| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 632,286 | C→A | 50.5% | E263D (GAG→GAT) | ybdO ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 632,286 | 0 | C | A | 50.5% | 77.5 / inf | 212 | E263D (GAG→GAT) | ybdO | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/58); new base A (48/59); total (95/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
AGATGAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTAT > CP009273/632137‑632432 | aGATGAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTAtc > 2:1533907/1‑150 (MQ=255)aGATGAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTAtc > 2:1534035/1‑150 (MQ=255) tGAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATctct < 2:1079541/150‑1 (MQ=255) gAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCtt < 2:3774556/150‑1 (MQ=255) gAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCtt < 1:2926392/150‑1 (MQ=255) aaaGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCttt < 2:3238436/150‑1 (MQ=255) ataGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTttaagtt < 1:1693212/150‑1 (MQ=255) tagCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAGGa > 1:2191364/1‑150 (MQ=255) ctgtctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAg < 1:773162/150‑1 (MQ=255) ctgtctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAg < 1:2585055/150‑1 (MQ=255) ctgtctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAg < 2:2065765/150‑1 (MQ=255) tgtctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGt < 2:3867890/150‑1 (MQ=255) tgtctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGt > 1:3877823/1‑150 (MQ=255) tgtctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGt > 1:1136616/1‑150 (MQ=255) tctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCa > 1:1093242/1‑150 (MQ=255) ctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCAc < 2:1150922/150‑1 (MQ=255) ctgtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCAc < 2:1850464/150‑1 (MQ=255) gtAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACgg < 1:3229012/150‑1 (MQ=255) aGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTa < 1:225971/150‑1 (MQ=255) gTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAg > 1:1003790/1‑150 (MQ=255) tatatCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAAt < 2:2327303/150‑1 (MQ=255) atCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATtat > 1:3485828/1‑150 (MQ=255) atCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATtat > 1:3279442/1‑150 (MQ=255) tCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATtata > 2:2445465/1‑150 (MQ=255) cAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATaa < 2:3394101/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTCTCATTTAGACGTTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATATGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACTGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATaaa < 2:1566674/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATaaa < 2:1566959/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATaaa > 1:4003256/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATaaa < 2:1676214/150‑1 (MQ=255) aaaaCTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAg < 1:2445251/150‑1 (MQ=255) aCTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTc > 2:1824026/1‑150 (MQ=255) cATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAgg < 2:807852/150‑1 (MQ=255) cATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAgg < 2:2182337/150‑1 (MQ=255) aTTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAggg > 2:310271/1‑150 (MQ=255) aCGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTAt < 2:2966903/150‑1 (MQ=255) cGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTAtt < 2:1695019/150‑1 (MQ=255) ggTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTc < 1:1027564/150‑1 (MQ=255) cAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCa < 2:1419383/150‑1 (MQ=255) aaTAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAg < 1:1411284/150‑1 (MQ=255) aaTAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAg > 1:3216701/1‑150 (MQ=255) tAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTa > 1:143603/1‑150 (MQ=255) tAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTa < 1:1812848/150‑1 (MQ=255) aaaTCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTaa > 1:2328703/1‑150 (MQ=255) cGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCt > 1:950728/1‑150 (MQ=255) cGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCt > 1:864080/1‑150 (MQ=255) cGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCt < 1:3749245/150‑1 (MQ=255) cGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCt < 1:1284840/150‑1 (MQ=255) ggAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGt > 2:65076/1‑150 (MQ=255) ggAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGt > 1:3359766/1‑150 (MQ=255) ggAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGt > 1:549189/1‑150 (MQ=255) gagaACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTa < 2:1334453/150‑1 (MQ=255) gagaACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTa < 2:1334471/150‑1 (MQ=255) gaACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAAc > 1:2763522/1‑150 (MQ=255) aaCACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACt > 2:2707810/1‑150 (MQ=255) aaCACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACt > 2:521854/1‑150 (MQ=255) acacCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTg < 2:558848/150‑1 (MQ=255) acacCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTg > 1:4131045/1‑150 (MQ=255) acCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCa < 1:919057/150‑1 (MQ=255) cAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAAt < 1:2549063/150‑1 (MQ=255) cAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAAt > 2:1433875/1‑150 (MQ=255) cAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAAt < 1:2676060/150‑1 (MQ=255) aaTTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGc > 1:1857687/1‑150 (MQ=255) ttattTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAATCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTa < 1:2528239/150‑1 (MQ=255) tattTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTAt < 2:3573079/150‑1 (MQ=255) tattTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTAt < 2:3062067/150‑1 (MQ=255) attTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTAtt < 2:331645/150‑1 (MQ=255) attTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTAtt < 1:770131/150‑1 (MQ=255) attTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTAtt < 2:428762/150‑1 (MQ=255) tAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAAt > 2:3168189/1‑150 (MQ=255) agaagaTTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGACTTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGAt > 1:63118/1‑150 (MQ=255) agaTTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGt < 1:512237/150‑1 (MQ=255) gaTTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTc < 2:290392/150‑1 (MQ=255) aTTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCa > 1:1773600/1‑150 (MQ=255) tttATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAg > 1:2633641/1‑150 (MQ=255) tttATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAg < 1:1587600/150‑1 (MQ=255) ttatAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTATGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATTCTATTAATGATTGTCAGCaaa > 2:2046430/1‑150 (MQ=255) ttatAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCaaa > 1:1529665/1‑150 (MQ=255) tataGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAag > 1:3507467/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAgg < 1:3823968/150‑1 (MQ=255) aaaTGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAAc > 2:2511291/1‑150 (MQ=255) aaTGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAAcc < 2:3505962/150‑1 (MQ=255) aTGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCa < 2:3987096/150‑1 (MQ=255) gTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACg < 1:3694476/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGa > 1:717341/1‑150 (MQ=255) aaaGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGaa > 2:3088642/1‑150 (MQ=255) cTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATga > 2:1099093/1‑150 (MQ=255) tATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGAt > 2:2264095/1‑150 (MQ=255) tGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGAtttt < 1:1933023/150‑1 (MQ=255) gAAGGTAACGGATATTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTg < 2:4103225/150‑1 (MQ=255) aaGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGc < 2:3693815/150‑1 (MQ=255) tAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGAtt > 1:4172968/1‑150 (MQ=255) tAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGAtt > 2:752490/1‑150 (MQ=255) tAACGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGAtt > 2:1790147/1‑150 (MQ=255) cGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTGATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCAt < 2:3708054/150‑1 (MQ=255) cGGATGTTCTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCAt < 2:3708235/150‑1 (MQ=255) aTGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATaaa < 1:3691429/150‑1 (MQ=255) tGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAAt < 1:295790/150‑1 (MQ=255) cTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAAtctct > 1:3009925/1‑150 (MQ=255) cTAGTTTTATATCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAAtctct < 1:3093580/150‑1 (MQ=255) tataTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTAt < 2:4003256/150‑1 (MQ=255) | AGATGAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTAT > CP009273/632137‑632432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |