Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,209,162 | C→A | 71.3% | I9I (ATC→ATA) | yohO → | putative membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,209,162 | 0 | C | A | 71.3% | 374.5 / 282.9 | 289 | I9I (ATC→ATA) | yohO | putative membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/41); new base A (119/87); total (161/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
CAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAAC > CP009273/2209017‑2209305 | cagcagCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGccc > 1:4282515/1‑150 (MQ=255) cagcaACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCcctgt > 2:3426012/1‑150 (MQ=255) agcaACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAATTTTGGGTCATAGCcctgtt > 1:412329/1‑150 (MQ=255) agcaACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCcctgtt > 1:116600/1‑150 (MQ=255) aaCTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCcctgttcct > 2:2202335/1‑150 (MQ=255) tCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCcctgttcctgtt > 2:681963/1‑150 (MQ=255) cccccggtGGCAAGAACACGGCCAGGACATCTACCCACTCGGCATTTACTGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGttt < 1:4295291/143‑1 (MQ=255) cACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGttt < 1:3462148/150‑1 (MQ=255) ccAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTAt < 2:2101635/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATgg < 2:4018716/150‑1 (MQ=255) gTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGc < 1:107240/150‑1 (MQ=255) ggCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGtt < 1:4471134/150‑1 (MQ=255) ggCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGtt > 1:3905118/1‑150 (MQ=255) aaGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAgg > 1:1131964/1‑150 (MQ=255) aaGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTAAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAgg < 2:2977277/150‑1 (MQ=255) aaCAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCgg > 2:2513043/1‑150 (MQ=255) aCAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGa < 1:3399265/150‑1 (MQ=255) aCAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGa < 1:3258569/150‑1 (MQ=255) aaGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAAt > 1:3256682/1‑150 (MQ=255) aTGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATtggtgg < 1:760423/150‑1 (MQ=255) tGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGc < 2:407765/150‑1 (MQ=255) tGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGc < 2:1294410/150‑1 (MQ=255) tGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGc < 2:407841/150‑1 (MQ=255) gATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCg < 2:1959493/150‑1 (MQ=255) atatTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGt > 2:1148975/1‑150 (MQ=255) tatTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTc > 1:1396101/1‑150 (MQ=255) tatTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTc > 1:65727/1‑150 (MQ=255) tatTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGACATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTc > 1:3664403/1‑150 (MQ=255) atTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCa < 2:31207/150‑1 (MQ=255) atTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCa > 1:3990556/1‑150 (MQ=255) tttCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATg < 1:356205/150‑1 (MQ=255) tttCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATg > 1:2307237/1‑150 (MQ=255) ttCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGc > 1:1888010/1‑150 (MQ=255) ttCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGc > 2:1535191/1‑150 (MQ=255) tCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCt > 1:2572463/1‑150 (MQ=255) tCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCt < 2:94591/150‑1 (MQ=255) tCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCt < 2:431820/150‑1 (MQ=255) cccACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTc < 2:1631313/150‑1 (MQ=255) cccACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTc > 2:1057773/1‑150 (MQ=255) ccACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCg < 2:3732410/150‑1 (MQ=255) ccACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCg < 2:555287/150‑1 (MQ=255) cTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAg < 2:3275399/150‑1 (MQ=255) cTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAg > 2:3726802/1‑150 (MQ=255) cTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCAGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAg > 1:3720910/1‑150 (MQ=255) tCGGCATTAAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAgg < 2:89809/150‑1 (MQ=255) cGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGt > 1:3590487/1‑150 (MQ=255) aTTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTtata > 1:2136043/1‑150 (MQ=255) tAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCt > 1:4388766/1‑150 (MQ=255) aaTGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGCGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCtt < 1:3944720/150‑1 (MQ=255) cGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTg > 2:2682946/1‑150 (MQ=255) gTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTATCATAAGGAGGGCATTAGGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGGCATGCTCGCAGGGTATACCTTTATTTTGc > 2:705412/1‑150 (MQ=255) gTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGc > 2:3886061/1‑150 (MQ=255) ttAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCg < 1:3988672/150‑1 (MQ=255) ttAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCGGGTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCGGGTTATACCTTTATTTTGCg > 2:3117309/1‑150 (MQ=255) tAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGt > 2:3679563/1‑150 (MQ=255) cAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCt < 1:146010/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGc > 2:1217525/1‑150 (MQ=255) tGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCt > 1:864543/1‑150 (MQ=255) 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tGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCga < 2:4387456/150‑1 (MQ=255) aTTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCgatga > 2:1418261/1‑150 (MQ=255) aTTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCgatga > 2:1806723/1‑150 (MQ=255) aTTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGACGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCgatga > 1:1024825/1‑150 (MQ=255) tATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATc > 1:322305/1‑150 (MQ=255) 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cgcATAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATcgccg > 1:2411439/1‑150 (MQ=255) cATAGCTATAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGTATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTTAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGTTcgccgcg < 2:4374843/150‑2 (MQ=255) cATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCgccgcc < 2:116600/150‑1 (MQ=255) aTAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCa < 1:2202335/150‑1 (MQ=255) aTAGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCa < 1:2513043/150‑1 (MQ=255) aGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGt > 2:3837332/1‑150 (MQ=255) aGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGACTTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTGTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGt > 1:3310133/1‑150 (MQ=255) aGCTAAAATTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGt > 1:3310675/1‑150 (MQ=255) aacaTTGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGcca < 2:1034215/147‑1 (MQ=255) ttGGGGTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAg < 2:350684/150‑1 (MQ=255) ggggTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTa > 2:2451142/1‑150 (MQ=255) gggTCATAGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTaa < 2:3340891/150‑1 (MQ=255) | CAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAAC > CP009273/2209017‑2209305 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |