| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 134,652 | G→T | 13.1% | M361I (ATG→ATT) | cueO → | multicopper oxidase (laccase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 134,652 | 0 | G | T | 13.1% | 777.7 / 62.7 | 234 | M361I (ATG→ATT) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (86/117); new base T (15/16); total (101/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134508‑134800 | tCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATCTGATggg > 2:2141591/1‑150 (MQ=255)tCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATggg > 2:2141620/1‑150 (MQ=255)tCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATggg < 2:4394136/150‑1 (MQ=255) cGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGc < 1:2007573/150‑1 (MQ=255) aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACTCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 2:2556856/1‑150 (MQ=255) aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 1:4365827/1‑150 (MQ=255) aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 2:276597/1‑150 (MQ=255) aTGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATg > 1:1811946/1‑150 (MQ=255) tGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGc < 1:3310177/150‑1 (MQ=255) tGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGc < 1:3310023/150‑1 (MQ=255) cGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCTTTGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTa < 1:1242665/150‑1 (MQ=255) cGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTa < 1:926998/150‑1 (MQ=255) gATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAAt < 2:1539934/150‑1 (MQ=255) gATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAAt < 2:558534/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATgg < 1:187976/150‑1 (MQ=255) aGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCATGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGgaga < 1:2590296/150‑1 (MQ=255) ccGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGaaa > 2:1750150/1‑150 (MQ=255) ccGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGaaa < 2:3782554/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAat < 2:692361/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAat > 2:3822467/1‑150 (MQ=255) cGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAat < 2:2971356/150‑1 (MQ=255) gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 1:44424/1‑150 (MQ=255) gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 1:3725725/1‑150 (MQ=255) gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 2:2336510/1‑150 (MQ=255) gATAGCTATTAGTGACACCGGTGCTTTGCCATACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTACGCTGGAAGGGCTGACGGTACGAAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTAGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 2:2587491/1‑150 (MQ=255) aTTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAatat < 1:2463430/150‑1 (MQ=255) ttGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATg < 2:2766846/150‑1 (MQ=255) tGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATgg < 1:4226605/150‑1 (MQ=255) ttAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATc > 1:1536797/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAg > 1:704515/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAgg < 1:875288/150‑1 (MQ=255) ccTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGa > 2:573053/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGcc < 1:3907727/150‑1 (MQ=255) tGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTAAGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCgg > 1:1796998/1‑150 (MQ=255) tttGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggat < 1:2888804/150‑1 (MQ=255) aGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTAGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATca > 1:3690599/1‑150 (MQ=255) gACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATcac < 1:4020724/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCa < 1:1829038/150‑1 (MQ=255) tAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAga > 2:1159645/1‑150 (MQ=255) tAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAga > 2:1159715/1‑150 (MQ=255) aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat < 2:615538/150‑1 (MQ=255) gTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatga > 1:21512/1‑150 (MQ=255) gTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatga > 1:2280024/1‑150 (MQ=255) tAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTCATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatgat > 2:1078593/1‑150 (MQ=255) tAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatgat > 2:243944/1‑150 (MQ=255) aGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGatgatg > 2:1909359/1‑150 (MQ=255) aGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGatgatg > 1:1954770/1‑150 (MQ=255) gcctgcctGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATgg < 2:4133144/150‑1 (MQ=255) ccttcGTTACATTCGCTTGAAGGGCTGTCGGTACGAAAGCTGCAACTCTCTCTGGACCCTATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTACTGGAGAAAGATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGTTCACAGCCAGATGATTGGCCat < 2:1856879/150‑1 (MQ=255) cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 1:2664034/1‑150 (MQ=255) cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 1:2663791/1‑150 (MQ=255) cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat < 1:1929592/150‑1 (MQ=255) cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat < 2:4225621/150‑1 (MQ=255) ctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCata < 2:3819532/150‑1 (MQ=255) ctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCata > 1:2758695/1‑150 (MQ=255) gcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATg < 2:708771/150‑1 (MQ=255) gTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATggg < 2:365851/150‑1 (MQ=255) ttACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGTGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATgggg < 2:223472/150‑1 (MQ=255) aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa > 1:3653873/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa < 1:691735/150‑1 (MQ=255) ccTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCAc > 2:330821/1‑150 (MQ=255) cGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCa < 2:2405180/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCaa > 2:4174718/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATg < 2:2065899/150‑1 (MQ=255) gggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAAt < 2:21512/150‑1 (MQ=255) gggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAAt < 2:2280024/150‑1 (MQ=255) ggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATc < 2:1359190/150‑1 (MQ=255) ggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATc < 2:48329/150‑1 (MQ=255) cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 2:2368048/150‑1 (MQ=255) cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 1:167892/150‑1 (MQ=255) cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 1:167581/150‑1 (MQ=255) tGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGGTCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCata > 1:2403995/1‑150 (MQ=255) aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg < 1:2168354/150‑1 (MQ=255) aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg < 2:4210722/150‑1 (MQ=255) ggTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGaa < 1:2763899/150‑1 (MQ=255) cGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAc < 2:2283033/150‑1 (MQ=255) gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:2972285/150‑1 (MQ=255) gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg > 1:2204661/1‑150 (MQ=255) gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:1780022/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcgg > 2:2583509/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcgg > 2:1098578/1‑150 (MQ=255) aaGCTGCACCTCTCGATGGACCCTATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATTGCGATCAGGCGATGGCCGTGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggc < 2:4281701/150‑1 (MQ=255) tGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGa < 2:278437/150‑1 (MQ=255) tGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGa < 2:2576067/150‑1 (MQ=255) gCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGaa < 1:1000678/150‑1 (MQ=255) cAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAg < 2:4365827/150‑1 (MQ=255) ctctctATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTc < 1:967745/150‑1 (MQ=255) ctctATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGa > 2:3528266/1‑150 (MQ=255) tATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGAttt < 2:3388894/150‑1 (MQ=255) cccGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTccacca < 1:87497/150‑1 (MQ=255) ccGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCAt < 1:3034169/150‑1 (MQ=255) cGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATg < 1:3439616/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGcc > 2:2308170/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGcc > 2:1446274/1‑150 (MQ=255) tGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCca < 1:2960934/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCca > 1:3101239/1‑150 (MQ=255) gCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCcaa > 1:747801/1‑150 (MQ=255) gATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACaaa > 1:1487920/1‑150 (MQ=255) atatGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACaaaa < 1:3391236/150‑1 (MQ=255) tgatgGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCa > 2:2927028/1‑150 (MQ=255) | TCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134508‑134800 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |