| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,154,431 | G→T | 6.9% | L855L (CTG→CTT) | mdtC → | multidrug efflux system, subunit C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,154,431 | 0 | G | T | 6.9% | 1053.5 / 30.3 | 282 | L855L (CTG→CTT) | mdtC | multidrug efflux system, subunit C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (109/153); new base T (3/17); total (112/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.86e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
TTAACCTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGCCCCGTTCAGCCTAAT > CP009273/2154283‑2154580 | tAACCTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGAt < 2:472582/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGAtt < 2:285845/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGAtt > 1:4499470/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTa > 2:4489558/1‑150 (MQ=255) cTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATc < 2:2564662/150‑1 (MQ=255) cTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATc < 1:4334271/150‑1 (MQ=255) cTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATc < 1:2087874/150‑1 (MQ=255) tGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATcg < 2:2936348/150‑1 (MQ=255) tGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATcg < 1:3428471/150‑1 (MQ=255) ccGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTTATTATcgcc < 2:3793760/150‑1 (MQ=255) ccGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCa < 1:4217819/150‑1 (MQ=255) ggAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATc > 2:4214433/1‑150 (MQ=255) gAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCg > 2:891674/1‑150 (MQ=255) gAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCg < 1:2832930/150‑1 (MQ=255) aaTCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCa < 1:1833868/150‑1 (MQ=255) aTCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCAc > 1:3769587/1‑150 (MQ=255) gCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGgt < 1:1648693/150‑1 (MQ=255) tctcGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGgtgt < 1:3622430/150‑1 (MQ=255) tcGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGtat > 2:1637189/1‑150 (MQ=255) tcGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGtat < 2:3922932/150‑1 (MQ=255) tcGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGtat > 1:2980603/1‑150 (MQ=255) tcGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGtat > 2:766316/1‑150 (MQ=255) ggACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTatat > 2:2122743/1‑150 (MQ=255) gACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATc < 1:4313771/150‑1 (MQ=255) aCGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCg > 1:3268046/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCt < 2:412454/150‑1 (MQ=255) gTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTgg < 1:615698/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTggg > 1:1643959/1‑150 (MQ=255) gcgATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATc > 1:217514/1‑150 (MQ=255) cgatcgatCGCGCTATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTTTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATcc < 2:2386477/150‑1 (MQ=255) cgatcgatCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATcc < 1:571269/150‑1 (MQ=255) gatcgatcGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCt > 1:3130580/1‑150 (MQ=255) gatcgatcGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCt > 2:1156738/1‑150 (MQ=255) gatcgatcGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCt > 2:1986311/1‑150 (MQ=255) atcgatcgCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCtt > 1:1906580/1‑150 (MQ=255) tcgatcgCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCttt < 2:2133528/150‑1 (MQ=255) cgatcgCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTa < 1:418894/150‑1 (MQ=255) cgatcgCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTa < 1:3917767/150‑1 (MQ=255) atcgCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACg > 2:4052112/1‑150 (MQ=255) aaTGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTa > 1:3608722/1‑150 (MQ=255) aaTGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTa > 1:1337988/1‑150 (MQ=255) aTGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTAc < 2:1604433/150‑1 (MQ=255) cccAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTAc < 2:3165535/150‑1 (MQ=255) cccAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTAc < 2:2260870/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACAt < 2:150014/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACAt < 2:856260/150‑1 (MQ=255) gCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATcc < 2:341360/150‑1 (MQ=255) tGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCt < 1:4116002/150‑1 (MQ=255) gtgtGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGa < 1:1470766/150‑1 (MQ=255) tgtgCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGAc < 2:3084692/150‑1 (MQ=255) tgtgCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGAc < 2:3084529/150‑1 (MQ=255) gtgCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACg > 1:370354/1‑150 (MQ=255) tgCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGa > 1:2011366/1‑150 (MQ=255) tgCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGa > 1:2011384/1‑150 (MQ=255) ccTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGAtt > 2:702249/1‑150 (MQ=255) ttCGACGGTGCGCGGCAGTTGTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATtct < 2:2518761/150‑1 (MQ=255) tCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATtctc < 2:3738869/150‑1 (MQ=255) cGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATtctct < 1:2251509/150‑1 (MQ=255) gACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATtctctc > 1:3094275/1‑150 (MQ=255) aCGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTcc < 2:1245284/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCAc < 1:257076/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCAc < 2:1463303/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTTATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCt < 1:4451670/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCt < 2:3058099/150‑1 (MQ=255) cgcgGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTTATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTg < 1:2502887/150‑1 (MQ=255) cgGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGcc < 2:3728745/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGccc > 2:316448/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGccc > 2:2679475/1‑150 (MQ=255) aGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTcg < 2:1347233/150‑1 (MQ=255) tttGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTcggcg < 1:817699/150‑1 (MQ=255) tttGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTcggcg > 1:2759977/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCggcggg > 1:33803/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCggcggg > 1:31115/1‑150 (MQ=255) cGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGt > 2:1084881/1‑150 (MQ=255) ggCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTTATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGtt > 2:749760/1‑150 (MQ=255) gCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTg < 1:754116/150‑1 (MQ=255) cGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAg < 2:2302686/150‑1 (MQ=255) cGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAg > 1:1573810/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAgc > 1:3506849/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAgc > 1:2228324/1‑150 (MQ=255) gtgtTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTg < 2:1489886/150‑1 (MQ=255) gtgtTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTg < 2:3019907/150‑1 (MQ=255) gtTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGgc > 1:1393508/1‑150 (MQ=255) gtTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTATATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGgc > 2:2096403/1‑150 (MQ=255) ccAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATGATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCt < 2:3330699/150‑1 (MQ=255) aGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTgg > 2:1210283/1‑150 (MQ=255) gagaCGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAg < 1:1111614/150‑1 (MQ=255) agaCGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGc > 2:648641/1‑150 (MQ=255) gaCGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCt < 2:41088/150‑1 (MQ=255) gaCGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCt < 1:1024261/150‑1 (MQ=255) gaCGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCt > 2:782719/1‑150 (MQ=255) cGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGAGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGt > 1:2934249/1‑150 (MQ=255) gATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGtt < 1:270380/150‑1 (MQ=255) tCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGcc < 2:526516/150‑1 (MQ=255) cGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGccc > 1:3902103/1‑150 (MQ=255) cAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGCCCCg < 2:3231467/150‑1 (MQ=255) ggTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGCCCCGtt < 1:1637189/150‑1 (MQ=255) ggTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGCATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGCCCCGtt < 1:3052049/150‑1 (MQ=255) gTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGCCCCGTTc < 1:2528104/150‑1 (MQ=255) gATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGCCCCGTTCAGCCTAAt < 2:3537536/150‑1 (MQ=255) | TTAACCTGCCGACCGGAAAATCGCTCTCGGACGCCAGTGCGGCGATCGATCGCGCAATGACCCAGCTTGGTGTGCCTTCGACGGTGCGCGGCAGTTTTGCCGGCACGGCGCAGGTGTTCCAGGAGACGATGAACTCGCAGGTGATCCTGATTATCGCCGCCATCGCCACGGTGTATATCGTGCTGGGTATCCTTTACGAGAGTTACGTACATCCGCTGACGATTCTCTCCACCCTGCCCTCGGCGGGCGTTGGAGCGCTGTTGGCGCTGGAGCTGTTCAATGCCCCGTTCAGCCTAAT > CP009273/2154283‑2154580 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |