Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 651,666 | 0 | G | A | 8.0% | 868.2 / 44.0 | 249 | intergenic (‑242/‑347) | dcuC/pagP | anaerobic C4‑dicarboxylate transport/phospholipid:lipid A palmitoyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (107/122); new base A (6/14); total (113/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.67e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
ATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAAAAAAGACTTGGT > CP009273/651517‑651815 | aaaTCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAg < 2:1021359/150‑1 (MQ=255) aaaTCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAg > 2:1252760/1‑150 (MQ=255) tCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTg < 1:2159793/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |