Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,211,527 | C→A | 5.9% | A303A (GCG→GCT) | aer ← | fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,211,527 | 0 | C | A | 5.9% | 959.9 / 24.5 | 254 | A303A (GCG→GCT) | aer | fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (102/137); new base A (5/10); total (107/147) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
GTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAACGTTATCAACTGTCTGCTGGGTATGTTCGTTCAGTTCATCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACG > CP009273/3211378‑3211676 | gTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGAcgcc > 1:1486126/1‑150 (MQ=255) gTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGAcgcc > 2:2467048/1‑150 (MQ=255) tGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGAcgccg > 2:3549876/1‑150 (MQ=255) 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tGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATAGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCg > 2:3117139/1‑150 (MQ=255) cGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCa < 1:1995384/150‑1 (MQ=255) gCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCAcc < 2:3210520/150‑1 (MQ=255) tatCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGttt < 1:4238643/150‑1 (MQ=255) tatCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGttt > 1:187860/1‑150 (MQ=255) 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cATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAAc > 1:2996624/1‑150 (MQ=255) cATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAAc < 2:4430992/150‑1 (MQ=255) cATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAAc > 1:2116683/1‑150 (MQ=255) aTTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAACg < 1:3219518/150‑1 (MQ=255) aTTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAACg < 1:3219676/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |