| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,603,750 | 0 | C | A | 7.3% | 826.9 / 26.7 | 222 | L396F (TTG→TTT) | uxaB | altronate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (91/114); new base A (9/8); total (100/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
TTTTCTGCCAAAACAATCGCTACCAGTTCCTGGGTGCCGATAACACGGTCACGATGCTGGCTCCAGAGTTGCTGATAACGTTCCAGCCAGTGTGCATCGTCCTGTACCGGATATGTTTCGCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAA > CP009273/1603601‑1603899 | ttttCTGCCAAAACAATAGCTACCAGTTCCTGGGTGCCGATAACACGGTCACGATGCTGGCTCCAGAGTTGCTGATAACGTTCCAGCCAGTGTGCATCGTCCTGTACCGGATATGTTTCGCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGcaatc < 1:1727176/150‑1 (MQ=255) cTGCCAAAACAATCGCTACCAGTTCCTGGGTGCCGATAACACGGTCACGATGCTGGCTCCAGAGTTGCTGATAACGTTCCAGCCAGTGTGCATCGTCCTGTACCGGATATGTTTCGCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATg > 1:1764836/1‑150 (MQ=255) cTGCCAAAACAATCGCTACCAGTTCCTGGGTGCCGATAACACGGTCACGATGCTGGCTCCAGAGTTGCTGATAACGTTCCAGCCAGTGTGCATCGTCCTGTACCGGATATGTTTCGCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATg > 1:4371073/1‑150 (MQ=255) 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cGCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAca < 1:1508143/150‑1 (MQ=255) cGCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAca < 1:4468099/150‑1 (MQ=255) cGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAcagca < 1:1061063/150‑1 (MQ=255) tACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTGTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCt < 2:4065705/150‑1 (MQ=255) aCGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTg < 2:825527/150‑1 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGa < 1:4081103/150‑1 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGa < 1:3792654/150‑1 (MQ=255) tCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGc > 1:1783551/1‑150 (MQ=255) accacGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCtt > 2:2685287/1‑150 (MQ=255) cGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATg > 1:2662609/1‑150 (MQ=255) 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caatcaatGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTAc > 2:1173562/1‑150 (MQ=255) caatGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGaa < 2:4247809/150‑1 (MQ=255) | TTTTCTGCCAAAACAATCGCTACCAGTTCCTGGGTGCCGATAACACGGTCACGATGCTGGCTCCAGAGTTGCTGATAACGTTCCAGCCAGTGTGCATCGTCCTGTACCGGATATGTTTCGCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAA > CP009273/1603601‑1603899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |