Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 2,803,846 | C→A | 7.4% | I48I (ATC→ATA) | ygaH → | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,803,846 | 0 | C | A | 7.4% | 985.7 / 33.5 | 264 | I48I (ATC→ATA) | ygaH | putative L‑valine exporter, norvaline resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (128/116); new base A (10/10); total (138/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CGCCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGATATGCGCTCTGCTGGTTGTCTCTACCGCACCAGAAGTGATGCACGATACACGCCGTTTCGTGCCCACGCTGGTCGGCTTCGCGGTACTGGGTGCCAGTTTCTATAAAACACGCAGCATTATCATCCCAACACTGCTTAGT > CP009273/2803697‑2803993 | cgcCCGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATc < 1:984220/150‑1 (MQ=255) cccGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGc > 1:508601/1‑150 (MQ=255) ccGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc > 1:1094873/1‑150 (MQ=255) ccGATGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc < 1:1675971/150‑1 (MQ=255) aTGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCg < 2:1146657/150‑1 (MQ=255) tGAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGa < 1:1987934/150‑1 (MQ=255) gAGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGaa > 2:3714954/1‑149 (MQ=255) aGCTATGAGGTTCTGCTGCTTGGGTTACTAGTTGGCGTGGCGAATTATTGCTTCCGCTATTTGCCGCTGCGCCTGCGTGTGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCCTCGata > 2:1892276/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |