Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,593,513 | T→G | 48.8% | Y74D (TAT→GAT) | yjjQ → | putative transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,593,513 | 0 | T | G | 48.8% | 73.4 / inf | 240 | Y74D (TAT→GAT) | yjjQ | putative transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/70); new base G (73/44); total (126/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.03e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
AGGTCATGAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAGACCGTACGT > CP009273/4593364‑4593662 | gTCATGAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACattatgat < 1:1018632/150‑1 (MQ=255) gTCATGAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACattatgat < 2:1242006/150‑1 (MQ=255) aTGAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCt < 2:2219815/150‑1 (MQ=255) aTGAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCt < 2:3892055/150‑1 (MQ=255) tGAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCtt < 1:79185/150‑1 (MQ=255) gAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCttt < 2:2897295/150‑1 (MQ=255) gAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCttt > 2:1429471/1‑150 (MQ=255) gAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCttt < 1:1884269/150‑1 (MQ=255) aCTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAAtc < 2:1687096/150‑1 (MQ=255) aCTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAAta > 2:3269834/1‑149 (MQ=255) tCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAAtctc < 2:61178/150‑1 (MQ=255) tCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAAtctc > 1:1638313/1‑150 (MQ=255) aCTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTcac > 1:2050100/1‑150 (MQ=255) aCTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACATTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTcac < 2:251881/150‑1 (MQ=255) ttCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACaa > 1:1009821/1‑150 (MQ=255) tCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTCTTCTTTAATCTCACAat > 2:1601281/1‑150 (MQ=255) tCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAat > 1:414786/1‑150 (MQ=255) tCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAat > 1:2839714/1‑150 (MQ=255) tCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAat < 1:1627547/150‑1 (MQ=255) ccTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAatat < 1:1070644/150‑1 (MQ=255) ccTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAatat < 1:1551791/150‑1 (MQ=255) gAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCgg > 2:3689416/1‑150 (MQ=255) atatGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGa < 2:3151272/150‑1 (MQ=255) atGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGaaa > 2:3355431/1‑150 (MQ=255) tGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAAt < 2:3602486/150‑1 (MQ=255) gAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAAtt < 1:2260382/150‑1 (MQ=255) taataTCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACt < 1:2206015/150‑1 (MQ=255) taataTCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACt < 1:1306600/150‑1 (MQ=255) atatCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTgg > 1:1554314/1‑150 (MQ=255) tatCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTggg < 1:1399403/150‑1 (MQ=255) atCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGt > 2:3087591/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGtt < 1:489120/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGtttt < 2:1007932/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGtttt > 1:3911914/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTc > 2:432478/1‑150 (MQ=255) ctctGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGgt > 2:2824566/1‑150 (MQ=255) tctGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGgtg > 1:3618810/1‑150 (MQ=255) tGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTc < 1:397234/150‑1 (MQ=255) cGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCAc < 2:2577662/150‑1 (MQ=255) cGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCAc < 2:3249263/150‑1 (MQ=255) ggaggaCCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACg > 1:1188929/1‑150 (MQ=255) gaggaCCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGc > 1:409101/1‑150 (MQ=255) accttaccttATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCt > 1:3477965/1‑150 (MQ=255) ccttaccttaTTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTg < 2:2345585/150‑1 (MQ=255) cttaccttaTTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTgg < 1:1728902/150‑1 (MQ=255) cttaccttaTTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTgg < 1:2711374/150‑1 (MQ=255) ttaccttaTTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGt > 1:765211/1‑150 (MQ=255) taccttaTTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTa > 2:343476/1‑150 (MQ=255) ccttaTTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTAtt > 2:1894547/1‑150 (MQ=255) ttaCAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAg > 2:1509145/1‑150 (MQ=255) ttaCAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAg < 1:3715916/150‑1 (MQ=255) aaTTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAg > 2:41488/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGaa < 1:46238/150‑1 (MQ=255) gtcgtTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAAc > 1:1953089/1‑150 (MQ=255) tcgtTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACt < 1:920038/150‑1 (MQ=255) gtTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGc > 2:1841483/1‑150 (MQ=255) gtTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGc > 1:450127/1‑150 (MQ=255) cGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCAt > 1:2630297/1‑150 (MQ=255) gATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCAtgt < 2:3520567/150‑1 (MQ=255) gATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCAtgt > 2:861509/1‑150 (MQ=255) ttAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGc < 1:3078772/150‑1 (MQ=255) tAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGcc > 1:1714689/1‑150 (MQ=255) gTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCt > 1:1834012/1‑150 (MQ=255) tCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTa < 2:672405/150‑1 (MQ=255) tCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTa > 1:261833/1‑150 (MQ=255) cATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTAc > 1:3393899/1‑150 (MQ=255) cATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTAc < 1:99588/150‑1 (MQ=255) aTTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACg > 2:2075862/1‑150 (MQ=255) tGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGc < 1:12590/150‑1 (MQ=255) tGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGc < 1:2481277/150‑1 (MQ=255) tGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGAc > 1:2082739/1‑150 (MQ=255) tGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGAc < 1:2318268/150‑1 (MQ=255) tGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTATGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGAc > 1:835661/1‑150 (MQ=255) gATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACg > 2:4009677/1‑150 (MQ=255) tAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTAt < 1:2914135/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTACCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTAtt < 1:2501184/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTc > 2:3792644/1‑150 (MQ=255) ggTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCt > 1:3016630/1‑150 (MQ=255) gTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTg < 1:1244982/150‑1 (MQ=255) gAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGAt < 2:2839714/150‑1 (MQ=255) aaGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGt > 2:2927063/1‑150 (MQ=255) aGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGtt > 1:402795/1‑150 (MQ=255) gTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTg > 2:349946/1‑150 (MQ=255) tGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGa < 1:3531070/150‑1 (MQ=255) gATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAAccc > 1:1919658/1‑150 (MQ=255) aTCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCa > 1:3320127/1‑150 (MQ=255) tCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCAt < 2:457576/150‑1 (MQ=255) cACGTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTg > 1:1951287/1‑150 (MQ=255) gTTCTGTTTGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTgaga > 1:3941271/1‑150 (MQ=255) tCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAAt < 2:1211001/150‑1 (MQ=255) tGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCt < 1:2281777/150‑1 (MQ=255) tGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCt < 1:2475637/150‑1 (MQ=255) ttGTGAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGt < 2:2183606/150‑1 (MQ=255) gAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAg < 1:3183347/150‑1 (MQ=255) gAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAg > 1:1281349/1‑150 (MQ=255) gAACATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAg > 2:3752921/1‑150 (MQ=255) aCATTATGATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGATCCCATTGAGAATCTGGTCAAGAc > 2:3072320/1‑150 (MQ=255) ttattattCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAGACCGt < 2:693824/150‑1 (MQ=255) attattCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAGACCGTAc < 1:1494638/150‑1 (MQ=255) tattCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAGACCGTACGt > 2:2474764/1‑150 (MQ=255) | AGGTCATGAGGACTCACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATTACGTCGTTCCGGATTAGTCATTGCTGATTTAGCCGGTGAAAGTGAAGATCCACGTTCTGTTTGTGAACATTATTATTCTTTAATCTCACAATATCGGGAAATTCACTGGGTTTTCATGGTGTCACGCTCCTGGTATTCCCAGGCAGTAGAACTGCTCATGTGCCCTACGGCGACGTTATTGTCTGATGTTGAACCCATTGAGAATCTGGTCAAGACCGTACGT > CP009273/4593364‑4593662 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |