| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 137,779 | T→A | 8.0% | intergenic (‑67/‑139) | gcd ← / → hpt | glucose dehydrogenase/hypoxanthine phosphoribosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 137,779 | 0 | T | A | 8.0% | 901.1 / 51.0 | 276 | intergenic (‑67/‑139) | gcd/hpt | glucose dehydrogenase/hypoxanthine phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (107/147); new base A (10/12); total (117/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
AGTAGATACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATAC > CP009273/137630‑137928 | aGTAGATACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGAt > 1:2453213/1‑150 (MQ=255) gTAGATACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATc < 2:1674962/150‑1 (MQ=255) aGATACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGt > 1:3615618/1‑150 (MQ=255) aGATACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGt > 2:3869718/1‑150 (MQ=255) aTACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGtca < 2:1441410/150‑1 (MQ=255) aTACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGAACGtca > 2:2567538/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTc < 2:475533/150‑1 (MQ=255) gCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTc < 1:1047103/150‑1 (MQ=255) cAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCg > 2:3198914/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGa < 1:3823022/150‑1 (MQ=255) aaGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAg < 2:459542/150‑1 (MQ=255) aGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGc < 1:1113806/150‑1 (MQ=255) aGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGc < 1:2957063/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCt < 1:3278646/150‑1 (MQ=255) tGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTttat < 1:2750886/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTttatta > 2:2014613/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTttatta > 2:606613/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTttatta < 1:767185/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTttatta < 1:767108/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGAACGTCATCACAATTCGAGCTttatta > 1:2736048/1‑150 (MQ=255) aaaaGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAAc > 2:2494235/1‑150 (MQ=255) ggCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGAtt < 2:4006868/150‑1 (MQ=255) gCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTc < 2:2681361/150‑1 (MQ=255) tGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCcg < 2:1324762/150‑1 (MQ=255) ttAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCcgcg > 1:3576910/1‑150 (MQ=255) ttAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCcgcg > 1:3575250/1‑150 (MQ=255) gagTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCgaat < 2:2611142/148‑1 (MQ=255) gCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCgaat < 1:1393565/150‑1 (MQ=255) gTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCgaatga < 2:4232620/150‑1 (MQ=255) cGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAg > 2:3123417/1‑150 (MQ=255) gAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGt < 2:1175979/150‑1 (MQ=255) gAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGt > 1:247403/1‑150 (MQ=255) aGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGtt < 2:1973387/150‑1 (MQ=255) cgtcgCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTg > 1:483079/1‑150 (MQ=255) gtcgCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTgg > 1:1482576/1‑150 (MQ=255) gtcgCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGAACGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTgg > 2:4318468/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGAACGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGta > 1:1027015/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGtat < 1:4187492/150‑1 (MQ=255) ccTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGc < 2:2106566/150‑1 (MQ=255) ccTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGc < 2:2107479/150‑1 (MQ=255) ccTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGc > 1:3738145/1‑150 (MQ=255) cTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCg < 2:2099128/150‑1 (MQ=255) gTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCgtg < 1:3605576/150‑1 (MQ=255) aTTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTc > 2:3337761/1‑150 (MQ=255) tGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGAACGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCtt < 1:2567538/150‑1 (MQ=255) gTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTg > 1:3189823/1‑150 (MQ=255) aTTGCCATAAAGAGACACCCTTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCt < 2:44420/150‑1 (MQ=255) ttGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCtt > 2:1764412/1‑150 (MQ=255) ttGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCtt < 1:1245128/150‑1 (MQ=255) ttGCCATAAAGAGACACCATGTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATGAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCtt < 1:1245014/150‑1 (MQ=255) aaaGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCg > 1:4525949/1‑150 (MQ=255) aaGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTCATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGACTGAATAGATTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCgg > 2:4141034/1‑150 (MQ=255) aaGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCgg > 2:921198/1‑150 (MQ=255) agagACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGt < 1:3337689/150‑1 (MQ=255) agagACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGt > 1:4187840/1‑150 (MQ=255) gagaCACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGAACGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTg > 1:4110098/1‑150 (MQ=255) aTTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAAcc > 1:2183512/1‑150 (MQ=255) aTTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCg < 2:2863313/150‑1 (MQ=255) aTTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTGTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGCGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCg < 2:2336073/150‑1 (MQ=255) aTTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCg < 2:2030413/150‑1 (MQ=255) tAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGaa > 2:2336956/1‑150 (MQ=255) tatTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTg > 1:3653325/1‑150 (MQ=255) tatTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTg < 1:1571621/150‑1 (MQ=255) tatTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTg < 2:3166269/150‑1 (MQ=255) tatTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTg < 2:4087488/150‑1 (MQ=255) tatTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTg < 1:4484086/150‑1 (MQ=255) tatTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTg > 2:2267966/1‑150 (MQ=255) atTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGa > 1:433925/1‑150 (MQ=255) atTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGa < 1:479676/150‑1 (MQ=255) ttttAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGAt < 2:247403/150‑1 (MQ=255) gtagCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGtt > 1:3123793/1‑150 (MQ=255) gtagCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGtt > 1:3123367/1‑150 (MQ=255) gCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGttttt < 2:244384/150‑1 (MQ=255) gCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGttttt < 1:1645855/150‑1 (MQ=255) gCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGttttt < 1:3566190/150‑1 (MQ=255) attaattaTAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTaaa > 1:1022701/1‑150 (MQ=255) ttaattaTAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAAt < 1:1029672/150‑1 (MQ=255) ttaattaTAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAAt > 1:2821512/1‑150 (MQ=255) ttaattaTAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAAt > 1:1192026/1‑150 (MQ=255) ttaattaTAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAAt < 1:656360/150‑1 (MQ=255) taattaTAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATc > 2:1513151/1‑150 (MQ=255) taattaTAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATc > 2:2807434/1‑150 (MQ=255) ataGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATg > 1:2870904/1‑150 (MQ=255) ataGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATg < 1:2977209/150‑1 (MQ=255) ataGGTTTTAACATGTGTGAACGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATg < 2:3530664/150‑1 (MQ=255) taGGTTTTAACATGCGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATgg < 2:3118424/150‑1 (MQ=255) ttttAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTag < 1:4502725/150‑1 (MQ=255) tttAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTaga < 1:3495514/150‑1 (MQ=255) ttAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAATAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTagag < 2:868618/150‑1 (MQ=255) aCATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGata > 1:4023923/1‑150 (MQ=255) aCATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGata > 2:1108012/1‑150 (MQ=255) cATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGatat > 1:3573572/1‑150 (MQ=255) cATGTGTGATAGTAATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGatat < 1:1696042/150‑1 (MQ=255) aTGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATg < 1:1824186/150‑1 (MQ=255) ttgATCGTCATCACAAGTCGAGATTTATTTACAGATTCCGCTAATGAATAGTTTTTCTTTTATACTGCGTGTATTGCGCTTTTTTGAGGTGACAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGattc < 2:1943478/149‑4 (MQ=255) gtgATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAAc < 2:3333611/150‑1 (MQ=255) gtgATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAAc > 2:1860666/1‑150 (MQ=255) gtgATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAAc < 2:2621217/150‑1 (MQ=255) gATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACAt < 2:3575251/150‑1 (MQ=255) tCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATAc < 2:3799032/150‑1 (MQ=255) | AGTAGATACAGCCCGCAAAGCGCTGCAAAAAGGGCTGTTAGCGTGACGAGTAATCGTCGCGAGCCTGTATTGTTAATTGCCATAAAGAGACACCATTTCAATTCATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATAC > CP009273/137630‑137928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |