Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,589,808 | G→T | 46.9% | Q97K (CAG→AAG) | ypfJ ← | putative neutral zinc metallopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,589,808 | 0 | G | T | 46.9% | 216.9 / inf | 310 | Q97K (CAG→AAG) | ypfJ | putative neutral zinc metallopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (93/71); new base T (96/49); total (190/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
AGAAGGAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGGTTAAATCAACACCATAGTAGCCT > CP009273/2589661‑2589956 | aGAAGGAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACtgtt < 1:2973966/150‑1 (MQ=255) gAAGGAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACtgttg < 1:3576728/150‑1 (MQ=255) gAAGGAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACtgttg > 2:4076178/1‑150 (MQ=255) aGGAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTc < 1:3344426/150‑1 (MQ=255) ggAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTcc > 1:1281637/1‑150 (MQ=255) ggAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTcc < 1:4434242/150‑1 (MQ=255) ggAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTcc > 2:2787711/1‑150 (MQ=255) gagaTCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCa < 2:2201440/150‑1 (MQ=255) gagaTCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCa > 1:2447952/1‑150 (MQ=255) aTCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGgt > 2:3650559/1‑150 (MQ=255) aTCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGgt < 2:3227641/150‑1 (MQ=255) cGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGgtgt > 1:1821902/1‑150 (MQ=255) cGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGgtgt < 1:2842884/150‑1 (MQ=255) gATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTc > 1:1413536/1‑150 (MQ=255) gATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTc > 1:3535784/1‑150 (MQ=255) gATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTc > 1:4117925/1‑150 (MQ=255) atatAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGAACGCGTCCTTCCACGGTACATCACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTATTGACCCCAGGTGTCt > 2:641898/1‑150 (MQ=255) tataAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCtt > 1:64909/1‑150 (MQ=255) ataAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTc > 2:1860456/1‑150 (MQ=255) ataAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTc < 2:140841/150‑1 (MQ=255) ataAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTc > 2:4021372/1‑150 (MQ=255) ataAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTc < 1:4541661/150‑1 (MQ=255) ataAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTc > 1:1100617/1‑150 (MQ=255) aaCCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGt < 1:1411403/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTg < 2:1297362/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTg < 2:3619358/150‑1 (MQ=255) cGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGt > 1:1853189/1‑150 (MQ=255) gTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGtt > 1:520744/1‑150 (MQ=255) gTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGtt > 2:3352997/1‑150 (MQ=255) gTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGtt > 1:883334/1‑150 (MQ=255) tGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTg > 1:1024381/1‑150 (MQ=255) gCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGc < 2:729050/150‑1 (MQ=255) aTCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAg > 2:3624154/1‑150 (MQ=255) ccgccgGGCAATAGAACGGCCCCAGTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGaa < 2:1657389/150‑1 (MQ=255) gccgGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATc < 2:2416584/150‑1 (MQ=255) ccgGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCa > 1:3329784/1‑150 (MQ=255) cgGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCAc > 1:2311590/1‑150 (MQ=255) cgGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCAc < 2:1725969/150‑1 (MQ=255) cAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAg > 1:3439191/1‑150 (MQ=255) aaTAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAgg < 1:1697964/150‑1 (MQ=255) tagccccgCCCCCTTCTGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGAAAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTg < 2:4198462/143‑1 (MQ=255) tAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTg > 2:3819027/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAAt < 1:816336/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAAttt > 1:2655431/1‑150 (MQ=255) cccATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCg > 1:3272675/1‑150 (MQ=255) tATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTc > 2:1449153/1‑150 (MQ=255) ggACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTc > 2:1965891/1‑150 (MQ=255) ggACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTc < 1:2173076/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCa > 2:2925416/1‑150 (MQ=255) cccgccccgcAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCAttt < 1:3094265/150‑1 (MQ=255) ccgccccgcAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTg < 2:565912/150‑1 (MQ=255) cgccccgcAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTgg > 2:2550793/1‑150 (MQ=255) cgccccgcAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTgg > 2:2550717/1‑150 (MQ=255) cccgcAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCt < 2:4055117/150‑1 (MQ=255) cccgcAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCt > 1:3936113/1‑150 (MQ=255) cGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGAcc > 2:3102339/1‑150 (MQ=255) gTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACcgc > 2:4121829/1‑150 (MQ=255) tACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACcgcg > 2:2636790/1‑150 (MQ=255) cgTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGa < 1:2696367/150‑1 (MQ=255) cgTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGa > 1:1771768/1‑150 (MQ=255) tCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCAGTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAtt > 2:1792185/1‑150 (MQ=255) cATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttg > 2:3912790/1‑150 (MQ=255) cATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttg > 2:1219604/1‑150 (MQ=255) aTTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttgt > 2:3496394/1‑150 (MQ=255) ttCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttgtt < 2:3885089/150‑1 (MQ=255) ttCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttgtt > 1:2508708/1‑150 (MQ=255) tCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttgttg > 2:723347/1‑150 (MQ=255) cACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttgttgtt > 1:505022/1‑150 (MQ=255) aCGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGAttgttgttg < 2:1023308/150‑1 (MQ=255) gTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGa > 2:3403305/1‑150 (MQ=255) gTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGa < 2:4508928/150‑1 (MQ=255) aCATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGaaa > 1:2742311/1‑150 (MQ=255) cATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAAc > 2:3168409/1‑150 (MQ=255) cATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAAc > 2:2355638/1‑150 (MQ=255) tGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCg < 1:1974621/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCGTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTg < 2:2889437/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGcc > 1:695077/1‑150 (MQ=255) ggTTGCTGATAGGTCTTACCCCTCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGtc > 2:3434047/1‑150 (MQ=255) ggTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGtc > 2:3433858/1‑150 (MQ=255) ggTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGtc > 2:3433964/1‑150 (MQ=255) ttGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGtcat > 1:3093475/1‑150 (MQ=255) tGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAA‑TTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGtcatca > 1:3098966/1‑150 (MQ=255) aTAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAAccc < 2:2729301/150‑1 (MQ=255) aTAGGTCTTACCCATCGTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAAccc < 2:1476180/150‑1 (MQ=255) tACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAAt > 2:157646/1‑150 (MQ=255) tACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAAt < 1:949475/150‑1 (MQ=255) tACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAAt > 2:4485225/1‑150 (MQ=255) cATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAac > 2:3722186/1‑150 (MQ=255) cATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAac > 1:214383/1‑150 (MQ=255) cATCTTCTCGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAac > 1:213670/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAaca < 1:2782772/150‑1 (MQ=255) ctcGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCAta > 1:3765872/1‑150 (MQ=255) ctcGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCAta < 2:3272721/150‑1 (MQ=255) ctcGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCAta < 2:766080/150‑1 (MQ=255) tcGAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGACAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACACGAGTAAATCAACACCAtag > 2:3065427/1‑150 (MQ=255) gAACTTTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCAtagta < 2:1139545/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCAtagtag > 2:2007134/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCAtagtag > 2:4254289/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCATAGTAGcc < 1:1243912/150‑1 (MQ=255) tgttgtCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGATTAAATCAACACCATAGTAGCCt > 2:3036963/1‑150 (MQ=255) | AGAAGGAGAGATCGATATAAACCGTGCCATCCGCCGGGCAATAGAACGGCCCCATTATGGACTGGCCCGCCCCGCAGCCGGTACGCGTCATTCCACGGTACATGACCAGCTTCGGTTGCTGATAGGTCTTACCCATCTTCTCGAACTGTTGTCCCCAGGTGTCTTCCGTGGTTGCCAGAATCACCGAGGTGAATTTTGCGGCTTCGTCTTCATTTGGGCTAATTGACCGCGTTGATTGTTGTTGGGAAACCGGCTGCCCGGTCATCAACCCGGTTAAATCAACACCATAGTAGCCT > CP009273/2589661‑2589956 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |