| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,285,381 | G→T | 7.1% | D228Y (GAT→TAT) | yraK → | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,285,381 | 0 | G | T | 7.1% | 947.1 / 30.0 | 255 | D228Y (GAT→TAT) | yraK | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (114/122); new base T (10/9); total (124/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
TGACCATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATC > CP009273/3285232‑3285530 | tGACCATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCg < 1:2800745/150‑1 (MQ=255) aCCATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCTAt > 2:2452624/1‑150 (MQ=255) aCCATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGAt < 1:138219/150‑1 (MQ=255) cATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGt > 1:2131374/1‑150 (MQ=255) aTTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGTAGCACGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGtt < 1:3253009/150‑1 (MQ=255) aTTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGtt < 1:2171829/150‑1 (MQ=255) ttCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGtta < 2:4130094/150‑1 (MQ=255) ttCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGtta > 1:374967/1‑150 (MQ=255) tCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGttat < 1:1542334/150‑1 (MQ=255) ccGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGttatt > 2:746267/1‑150 (MQ=255) ccGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGttatt < 2:3256541/150‑1 (MQ=255) cGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCTATGttatta > 1:427391/1‑150 (MQ=255) cGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGttatta > 1:725692/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAg < 2:537856/150‑1 (MQ=255) aaCGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGt > 2:3869771/1‑150 (MQ=255) aCGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGtt > 1:3364755/1‑150 (MQ=255) cGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTa > 1:3817532/1‑150 (MQ=255) ggATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTaa > 2:1270534/1‑150 (MQ=255) gATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAt > 1:3575784/1‑150 (MQ=255) atatTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAtt < 1:1110383/150‑1 (MQ=255) atatTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAtt < 2:2335374/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTg > 1:4300099/1‑150 (MQ=255) ttGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTg < 2:1039771/150‑1 (MQ=255) ccGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGAt > 2:2646415/1‑150 (MQ=255) ccGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGAt < 1:3524078/150‑1 (MQ=255) ccGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGAt < 1:2626835/150‑1 (MQ=255) cGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGAtt > 2:2451658/1‑150 (MQ=255) cGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGAtt < 1:914151/150‑1 (MQ=255) gTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATtc > 2:4528512/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATtcatc < 2:2201856/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAAt > 2:1115064/1‑150 (MQ=255) aaaGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAAt < 1:4250240/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATg > 2:1682301/1‑150 (MQ=255) aaGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATAGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATg < 2:2350204/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATgg < 1:3101810/150‑1 (MQ=255) ggCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCTATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGt < 1:3149170/150‑1 (MQ=255) gTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGaa < 2:1674519/150‑1 (MQ=255) gTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGaa < 1:4134153/150‑1 (MQ=255) ggTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGtt < 1:4054129/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGttt < 2:2831634/150‑1 (MQ=255) tCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTa < 1:1074720/150‑1 (MQ=255) gATGGAATGGGAAGCCCTTCTACAGTTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCATGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTacc < 1:2360940/150‑1 (MQ=255) ggAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTaccacc > 1:170634/1‑150 (MQ=255) ggAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAat < 2:566690/150‑1 (MQ=255) ggAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAat < 1:2503889/150‑1 (MQ=255) ggAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAat < 2:2506210/150‑1 (MQ=255) cccGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccat < 1:3312473/150‑1 (MQ=255) cccGTCTACAGGTGACTTACATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccat < 2:3686008/150‑1 (MQ=255) gTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCTATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccatgcc > 1:635400/1‑150 (MQ=255) gTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccatgcc < 1:1785966/150‑1 (MQ=255) tCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAAtgccatgcca > 1:4500072/1‑150 (MQ=255) tCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAAtgccatgcca > 1:2262850/1‑150 (MQ=255) aGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACgg < 2:1778977/150‑1 (MQ=255) aGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACgg > 1:301589/1‑150 (MQ=255) aGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACgg > 1:2104245/1‑150 (MQ=255) gTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGtt < 2:185282/150‑1 (MQ=255) tGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGttt < 2:3614663/150‑1 (MQ=255) gACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGtttt > 2:3341186/1‑150 (MQ=255) gACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGtttt > 2:3527291/1‑150 (MQ=255) ttCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCACCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACt > 1:2932091/1‑150 (MQ=255) ccATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTcc > 1:214874/1‑150 (MQ=255) ccATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGCTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTcc > 1:2699303/1‑150 (MQ=255) cATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCa > 1:2200135/1‑150 (MQ=255) aTGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAg < 1:2595424/150‑1 (MQ=255) tAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACt < 1:3249490/150‑1 (MQ=255) tCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTg > 1:324091/1‑150 (MQ=255) gTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGatat > 2:3460349/1‑150 (MQ=255) ttATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATc < 1:3614015/150‑1 (MQ=255) ttATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATc > 1:166386/1‑150 (MQ=255) cGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACtt > 1:1957566/1‑150 (MQ=255) tCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGa > 2:1795306/1‑150 (MQ=255) ggAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACtgt > 1:1832058/1‑150 (MQ=255) ggAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACtgt > 1:759529/1‑150 (MQ=255) acaTCTCCCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTgtgg < 2:3271631/148‑1 (MQ=255) aaaTCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTgtgg > 1:743827/1‑150 (MQ=255) tctcACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGa > 1:3791108/1‑150 (MQ=255) tcACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATa < 1:4456564/150‑1 (MQ=255) cACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATAc > 1:209384/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACt < 1:42401/150‑1 (MQ=255) ccGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACtt < 1:511291/150‑1 (MQ=255) cGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTc > 2:4544193/1‑150 (MQ=255) gCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCa < 2:285507/150‑1 (MQ=255) ccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCTATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAg < 1:1981098/150‑1 (MQ=255) ccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCTATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAg < 1:1981175/150‑1 (MQ=255) acaGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGAt < 1:2546442/150‑1 (MQ=255) aGTCGTGCAAAATTAATCAGTGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTa < 2:1432078/150‑1 (MQ=255) aGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCTATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTa < 1:2452624/150‑1 (MQ=255) tCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATAATTCAAAGATTaaa > 2:3031029/1‑150 (MQ=255) cGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaaaa > 2:627773/1‑150 (MQ=255) cGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTATTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaaaa > 2:2909159/1‑150 (MQ=255) aaaTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGt > 1:1314504/1‑150 (MQ=255) aaaTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGt > 1:4513226/1‑150 (MQ=255) aaaTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGt > 1:1313451/1‑150 (MQ=255) aaTTAATCAGGGCTATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGtt > 1:3236070/1‑150 (MQ=255) aaTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGtt > 1:3937043/1‑150 (MQ=255) tCATGGCGATGTTATTAAGGTTTATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCTAAt < 2:1164906/150‑1 (MQ=255) aGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATgc > 1:2756482/1‑150 (MQ=255) gCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCa < 2:4300099/150‑1 (MQ=255) gATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATc < 2:2281691/150‑1 (MQ=255) gATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATc < 2:1602098/150‑1 (MQ=255) | TGACCATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATC > CP009273/3285232‑3285530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |