| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,372,891 | A→T | 42.9% | A144A (GCA→GCT) | epmA → | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,372,891 | 0 | A | T | 42.9% | 101.4 / 258.9 | 177 | A144A (GCA→GCT) | epmA | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (54/47); new base T (39/37); total (93/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
TGTGCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTACAATT > CP009273/4372743‑4373040 | gtgCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGa > 2:419513/1‑150 (MQ=255) gCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGcc < 1:2127992/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCt > 1:1478510/1‑150 (MQ=255) aGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCtt > 2:3164523/1‑150 (MQ=255) gCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCttt > 1:2573764/1‑150 (MQ=255) cTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTc < 2:2636319/150‑1 (MQ=255) cTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTc < 2:3163015/150‑1 (MQ=255) tCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCtt < 1:326807/150‑1 (MQ=255) tCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCtt > 2:1775369/1‑150 (MQ=255) tCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCtt < 1:470962/150‑1 (MQ=255) ccGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGCGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTCCCGGTTGTTGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTa < 1:992042/150‑1 (MQ=255) cGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTAt < 2:3204693/150‑1 (MQ=255) cGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTAt < 1:1006200/150‑1 (MQ=255) cGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTAt > 1:212914/1‑150 (MQ=255) gTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATc > 2:4109548/1‑150 (MQ=255) tAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATca < 2:3260220/150‑1 (MQ=255) tAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATca > 1:348161/1‑150 (MQ=255) aTGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATcaac > 1:2960235/1‑150 (MQ=255) gAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATcaacaa > 2:2731190/1‑150 (MQ=255) agagATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTGACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGc > 2:336353/1‑150 (MQ=255) agaTGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCtt > 1:2350660/1‑150 (MQ=255) agaTGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCtt < 1:2015721/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTc > 2:1971742/1‑150 (MQ=255) ggggCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCtt > 2:226917/1‑150 (MQ=255) cGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGt < 1:3390033/150‑1 (MQ=255) ttATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTa > 1:2533131/1‑150 (MQ=255) ttATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTa > 2:600955/1‑150 (MQ=255) tATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTAt < 2:2127965/150‑1 (MQ=255) aTCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATc > 2:2019413/1‑150 (MQ=255) acaACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTgg > 1:2206635/1‑150 (MQ=255) acaACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTgg > 2:644886/1‑150 (MQ=255) acaACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTgg > 2:3693599/1‑150 (MQ=255) acaACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTgg > 1:1084011/1‑150 (MQ=255) caACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGa > 2:2203562/1‑150 (MQ=255) aCCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGaaa < 2:1210033/150‑1 (MQ=255) cccTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAAt < 1:3445412/150‑1 (MQ=255) ccTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAAtt > 1:1027749/1‑150 (MQ=255) cTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTg < 1:651900/150‑1 (MQ=255) cTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTg < 1:2230556/150‑1 (MQ=255) aGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGAcc > 2:3571474/1‑150 (MQ=255) gTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGAccc > 1:1223494/1‑150 (MQ=255) aCTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGctc < 1:3036487/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTNTCAACAAGCNTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGctctct > 1:2712801/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTg > 1:2970301/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTg > 2:3839397/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTg > 2:3394526/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTg > 2:2944725/1‑150 (MQ=255) cTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGcc < 1:2591426/150‑1 (MQ=255) cTGGAGTGGTATAGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGcc < 1:2757583/150‑1 (MQ=255) tGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCg > 2:1781850/1‑150 (MQ=255) tGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCg < 1:3601636/150‑1 (MQ=255) aGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGATCTCTGCCGACa > 2:1864316/1‑150 (MQ=255) aGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACa > 1:4168639/1‑150 (MQ=255) ggTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACaaaa < 2:3942128/150‑1 (MQ=255) gTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAAc < 2:683286/150‑1 (MQ=255) tATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACg < 2:1433818/150‑1 (MQ=255) aTCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGc > 2:3891602/1‑150 (MQ=255) cGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCaa > 2:1676175/1‑150 (MQ=255) gACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAAc > 1:4073936/1‑150 (MQ=255) ccGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTg > 2:2173541/1‑150 (MQ=255) cGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGc > 1:1444106/1‑150 (MQ=255) cGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGc < 1:1417255/150‑1 (MQ=255) cGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGc > 1:1124924/1‑150 (MQ=255) gCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCg < 1:1852040/150‑1 (MQ=255) gCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCg < 2:1462556/150‑1 (MQ=255) gCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCg > 1:2494927/1‑150 (MQ=255) cACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCgg < 1:2095548/150‑1 (MQ=255) tATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGaa < 2:2977794/150‑1 (MQ=255) tGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGt < 2:1805232/150‑1 (MQ=255) atGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCACCTGCGGGAAGTCGCa > 1:3150576/1‑150 (MQ=255) tACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCg > 1:367362/1‑150 (MQ=255) tACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGAGGGAAGTCGCAGCg > 2:1868573/1‑150 (MQ=255) gTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACt > 1:69081/1‑150 (MQ=255) gTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACt < 1:2685939/150‑1 (MQ=255) tgctgaACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTGATCAACACGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTgg < 1:3779936/147‑1 (MQ=255) tgatgaACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTgg < 1:2573837/150‑1 (MQ=255) atgaACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGAt > 1:1049608/1‑150 (MQ=255) atgaACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGAt < 2:406867/150‑1 (MQ=255) gaACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCTGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGAttt < 2:442301/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGc < 1:1407532/150‑1 (MQ=255) ggTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCaa < 1:200300/150‑1 (MQ=255) tGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATg < 2:1857171/150‑1 (MQ=255) ggACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCACTGt > 2:1476815/1‑150 (MQ=255) aCGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTg > 1:2141858/1‑150 (MQ=255) cGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGc > 2:1335800/1‑150 (MQ=255) gATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCt > 2:1125443/1‑150 (MQ=255) tACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCg < 1:2581428/150‑1 (MQ=255) aacaGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaag > 1:260991/1‑150 (MQ=255) aacaGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaag < 2:84227/150‑1 (MQ=255) aacaGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaag < 1:1590622/150‑1 (MQ=255) aacaGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGAGTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaag > 1:1922339/1‑150 (MQ=255) acaGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaaga < 2:1562952/150‑1 (MQ=255) acaGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaaga > 1:2991038/1‑150 (MQ=255) gACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGac > 2:3312753/1‑150 (MQ=255) aCTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGaca < 2:2351202/150‑1 (MQ=255) cccGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACgct > 1:936647/1‑150 (MQ=255) gcagcaGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTa > 1:2242922/1‑150 (MQ=255) cagctgAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTAc < 1:3309475/150‑1 (MQ=255) cagcagAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACgctgctcc > 2:92954/1‑148 (MQ=255) agAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTACAAtt < 1:3902058/150‑1 (MQ=255) | TGTGCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTACAATT > CP009273/4372743‑4373040 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |