| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,102,205 | C→A | 9.1% | V287V (GTG→GTT) | wzxB ← | putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,102,205 | 0 | C | A | 9.1% | 997.3 / 49.1 | 279 | V287V (GTG→GTT) | wzxB | putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (124/129); new base A (9/17); total (133/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
AGAGGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAG > CP009273/2102056‑2102354 | gagGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATca > 2:2856983/1‑150 (MQ=255) cGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACAcc > 1:3249261/1‑150 (MQ=255) cGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACAcc > 1:970155/1‑150 (MQ=255) tataATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCtt > 1:4200342/1‑150 (MQ=255) tataATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCtt > 1:2187360/1‑150 (MQ=255) ataATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTc > 1:12700/1‑150 (MQ=255) cATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACg > 2:1270213/1‑150 (MQ=255) caATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGaa > 1:3779175/1‑150 (MQ=255) aaTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAAc > 2:2598619/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACa < 2:847752/150‑1 (MQ=255) aTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACa > 1:4318538/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACa > 1:2727975/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACa > 1:2073538/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACa < 2:2174102/150‑1 (MQ=255) aCTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGc < 2:1772740/150‑1 (MQ=255) gCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTa < 2:1086057/150‑1 (MQ=255) gCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTa < 2:2718527/150‑1 (MQ=255) cATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTAc < 2:1629748/150‑1 (MQ=255) cATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTAc < 1:3955870/150‑1 (MQ=255) aTTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACt > 1:4042901/1‑150 (MQ=255) tATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTg < 1:1389322/150‑1 (MQ=255) aTCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGa > 1:2974933/1‑150 (MQ=255) atatCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGatat > 1:1081089/1‑150 (MQ=255) atatCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGatat < 1:2490397/150‑1 (MQ=255) atCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTc > 2:3178415/1‑150 (MQ=255) tCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCt < 2:1866779/150‑1 (MQ=255) tCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCt < 2:4118522/150‑1 (MQ=255) tCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCt < 1:2640814/150‑1 (MQ=255) tCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCt > 1:2574982/1‑150 (MQ=255) tCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCt < 1:913513/150‑1 (MQ=255) cccGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAATAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCtt < 1:1046900/150‑1 (MQ=255) gCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGt > 2:3471713/1‑150 (MQ=255) cTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGtata > 2:1983033/1‑150 (MQ=255) cTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGtata > 2:4233266/1‑150 (MQ=255) tataCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTatat < 2:731879/150‑1 (MQ=255) tataCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTatat > 1:408283/1‑150 (MQ=255) taCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTg > 1:1712941/1‑150 (MQ=255) aCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGc > 2:4009275/1‑150 (MQ=255) tttttACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTggg < 2:3779744/150‑1 (MQ=255) ttACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGa < 1:2041684/150‑1 (MQ=255) ttACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGa > 1:2535811/1‑150 (MQ=255) tACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGAt < 1:3328545/150‑1 (MQ=255) tACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGAt < 1:1055020/150‑1 (MQ=255) aCTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATa > 1:2805700/1‑150 (MQ=255) tAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAgg < 2:4142799/150‑1 (MQ=255) tAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAgg < 1:832686/150‑1 (MQ=255) tataGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGAtt > 2:387602/1‑150 (MQ=255) taGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTa < 2:2780953/150‑1 (MQ=255) aGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTaa > 1:3180305/1‑150 (MQ=255) gATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAAt < 2:129165/150‑1 (MQ=255) gCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGc > 1:2287508/1‑150 (MQ=255) ccAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCtt < 1:1005702/150‑1 (MQ=255) cAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTg < 1:3827698/150‑1 (MQ=255) gagCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTCGGGTGATAGCATTTAATAGCCCTTGAAg < 1:4433858/150‑1 (MQ=255) cAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAgcgc < 2:1528031/150‑1 (MQ=255) aTTAATGAAAAAGCACCACCAATCCAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGttt < 2:3495808/150‑1 (MQ=255) aTTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGttt > 2:2239977/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTta > 1:1322316/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTta > 2:474251/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTta > 1:853301/1‑150 (MQ=255) tGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTtat > 2:2674959/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAg > 2:2469308/1‑150 (MQ=255) aaaaGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGt < 2:4454520/150‑1 (MQ=255) aaaaGCACCACCAATCAAACACAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGt < 2:3051569/150‑1 (MQ=255) aaaGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAgaa > 1:303163/1‑148 (MQ=255) caccacCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTgg > 2:998925/1‑150 (MQ=255) ccaccaATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGcc > 1:2197201/1‑150 (MQ=255) caccaATCAAACTCAAGCAGGTAAATGAATTTTTAATTATAATCACACCCTTCACACGAATAAGAACAAGCGACCTTGATAGACTGGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGACAATGAAGCCCGTTTCTTATAGTATTGGCCg > 1:4465401/1‑150 (MQ=255) aaTCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAtt < 1:927336/150‑1 (MQ=255) aTCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTa < 1:3174140/150‑1 (MQ=255) tCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTaa < 2:1699112/150‑1 (MQ=255) aaaCTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTaaaa < 1:1105913/150‑1 (MQ=255) aaCTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAAt < 1:3190134/150‑1 (MQ=255) aaCTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAAt < 2:1925209/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTc < 2:1747975/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTccc > 2:802624/1‑150 (MQ=255) cAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTccc > 2:3084298/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTGTCGTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCt > 1:1501549/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTCTATCGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTa > 2:4382514/1‑150 (MQ=255) aGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACgg < 2:70063/150‑1 (MQ=255) aGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACgg < 2:2374162/150‑1 (MQ=255) ggTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGa > 1:4489103/1‑150 (MQ=255) gTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGAc < 2:3843547/150‑1 (MQ=255) cAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGt < 2:3634167/150‑1 (MQ=255) aaTGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGtt > 1:2841755/1‑150 (MQ=255) aaTGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGtt < 2:2317085/150‑1 (MQ=255) aTGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTg < 2:4461099/150‑1 (MQ=255) gATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGt > 2:2922247/1‑150 (MQ=255) ttttAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAg < 2:2689186/150‑1 (MQ=255) ttaattaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGat < 2:404363/150‑1 (MQ=255) aattaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGTGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGatat > 2:3270355/1‑150 (MQ=255) ttaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATaa < 2:1266578/150‑1 (MQ=255) ttaaAATCACACACTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATaa < 2:2802322/150‑1 (MQ=255) taaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATAGaaa > 1:2906134/1‑150 (MQ=255) aaTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATAAAAATcc > 1:310977/1‑150 (MQ=255) aaTAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATcc < 1:1220438/150‑1 (MQ=255) aTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATccc < 2:3357519/150‑1 (MQ=255) tCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCa < 1:1661197/150‑1 (MQ=255) tCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCa < 2:3119407/150‑1 (MQ=255) cacaCCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAg < 2:3483802/150‑1 (MQ=255) | AGAGGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAG > CP009273/2102056‑2102354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |