| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 566,710 | G→T | 43.1% | G121V (GGC→GTC) | ybcL → | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 566,710 | 0 | G | T | 43.1% | 226.2 / 289.1 | 232 | G121V (GGC→GTC) | ybcL | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/78); new base T (55/45); total (109/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.48e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
ATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATA > CP009273/566563‑566856 | atGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCt < 1:735463/150‑1 (MQ=255) cACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTtg > 2:482628/1‑150 (MQ=255) aGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgcgc > 2:1600089/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtc > 1:3354744/1‑150 (MQ=255) gttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcctc < 1:3976888/150‑1 (MQ=255) ttggtGGCATTGGACTGTTGTTGATATTCCAGCAACATTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcctcc > 1:2886663/1‑150 (MQ=255) ttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcctcc > 1:284080/1‑150 (MQ=255) tggtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTcctcct > 2:2931103/1‑150 (MQ=255) tggtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTcctcct < 1:1952063/150‑1 (MQ=255) ggtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCATCCTa < 1:3873928/150‑1 (MQ=255) gtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTaa > 1:3242504/1‑150 (MQ=255) tggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTaaa > 1:3654285/1‑150 (MQ=255) tggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTaaa < 1:1376716/150‑1 (MQ=255) ggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAg > 1:1609094/1‑150 (MQ=255) ggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAg > 1:2745835/1‑150 (MQ=255) ttGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGgaga > 1:3222276/1‑150 (MQ=255) ttGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGgaga > 1:3104304/1‑150 (MQ=255) ttGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGgaga > 2:2051584/1‑150 (MQ=255) tGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGAt < 1:304898/150‑1 (MQ=255) gACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATaa < 1:543529/150‑1 (MQ=255) ttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACcac > 1:3748438/1‑150 (MQ=255) tgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACcaca > 1:2251542/1‑150 (MQ=255) tgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACcaca > 2:877932/1‑150 (MQ=255) ttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatc > 1:661631/1‑150 (MQ=255) ttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatc < 1:2279072/150‑1 (MQ=255) tAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatca < 2:3097427/150‑1 (MQ=255) tAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatca < 1:3932723/150‑1 (MQ=255) aaTATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatcat > 2:3408437/1‑150 (MQ=255) atatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCAtt < 1:1253102/150‑1 (MQ=255) tatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGGTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTa > 2:1846871/1‑150 (MQ=255) atTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAc < 1:1107764/150‑1 (MQ=255) cAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGt > 2:2331128/1‑150 (MQ=255) aaatccAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGtt > 2:2764598/6‑150 (MQ=255) gCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGttt < 2:1098843/150‑1 (MQ=255) cAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTa < 2:3561330/150‑1 (MQ=255) aaCAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTaa > 2:2012281/1‑150 (MQ=255) aaCAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTaa > 1:4118928/1‑150 (MQ=255) cAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAg > 1:2135008/1‑150 (MQ=255) gTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTTAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTa > 2:4012248/1‑150 (MQ=255) gTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTa > 2:1523243/1‑150 (MQ=255) aaCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATg > 1:4171773/1‑150 (MQ=255) aCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATgg > 2:4034842/1‑150 (MQ=255) aCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATgg > 2:103007/1‑150 (MQ=255) aCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATgg < 1:2656739/150‑1 (MQ=255) aCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATgg < 1:2315928/150‑1 (MQ=255) atatTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGc > 2:797078/1‑150 (MQ=255) atTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGctc > 2:2209483/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGctct < 2:318552/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTa > 2:332682/1‑150 (MQ=255) tGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTaa < 1:1638863/150‑1 (MQ=255) ccGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTaaaaa < 1:2443800/150‑1 (MQ=255) cGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAAc > 1:2572867/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACt < 1:845709/150‑1 (MQ=255) gTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACt < 2:725337/150‑1 (MQ=255) gATGCTGGGAGTCGTGTTGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCATGGCCGAAATGTTTTTTTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTACTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGaa < 1:3420191/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGaaaa < 1:3625109/150‑1 (MQ=255) gCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAg < 2:3231663/150‑1 (MQ=255) aGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAt > 1:4007863/1‑150 (MQ=255) gggAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAtt > 1:455566/1‑150 (MQ=255) gggAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAtt < 2:2748868/150‑1 (MQ=255) agaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCt < 2:889625/150‑1 (MQ=255) gaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGTGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTg > 1:3499478/1‑150 (MQ=255) gaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTg > 1:145398/1‑150 (MQ=255) gaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTg < 1:1041929/150‑1 (MQ=255) cGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTa < 2:2435791/150‑1 (MQ=255) gTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAg < 2:3582738/150‑1 (MQ=255) tGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGa > 2:561266/1‑150 (MQ=255) aTGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGAtt < 2:2510355/150‑1 (MQ=255) tGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTc < 1:826034/150‑1 (MQ=255) ggAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCt < 2:3280959/150‑1 (MQ=255) gAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTa < 1:1105354/150‑1 (MQ=255) aaCTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCa < 2:2083145/150‑1 (MQ=255) cTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAATTGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGc < 2:3623282/150‑1 (MQ=255) cTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGc < 2:4088776/150‑1 (MQ=255) tGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCg < 1:1807931/150‑1 (MQ=255) gCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCgg < 1:2628494/150‑1 (MQ=255) ccGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGa < 2:3136167/150‑1 (MQ=255) aCTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCg < 2:2626997/150‑1 (MQ=255) aCTGGTGCTGTTCAAGGCAGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCg < 1:1212146/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGtt < 1:3649223/150‑1 (MQ=255) gCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGtt > 2:68838/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTg < 1:1171614/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTta > 1:94319/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTtat > 2:515445/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTtat < 2:3875538/150‑1 (MQ=255) aGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTatat < 1:3530291/150‑1 (MQ=255) aGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTatat < 1:2867376/150‑1 (MQ=255) aGGCCGAAATGAATTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTatat < 1:2051662/150‑1 (MQ=255) ggCCGACATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATg < 1:1777292/150‑1 (MQ=255) ggCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATg > 2:726607/1‑150 (MQ=255) gCCGAAATTCTTTTGTCTATGCTTGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCTGAGCGTTAGTTGGTTATATGc < 2:3717777/150‑1 (MQ=255) gCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGc < 1:658256/150‑1 (MQ=255) gCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGc < 2:157139/150‑1 (MQ=255) ccGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCt < 2:1773159/150‑1 (MQ=255) aaaTGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTaa > 2:3543511/1‑150 (MQ=255) aaaTGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGAATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTaa > 1:217141/1‑150 (MQ=255) aTGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATg < 2:1736623/150‑1 (MQ=255) tGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGc > 2:1442991/1‑150 (MQ=255) gATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCt < 2:1326677/150‑1 (MQ=255) gATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCt > 2:2139444/1‑150 (MQ=255) | ATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATA > CP009273/566563‑566856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |