/150‑1 (MQ=255) attTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAg < 1:1918282/150‑1 (MQ=255) tttGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGa < 2:2657237/150‑1 (MQ=255) gAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaac < 2:2037083/150‑1 (MQ=255) aGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaact > 1:4424121/1‑150 (MQ=255) aGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaact > 1:1824392/1‑150 (MQ=255) gTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaacta < 1:1572063/150‑1 (MQ=255) gTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaacta < 1:3831219/150‑1 (MQ=255) gggATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaactaac < 2:2967742/150‑1 (MQ=255) | GACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAACTAAC > CP009273/1520978‑1521273 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |