| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,833,710 | C→A | 7.3% | S276R (AGC→AGA) | ascF → | fused cellobiose/arbutin/salicin‑specific PTS enzymes: IIB component/IC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,833,710 | 0 | C | A | 7.3% | 1075.4 / 37.1 | 288 | S276R (AGC→AGA) | ascF | fused cellobiose/arbutin/salicin‑specific PTS enzymes: IIB component/IC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (171/96); new base A (12/9); total (183/105) | |||||||||||
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Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
GACCTGGTGCCTGTCATATATCGAACGCTGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGACCATTGCCGAAACCGGCAA > CP009273/2833563‑2833859 | gaCCTGGTGCCTGTCATATATCGAACGCTGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAgcgc > 1:1731315/1‑150 (MQ=255) aCCTGGTGCCTGTCATATATCTAACGCTGGGTGGACAGCATTACACCGTCTGTGACCAAAATCTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTTGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGcc < 2:3779673/150‑1 (MQ=255) ggTGCCTGTCATATATCGAACGCTGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGCCAttt > 1:2710253/1‑150 (MQ=255) 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tatCGAACGCTGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTa > 2:1201856/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCa < 2:2286841/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCa < 1:2090269/150‑1 (MQ=255) tGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCAt < 2:1766120/150‑1 (MQ=255) gggTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGAGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATg < 1:238727/150‑1 (MQ=255) 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ggTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGAcc > 1:1620181/1‑150 (MQ=255) ggTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGAcc > 1:1218849/1‑150 (MQ=255) ggTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGAcc < 2:1437405/150‑1 (MQ=255) ggTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGAcc > 1:3891536/1‑150 (MQ=255) gTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGACCa > 2:1539683/1‑150 (MQ=255) 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aTCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGACCATTGCCGaa < 1:3532880/150‑1 (MQ=255) cgcCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGACCATTGCCGAAACCGGCaa < 1:1087928/150‑1 (MQ=255) | GACCTGGTGCCTGTCATATATCGAACGCTGGGTGGACAGCATTACACCGGCGGTGACCAAAAACTTCCTCAAACCAATGCTGATTGTGTTGATTGCCGCACCGCTGGCAATCCTGCTGATTGGCCCGATTGGTATCTGGATCGGTAGCGCCATTTCGGCGCTGGTTTACACCATTCATGGTTATCTGGGCTGGCTTTCAGTCGCCATTATGGGCGCGCTGTGGCCTCTGCTGGTAATGACCGGGATGCACCGCGTCTTTACGCCAACCATCATTCAGACCATTGCCGAAACCGGCAA > CP009273/2833563‑2833859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |