Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,632,012 | C→A | 71.7% | intergenic (‑1/+10) | bamB ← / ← yfgM | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,632,012 | 0 | C | A | 71.7% | 360.2 / 267.7 | 279 | intergenic (‑1/+10) | bamB/yfgM | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/43); new base A (93/107); total (129/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
GCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCG > CP009273/2631865‑2632160 | gCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAgg < 2:3865391/150‑1 (MQ=255) cTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAggg < 1:3458434/150‑1 (MQ=255) cTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAggg > 1:1028781/1‑150 (MQ=255) ccACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTc > 1:2896170/1‑150 (MQ=255) ccACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTc < 1:652376/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTc < 2:3860385/150‑1 (MQ=255) cACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTcc > 1:437653/1‑150 (MQ=255) cGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCtctc > 1:4077954/1‑150 (MQ=255) gTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCa < 1:2712303/150‑1 (MQ=255) gTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa < 2:3000547/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGAt > 1:803140/1‑150 (MQ=255) gCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGAc < 2:2383408/150‑1 (MQ=255) cGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACa > 2:1567395/1‑150 (MQ=255) gTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACaa > 1:2587708/1‑150 (MQ=255) gTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACaa < 1:3743548/150‑1 (MQ=255) tAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACaaa < 2:1213494/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAat < 1:4521440/150‑1 (MQ=255) aCTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAatta < 1:942566/150‑1 (MQ=255) aCTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAatta < 1:4452201/150‑1 (MQ=255) tGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAattatt > 1:889326/1‑150 (MQ=255) gTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTaa > 1:89549/1‑150 (MQ=255) gTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTaa < 1:1124909/150‑1 (MQ=255) ttttCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAt < 2:318364/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAttt < 1:3552052/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAttt < 1:2573479/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAAttt > 2:4245979/1‑150 (MQ=255) cAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTCATTTTc > 2:3647495/1‑150 (MQ=255) aCGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCAt < 1:4468006/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCt < 2:1472276/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCt < 1:3854750/150‑1 (MQ=255) gTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTg > 1:1478995/1‑150 (MQ=255) gTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTg > 1:3933147/1‑150 (MQ=255) tGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGca > 2:3308003/1‑150 (MQ=255) ggCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcat < 2:1555896/150‑1 (MQ=255) ggCAATGGGGACATATTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcat > 2:4462548/1‑150 (MQ=255) ggCAATGGGGACATATTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcat > 2:4462585/1‑150 (MQ=255) gCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatc < 2:2504230/150‑1 (MQ=255) gCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatc < 1:2627450/150‑1 (MQ=255) cAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatca < 2:3398154/150‑1 (MQ=255) aTGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCAtt < 2:3444256/150‑1 (MQ=255) ggggACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTc < 1:663334/150‑1 (MQ=255) cATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCa < 2:139409/150‑1 (MQ=255) cATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCa > 2:800624/1‑150 (MQ=255) aTCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAg > 2:2819809/1‑150 (MQ=255) tCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGt > 2:671487/1‑150 (MQ=255) cTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGTGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATATCGCTCAGTg > 2:3119313/1‑150 (MQ=255) tttACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGc > 2:4366716/1‑150 (MQ=255) tACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCg < 1:2724951/150‑1 (MQ=255) cacaTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAg > 2:350194/1‑150 (MQ=255) acaTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGt > 1:3306720/1‑150 (MQ=255) acaTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGt < 2:4343016/150‑1 (MQ=255) caTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTa > 1:1186554/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGGAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAAGTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACAt < 1:2118304/150‑1 (MQ=255) tcttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATc > 2:1680177/1‑150 (MQ=255) tcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGCCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCt < 2:1157535/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCtt > 1:3366562/1‑150 (MQ=255) cTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCtttt > 2:3040408/1‑150 (MQ=255) ttAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCAc > 2:1930288/1‑150 (MQ=255) tAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACg < 2:415281/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCt < 2:2479243/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCt < 1:1680300/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGAAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCACACTCATATGGACAAATTATTAATTATCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCTGAGTAACATCGCTTTTCACGCCt > 2:2635021/1‑150 (MQ=255) cAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTg > 2:3987376/1‑150 (MQ=255) cGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCtt < 2:3924828/150‑1 (MQ=255) gAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc > 1:4036552/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc > 2:1939679/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCACAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc > 1:653848/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCa < 1:3071341/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCa > 1:1515267/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCa < 1:2661673/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATg < 2:1449988/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACt < 1:2254044/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACt < 1:3843082/150‑1 (MQ=255) tAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAc > 2:4183132/1‑150 (MQ=255) tAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAc > 2:3707908/1‑150 (MQ=255) aaaaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcg > 1:251022/1‑150 (MQ=255) aaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcgcg > 1:2863653/1‑150 (MQ=255) aaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcgcg < 2:3939145/150‑1 (MQ=255) aCGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTg < 2:4077954/150‑1 (MQ=255) aCGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTg < 2:1869021/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTACCATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTa > 2:217362/1‑150 (MQ=255) aaaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTa > 1:741326/1‑150 (MQ=255) cAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCCCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAc < 2:1720098/150‑1 (MQ=255) aGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAcc > 2:2497697/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCtt > 2:3586366/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCt > 2:3522097/1‑150 (MQ=255) cagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCa < 1:1389226/150‑1 (MQ=255) tAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATg > 2:808221/1‑150 (MQ=255) aTTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCt < 2:2025210/150‑1 (MQ=255) aTTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCt < 2:2026169/150‑1 (MQ=255) aTTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCt < 2:2134152/150‑1 (MQ=255) tttACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCtt < 1:1817814/150‑1 (MQ=255) tACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTca < 2:427760/150‑1 (MQ=255) gCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTcacca < 1:4462567/150‑1 (MQ=255) cAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTcaccac < 1:4167928/150‑1 (MQ=255) cAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGATTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCTCCTTGCTTATCACCTTTTCTCAGCAATGCTTcaccac < 2:3125801/150‑1 (MQ=255) aaTTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACg > 2:1142858/1‑150 (MQ=255) aTTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGc > 1:364981/1‑150 (MQ=255) ttGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCa > 1:2603700/1‑150 (MQ=255) tGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAg > 1:4496921/1‑150 (MQ=255) | GCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCG > CP009273/2631865‑2632160 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |