Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 500,613 | G→T | 7.7% | G82C (GGT→TGT) | ushA → | bifunctional UDP‑sugar hydrolase/5'‑nucleotidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 500,613 | 0 | G | T | 7.7% | 938.7 / 35.0 | 245 | G82C (GGT→TGT) | ushA | bifunctional UDP‑sugar hydrolase/5'‑nucleotidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (128/98); new base T (10/9); total (138/107) | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
ACAAAATTACAGTTCTGCATACCAATGATCATCATGGGCATTTTTGGCGCAATGAATATGGCGAATATGGTCTGGCGGCGCAAAAAACGCTGGTGGATGGTATCCGCAAAGAGGTTGCGGCTGAAGGCGGTAGCGTGCTGCTACTTTCCGGTGGCGACATTAACACTGGCGTGCCCGAGTCTGACTTACAGGATGCCGAACCTGATTTTCGCGGTATGAATCTGGTGGGCTATGACGCGATGGCGATCGGTAATCATGAATTTGATAATCCGCTCACCGTATTACGCCAGCAGGAAAAG > CP009273/500464‑500762 | tcAAAATTACAGTTCTGCATACCAATGATCATCATGGGCATTTTTGGCGCAATGAATATGGCGAATATGGTCTGGCGGCGCAAAAAACGCTGGTGGATGGTATCCGCAATGAGGTTGCGGCTGAAGGCTGTAGCGTGCTGCTACTTTCCg < 1:1360486/149‑1 (MQ=255) aCAAAATTACAGTTCTGCATACCAATGATCATCATTGGCATTTTTGGCGCAATGAATATGGCGAATATGGTCTGGCGGCGCAAAAAACGCTGGTGGATGGTATCCGCAAAGAGGTTGCGGCTGAAGGCGGTAGCGTGCTGCTACTTTCCg > 2:1642980/1‑150 (MQ=255) aCAAAATTACAGTTCTGCATACCAATGATCATCATGGGCATTTTTGGCGCAATGAATATGGCGAATATGGTCTGGCGGCGCAAAAAACGCTGGTGGATGGTATCCGCAAAGAGGTTGCGGCTGAAGGCGGTAGCGTGCTGCTACTTTCCg < 1:1023904/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |