| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,927,355 | A→C | 5.8% | intergenic (‑308/‑239) | fucA ← / → fucP | L‑fuculose‑1‑phosphate aldolase/L‑fucose transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,927,355 | 0 | A | C | 5.8% | 906.9 / 41.0 | 292 | intergenic (‑308/‑239) | fucA/fucP | L‑fuculose‑1‑phosphate aldolase/L‑fucose transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (133/142); new base C (9/8); total (142/150) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
TGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAGGCAAATAT > CP009273/2927206‑2927504 | gCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGatttat < 2:1203899/150‑1 (MQ=255) aGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTAtttt < 2:758017/150‑1 (MQ=255) ttCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCt < 1:3621049/150‑1 (MQ=255) ctTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGaaa > 2:3197456/1‑150 (MQ=255) tttttATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAAc < 1:3974431/150‑1 (MQ=255) tttttATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAAc < 2:708638/150‑1 (MQ=255) ataACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCa < 1:3868576/150‑1 (MQ=255) ataACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCa > 1:3530057/1‑150 (MQ=255) ataACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCa > 1:2333376/1‑150 (MQ=255) taACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCAt < 2:56557/150‑1 (MQ=255) aaCCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATg > 1:3484683/1‑150 (MQ=255) aaCCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATg > 1:3118680/1‑150 (MQ=255) aaCCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATg < 2:1091271/150‑1 (MQ=255) aaCCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATg > 1:2697010/1‑150 (MQ=255) ccccATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGaa > 2:1797878/1‑150 (MQ=255) cccATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGaaa > 1:4281421/1‑150 (MQ=255) cATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTCTTTTCTGAAACGGGCATGAAAtt > 1:3212968/1‑150 (MQ=255) cATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAAtt > 1:495690/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAAttt > 2:2465602/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTGTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAAttt > 2:2034068/1‑150 (MQ=255) ttAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTc > 2:4263976/1‑150 (MQ=255) aaaTGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGatt < 2:607055/150‑1 (MQ=255) aTGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGTCATGAAATTTCGattat > 2:1440828/1‑150 (MQ=255) tGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGattatt > 1:3064489/1‑150 (MQ=255) tGACCGCACTTAAAAATATTTATCAAAACGTTCATTTTTCTATTCCTCCATGCCCGGAATGACAGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGattatt < 2:4115188/150‑1 (MQ=255) gACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGAttatta > 1:1920714/1‑150 (MQ=255) gACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGAGTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACTGGCATGAAATTTCGAgtatta > 1:4417792/1‑150 (MQ=255) aCCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTaa < 1:3343094/150‑1 (MQ=255) ccGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTaaa < 1:184672/150‑1 (MQ=255) cGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAg < 1:2266071/150‑1 (MQ=255) ctTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTTCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGAt > 1:3749988/1‑150 (MQ=255) aaaaTATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTa < 1:4175354/150‑1 (MQ=255) aaTATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGt < 1:70297/150‑1 (MQ=255) aaTATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGt < 2:3966048/150‑1 (MQ=255) atatTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTc < 2:206506/150‑1 (MQ=255) tatTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTca > 1:4498319/1‑150 (MQ=255) tttATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTcaca < 2:3385995/150‑1 (MQ=255) aTCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATaa > 1:2667863/1‑150 (MQ=255) tCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATaaa > 2:3771538/1‑150 (MQ=255) tCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATaaa > 2:1511875/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGt > 1:1581708/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGt > 1:1581032/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTc > 2:2928699/1‑150 (MQ=255) aaCGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTGTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCa < 1:260169/150‑1 (MQ=255) ggTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTCTTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCt > 2:2712777/1‑150 (MQ=255) ggTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCt < 2:4050501/150‑1 (MQ=255) ttttCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGc < 1:3433568/150‑1 (MQ=255) tttCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCt < 2:733694/150‑1 (MQ=255) cTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTCTTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCtaat > 1:229500/1‑150 (MQ=255) aTTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCtaataa > 1:2953252/1‑150 (MQ=255) tcctccAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAgt > 1:1807161/1‑150 (MQ=255) tcctccAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAgt < 2:4543118/150‑1 (MQ=255) cctccAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAgtg > 1:2185109/1‑150 (MQ=255) ctccAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAgtgt < 2:2664732/150‑1 (MQ=255) tccAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGtgtg < 2:2136090/150‑1 (MQ=255) cAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGAc > 1:4520549/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAAAAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGAc < 2:1295877/150‑1 (MQ=255) aGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGAccg > 2:2228998/1‑150 (MQ=255) cccGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGAccgcc < 1:3651508/150‑1 (MQ=255) aaTGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCat < 1:1104707/150‑1 (MQ=255) aaTGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCat < 2:1676010/150‑1 (MQ=255) aTGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCata > 2:3785171/1‑150 (MQ=255) tGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCatat < 1:2034068/150‑1 (MQ=255) gACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATAtt > 2:828476/1‑150 (MQ=255) ccGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCCTGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTAc > 1:2352932/1‑150 (MQ=255) cGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACa < 1:3039584/150‑1 (MQ=255) cGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACa < 2:510508/150‑1 (MQ=255) gTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACag < 2:1498851/150‑1 (MQ=255) cGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGt > 2:865521/1‑150 (MQ=255) ggCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGtt < 2:1518747/150‑1 (MQ=255) caaacaaTTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGtttttt > 1:5591/1‑150 (MQ=255) aacaaTTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTAt > 2:1739577/1‑150 (MQ=255) caaTTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTCTTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGAAGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTAttt > 1:2069728/1‑150 (MQ=255) caaTTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCTATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTATCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTAttt > 1:3200048/1‑150 (MQ=255) caaTTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTAttt < 2:1707059/150‑1 (MQ=255) aTTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGa < 2:1822782/150‑1 (MQ=255) aTTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGa > 2:1633349/1‑150 (MQ=255) aaTACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGaaaa < 1:1474738/150‑1 (MQ=255) tACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATg < 1:1151259/150‑1 (MQ=255) gTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATc < 1:1390244/150‑1 (MQ=255) tCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATcc < 2:2433814/150‑1 (MQ=255) tCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATcc < 1:1543525/150‑1 (MQ=255) aTCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTTAAAATGAATCCAt > 2:4435886/1‑150 (MQ=255) gATTTGTGTTTTTTATGATTTCTTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGt < 1:4386137/150‑1 (MQ=255) ttGTGTTTTTTATGATTTCTTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCa < 2:3138009/150‑1 (MQ=255) ttGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCa < 1:528706/150‑1 (MQ=255) gtgtTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCAtt < 2:2794148/150‑1 (MQ=255) gtgtTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCAtt < 2:1905477/150‑1 (MQ=255) tgtTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCAttt < 2:3558843/150‑1 (MQ=255) tgtTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCAttt < 2:3558973/150‑1 (MQ=255) tgtTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCAttt < 2:2559960/150‑1 (MQ=255) gtTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTc < 2:339031/150‑1 (MQ=255) tATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAg < 2:933339/150‑1 (MQ=255) tATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAg > 1:4063308/1‑150 (MQ=255) aTGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAgg > 1:2445837/1‑150 (MQ=255) aTGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAgg < 2:2335366/150‑1 (MQ=255) gATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAGGCa > 1:1374937/1‑150 (MQ=255) atttatttTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAGGCaa > 2:795318/1‑150 (MQ=255) tttatttTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAGGCaaa > 1:911711/1‑150 (MQ=255) atttTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAGGCAAatat > 1:454247/1‑150 (MQ=255) | TGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACAGGCAAATAT > CP009273/2927206‑2927504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |