| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,009,287 | 0 | G | T | 7.4% | 892.6 / 29.2 | 243 | intergenic (+190/‑132) | mocA/ygfK | CTP:molybdopterin cytidylyltransferase/putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (128/96); new base T (5/14); total (133/110) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGAGAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATATTTCCCGCCAAACCTGGCAAGAGTGGTGCGATTGTTGCTCTATCCCCCTAAACCACCGGATTTCTCAACACCGGTCACTCAATGATATCTGTATAAGCTAAGGAGAGGGTTATGGGGGATATTATGCG > CP009273/3009138‑3009435 | ccGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAg < 1:3873342/150‑1 (MQ=255) cGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAgc > 2:4539311/1‑150 (MQ=255) ggCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAgcc > 2:1309567/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |