| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,284,205 | T→C | 7.8% | intergenic (+138/‑204) | nrfG → / → gltP | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfG/glutamate/aspartate:proton symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,284,205 | 0 | T | C | 7.8% | 841.4 / 47.7 | 255 | intergenic (+138/‑204) | nrfG/gltP | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfG/glutamate/aspartate:proton symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (119/116); new base C (8/12); total (127/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
AGATTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATGT > CP009273/4284056‑4284354 | gaTTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATc < 1:3179637/150‑1 (MQ=255) gaTTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATc > 1:1925489/1‑150 (MQ=255) aTTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATAAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAAAGGGTATTCATTAAtac > 2:1657823/1‑148 (MQ=255) tGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTg < 2:2516655/150‑1 (MQ=255) tGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTg > 2:4017162/1‑150 (MQ=255) tGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTg < 1:2186508/150‑1 (MQ=255) ggATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGc < 2:2976241/150‑1 (MQ=255) atcatcTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATaaa > 1:2760357/1‑150 (MQ=255) catcTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACt < 1:3057519/150‑1 (MQ=255) tcTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTcg > 1:2977391/1‑150 (MQ=255) tcTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTcg < 1:2243738/150‑1 (MQ=255) gTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGtt > 2:3677360/1‑150 (MQ=255) tgaAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGttatta > 1:1874253/1‑150 (MQ=255) tgaAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGttatta < 1:3334111/150‑1 (MQ=255) tgaAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGttatta > 1:34848/1‑150 (MQ=255) tgaAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCAATAATCAGTATAATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGttatta > 1:1874066/1‑150 (MQ=255) gaAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTtattat < 2:2576988/150‑1 (MQ=255) aaGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATg > 2:3948086/1‑150 (MQ=255) aaGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATg > 1:1447709/1‑150 (MQ=255) aTTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCAt > 2:1340772/1‑150 (MQ=255) aTTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCAt < 2:2665934/150‑1 (MQ=255) aTTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCAt < 2:2029142/150‑1 (MQ=255) tATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTa < 1:388885/150‑1 (MQ=255) cATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCa > 2:907825/1‑150 (MQ=255) aTTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAg > 1:2588529/1‑150 (MQ=255) aTTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAg > 1:3062549/1‑150 (MQ=255) aTTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAg > 1:3316860/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGa < 1:2990413/150‑1 (MQ=255) aGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGaa < 1:351951/150‑1 (MQ=255) tGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAg < 1:1271348/150‑1 (MQ=255) aaaaaTAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTTCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCAATAATCCTTCCATAAACACGCCTAATTATGCATTAATGCAGAGAAAAGCTCtgt > 1:3638537/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCtgt > 1:1219625/1‑150 (MQ=255) aaaaTAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCtgtt < 2:3106105/150‑1 (MQ=255) aataatCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCtgttgt < 2:426571/150‑1 (MQ=255) aataatCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCtgttgt < 2:3417915/150‑1 (MQ=255) taatCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTa < 1:2031225/150‑1 (MQ=255) cGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAgg > 1:508109/1‑150 (MQ=255) aaTGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGt > 1:1188436/1‑150 (MQ=255) aTGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGtt < 1:1703402/150‑1 (MQ=255) gAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGCAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTgc > 2:2937080/1‑150 (MQ=255) aaCATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTgcg < 2:2080148/150‑1 (MQ=255) aCATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTgcgc > 1:2138374/1‑150 (MQ=255) atGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACa > 1:1094645/1‑150 (MQ=255) atGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATCCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACa < 2:3792887/150‑1 (MQ=255) gCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATa < 1:3694876/150‑1 (MQ=255) gCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATa < 2:1862248/150‑1 (MQ=255) ccAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATAc < 2:2359527/150‑1 (MQ=255) ccAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATAc < 2:3066861/150‑1 (MQ=255) cAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATAcc < 1:1257562/150‑1 (MQ=255) cAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATAcc < 1:458776/150‑1 (MQ=255) aaaaaTAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACcg > 1:3709765/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACcg < 1:728362/150‑1 (MQ=255) aaaaaTAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACcg < 1:1628996/150‑1 (MQ=255) atCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAAt < 1:3228314/150‑1 (MQ=255) aCTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGAt < 1:1914821/150‑1 (MQ=255) aCTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGAt > 2:1032632/1‑150 (MQ=255) aCTAATCAGTATTAGTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGAATCGAAAAGCTCTGTTTTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGAt > 2:1565555/1‑150 (MQ=255) cTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATa > 1:3752461/1‑150 (MQ=255) cTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATa < 2:87631/150‑1 (MQ=255) tAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATAc > 1:1438469/1‑150 (MQ=255) aaTCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACt < 1:2904288/150‑1 (MQ=255) aTCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAATTCTTTCCATAACAAATTGTTATTAATTAACACTGCCATAAACTCGCTTTATTATGCATTAATGAAGAGAAAAGATCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACAGCGCAAATGATAcag > 1:2794710/1‑148 (MQ=255) aTCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTg < 1:3652731/150‑1 (MQ=255) cAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGAt < 2:544289/150‑1 (MQ=255) cAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGAt < 2:544356/150‑1 (MQ=255) aGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATc < 2:14948/150‑1 (MQ=255) aGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATc > 2:3902606/1‑150 (MQ=255) aGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATc > 2:3902632/1‑150 (MQ=255) tttattTCAGATTATACATATAAAAATTTTTCGATTACATATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGATAAGCTCTGTTGTTTAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATa < 1:711087/149‑1 (MQ=255) tattGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAg > 1:3486802/1‑150 (MQ=255) tGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGt > 1:2298690/1‑150 (MQ=255) tGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGt > 1:566883/1‑150 (MQ=255) ttAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTaaaaa > 1:2166502/1‑150 (MQ=255) aaaCAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTaaaaaaa > 1:3999984/1‑150 (MQ=255) aaaCAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGATaaaaaaa > 1:3999947/1‑150 (MQ=255) aaaCAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTaaaaaaa < 2:751236/150‑1 (MQ=255) aaCAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAAt < 1:2101380/150‑1 (MQ=255) aaaaTCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAAc < 2:2487591/150‑1 (MQ=255) aaaTCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAAcc > 1:98144/1‑150 (MQ=255) aaTCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCa > 1:1765619/1‑150 (MQ=255) aaTCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCa > 1:2276648/1‑150 (MQ=255) aTCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCaa < 2:1203381/150‑1 (MQ=255) aTCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCaa < 2:2260601/150‑1 (MQ=255) tCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAAc < 2:2877171/150‑1 (MQ=255) cATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAaca < 2:1078001/150‑1 (MQ=255) aTAACAAATGGTTATTCATTAACCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAGGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAacac > 1:916847/1‑150 (MQ=255) tAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAAcaca < 2:1152478/150‑1 (MQ=255) aTGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCAt > 1:3776012/1‑150 (MQ=255) aTGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCAt > 2:3321457/1‑150 (MQ=255) tGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATg > 2:3231252/1‑150 (MQ=255) gTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGcc > 1:2929780/1‑150 (MQ=255) gTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGcc < 2:3474274/150‑1 (MQ=255) aTTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTg > 1:901775/1‑150 (MQ=255) tAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTa > 2:387152/1‑150 (MQ=255) aaTCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTAt < 2:1619237/150‑1 (MQ=255) aaTCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTAt > 2:82751/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATg < 2:3470037/150‑1 (MQ=255) aTCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATg > 1:3574510/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCCATAAACTCGCGGTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATg > 2:2768943/1‑150 (MQ=255) tCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTTCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATGt > 2:1507698/1‑150 (MQ=255) | AGATTGGATTAATCATCTGGTGATGAAGATTATGTCATTGAGCTGCATAAAAAATAATCGAATGAACATATGCCAAAAATAATCACTAATCAGTATTATTGCAGATTAAACAAATAAAAATCTTTCCATAACAAATGGTTATTCATTAATCCTGCCATAAACTCGCGTTATTATGCATTAATGCAGCGAAAAGCTCTGTTGTTAAAGGGTTGCGCAACATACCGCGCAAATGATACTGATCATAAGCGTTAAAAAAATCTACAAACCAACGCAACACAATTCATGCCCTGGCAGTATGT > CP009273/4284056‑4284354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |