| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,257,593 | C→T | 7.0% | N184N (AAC→AAT) | tyrB → | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,257,593 | 0 | C | T | 7.0% | 970.7 / 40.5 | 273 | N184N (AAC→AAT) | tyrB | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (144/109); new base T (10/9); total (155/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TAGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAG > CP009273/4257445‑4257742 | aaTATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAAc < 2:2423145/150‑1 (MQ=255) tatTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACgg > 1:3239372/1‑150 (MQ=255) atTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACggg > 2:2553467/1‑150 (MQ=255) atTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACggg > 1:3929371/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGt > 2:2520796/1‑150 (MQ=255) gCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGcc < 2:2932026/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGcc < 2:3730782/150‑1 (MQ=255) cGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGa > 2:765851/1‑150 (MQ=255) gggCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGAtc > 1:3881289/1‑150 (MQ=255) ggCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTACATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGAtct > 2:3372337/1‑150 (MQ=255) gCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGAtctc < 1:2656988/150‑1 (MQ=255) tGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCAc > 1:3954437/1‑150 (MQ=255) tGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCAc > 1:3652504/1‑150 (MQ=255) aTTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTaa > 2:3209685/1‑150 (MQ=255) aTTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTaa > 2:2742460/1‑150 (MQ=255) ttCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAAt < 2:2375702/150‑1 (MQ=255) tCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATg < 2:2471622/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGa < 1:1901157/150‑1 (MQ=255) gAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGAt > 2:2161845/1‑150 (MQ=255) caGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCACCGGGTGCCGATCTCACTAATGATc > 2:3990176/2‑150 (MQ=255) tGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGt < 2:3816465/150‑1 (MQ=255) tGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGt > 1:197347/1‑150 (MQ=255) aCTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGAt < 1:2006660/150‑1 (MQ=255) tACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCg > 2:385577/1‑150 (MQ=255) tACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGGATTGGGTTGCTGCTTCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGTTCAGTGGGATGCg > 2:2882161/1‑150 (MQ=255) ggTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTg > 2:664476/1‑150 (MQ=255) gTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGa > 2:1231622/1‑150 (MQ=255) tATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGaa > 1:3748073/1‑150 (MQ=255) aTGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGaaa > 2:619628/1‑150 (MQ=255) aCGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtc > 2:1526445/1‑150 (MQ=255) aGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTTCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCaa > 2:1018973/1‑150 (MQ=255) aGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCaa > 2:1162754/1‑150 (MQ=255) gCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCaaa < 2:547886/150‑1 (MQ=255) gCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCaaa < 2:1281463/150‑1 (MQ=255) cGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAg < 1:2951979/150‑1 (MQ=255) gACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGNTTGAAATTCTCAAAgn < 2:1152929/150‑2 (MQ=255) aCTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGcc > 1:3360417/1‑150 (MQ=255) aCTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGcc < 1:3605315/150‑1 (MQ=255) aCTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGcc < 1:2767740/150‑1 (MQ=255) cTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCACAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGccc > 2:4079975/1‑150 (MQ=255) tAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCcg > 1:1173776/1‑150 (MQ=255) aCGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCcgcg > 2:1941702/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAg > 1:2816965/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAg > 1:2444211/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAg > 1:2444181/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAg < 2:1371682/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTat < 1:4152564/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTat > 1:2981352/1‑150 (MQ=255) cTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattcc < 2:51271/150‑1 (MQ=255) ttAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattccat > 2:1629250/1‑150 (MQ=255) tAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattccatt < 1:1564847/150‑1 (MQ=255) aaTGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattccattc < 1:2474183/150‑1 (MQ=255) aaTGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattccattc < 1:719450/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattccattcc > 1:1495116/1‑150 (MQ=255) tGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCTTGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATGAGTGGGATGAGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCt < 1:2143705/150‑1 (MQ=255) tGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCt > 2:2045803/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGat > 1:1948692/1‑150 (MQ=255) tGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTg < 2:3172154/150‑1 (MQ=255) tGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTg > 1:66714/1‑150 (MQ=255) tGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGAGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTg > 2:2699830/1‑150 (MQ=255) ggCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGc > 1:3103733/1‑150 (MQ=255) ggCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGc > 2:2101964/1‑150 (MQ=255) cGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCt < 1:3274457/150‑1 (MQ=255) aCGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTAt < 1:939624/150‑1 (MQ=255) cGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATc > 2:3883430/1‑150 (MQ=255) cGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATc > 1:4084698/1‑150 (MQ=255) cTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCaa > 2:2220208/1‑150 (MQ=255) cTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCaa > 1:610478/1‑150 (MQ=255) cTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCaa > 2:1396728/1‑150 (MQ=255) aaCATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGAtt > 2:2670244/1‑150 (MQ=255) tACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTg > 1:2563221/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGc > 1:2400151/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGcc < 1:543740/150‑1 (MQ=255) cccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTa > 1:1334156/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTAt < 2:992899/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTAt > 1:339693/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTAt < 1:1803871/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTAt < 1:3869611/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTAt > 1:540794/1‑150 (MQ=255) gCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATgg < 2:2758003/150‑1 (MQ=255) aGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGaa > 1:2057084/1‑150 (MQ=255) gTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAAGTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAag < 1:2355211/150‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAagag < 2:3018381/150‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAagag < 2:1605946/150‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAagag > 2:4104785/1‑150 (MQ=255) gtgtTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCAATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGAt < 2:1881852/150‑1 (MQ=255) tgtTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATg < 1:2056878/150‑1 (MQ=255) gctgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTa < 2:3722485/150‑1 (MQ=255) gctgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTa < 1:1153395/150‑1 (MQ=255) tgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACg > 1:1449686/1‑150 (MQ=255) tgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACg > 1:2902164/1‑150 (MQ=255) tgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACg > 1:1940222/1‑150 (MQ=255) cATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCt > 1:1723943/1‑150 (MQ=255) cATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTc > 2:2847322/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTcg > 1:3004546/1‑150 (MQ=255) tGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGcc < 2:1856413/150‑1 (MQ=255) ccaccaTCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTAGTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCAt < 2:880391/150‑1 (MQ=255) cacaACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCAtt > 2:359284/1‑150 (MQ=255) cacaACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCAtt < 2:3499121/150‑1 (MQ=255) aaCCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGcc > 1:3520639/1‑150 (MQ=255) | TAGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAG > CP009273/4257445‑4257742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |