Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,292,182 | G→T | 7.4% | G8G (GGC→GGA) | yraR ← | putative nucleoside‑diphosphate‑sugar epimerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,292,182 | 0 | G | T | 7.4% | 1248.6 / 43.6 | 334 | G8G (GGC→GGA) | yraR | putative nucleoside‑diphosphate‑sugar epimerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (168/141); new base T (13/12); total (181/153) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
TGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCAACAACGCGGAGGAAG > CP009273/3292033‑3292331 | tGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTgcg < 1:169916/150‑1 (MQ=255) ccAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTg > 2:2454179/1‑150 (MQ=255) aaCGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTa > 1:1083545/1‑150 (MQ=255) cgcgTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAAt > 1:3072836/1‑150 (MQ=255) gcgTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCTCCTGTAATc < 1:1336565/150‑1 (MQ=255) gTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAg > 1:2049295/1‑150 (MQ=255) aCTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTAc > 1:3456177/1‑150 (MQ=255) cTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTAcc > 1:3512553/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTg < 2:1751475/150‑1 (MQ=255) aGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGa > 1:2166625/1‑150 (MQ=255) ttGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACt < 1:273946/150‑1 (MQ=255) gCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCa < 1:608053/150‑1 (MQ=255) gCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCa > 1:2556209/1‑150 (MQ=255) gATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCt < 1:2787990/150‑1 (MQ=255) tCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTc < 2:3691025/150‑1 (MQ=255) tCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTc < 2:3854596/150‑1 (MQ=255) aTGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGc > 2:3303629/1‑150 (MQ=255) ggggATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTc > 2:2969445/1‑150 (MQ=255) gATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCtt < 2:2758937/150‑1 (MQ=255) aTTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCttt > 1:4350997/1‑150 (MQ=255) aTTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCttt < 2:3420888/150‑1 (MQ=255) tAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTAc > 1:1530949/1‑150 (MQ=255) cacCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGaa > 1:1823986/1‑150 (MQ=255) acCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAAt > 2:4469117/1‑150 (MQ=255) ccccGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAAtt > 2:1975724/1‑150 (MQ=255) gCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGc < 2:2243019/150‑1 (MQ=255) cATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGcc > 2:2056426/1‑150 (MQ=255) cATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGcc > 2:613285/1‑150 (MQ=255) atatCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCt > 1:2188366/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgc > 2:1457090/1‑150 (MQ=255) cGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgcg > 2:1339597/1‑150 (MQ=255) gCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgcgc > 2:2613088/1‑150 (MQ=255) cccAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCt < 2:255952/150‑1 (MQ=255) cAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCATTGGCGTTAAATTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTAATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTcc < 2:1782458/150‑1 (MQ=255) cAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTcc > 1:2095178/1‑150 (MQ=255) aaCGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCa > 1:306518/1‑150 (MQ=255) aaCGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCa > 1:3691102/1‑150 (MQ=255) aCGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCAc > 2:4154569/1‑150 (MQ=255) cGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACg < 1:719919/150‑1 (MQ=255) cGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACg > 2:3448663/1‑150 (MQ=255) ggACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACgg > 2:3046520/1‑150 (MQ=255) gACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGc < 2:3623303/150‑1 (MQ=255) aCGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCt < 1:869616/150‑1 (MQ=255) 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ggCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAg > 2:142614/1‑150 (MQ=255) caATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCTCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAAt < 2:3704762/150‑1 (MQ=255) caATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAAt < 1:1655954/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAg < 2:2494522/150‑1 (MQ=255) ggCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGAc > 1:4133066/1‑150 (MQ=255) 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ttCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATc < 2:116417/150‑1 (MQ=255) ttCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATc < 1:594785/150‑1 (MQ=255) tCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATcc > 2:2066101/1‑150 (MQ=255) cGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATccc > 2:2152495/1‑150 (MQ=255) gTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATcccc > 1:1364355/1‑150 (MQ=255) 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cAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATtgt > 1:2265772/1‑150 (MQ=255) cATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCTCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTggg < 2:733211/150‑1 (MQ=255) cATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCTCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTggg < 2:1294323/150‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCTCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGa > 1:4164066/1‑150 (MQ=255) tCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGac > 1:2969978/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAAAAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGaa > 1:690315/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAAtt < 2:4341517/150‑1 (MQ=255) cagcagGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTc < 2:1043249/150‑1 (MQ=255) agcagGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCg > 2:3314471/1‑150 (MQ=255) agcagGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCg > 2:2192752/1‑150 (MQ=255) gcagGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGc > 1:3820896/1‑150 (MQ=255) gcagGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGc > 1:1561970/1‑150 (MQ=255) cagGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGcc > 1:1886171/1‑150 (MQ=255) agGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCt > 1:4207586/1‑150 (MQ=255) agGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCt < 2:4028911/150‑1 (MQ=255) gCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAAt > 1:138011/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGc > 1:807926/1‑150 (MQ=255) caccaGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGca < 1:3922811/150‑1 (MQ=255) caccaGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGca < 2:4011808/150‑1 (MQ=255) caGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGTAAATTCGCCTCATCCAATGcaaca > 1:1924435/1‑150 (MQ=255) gCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCaacaac < 1:1262321/150‑1 (MQ=255) gCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCaacaac < 1:1189765/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCAACAACGCgga < 1:2510063/150‑1 (MQ=255) gtGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCAACAACGCggag < 1:2454165/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCAACAACGCggagga < 1:4256719/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCAACAACGCggagga < 2:306518/150‑1 (MQ=255) gcCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCAACAACGCGGAGGAAg < 1:630460/150‑1 (MQ=255) | TGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAATAGACCATGAGGTAATTATCCCCGATTGTGGGAAATTCGCCTCATCCAATGCAACAACGCGGAGGAAG > CP009273/3292033‑3292331 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |